7. Если у Вас положительный результат ПЦР-исследования на новую коронавирусную инфекцию необходимо оставаться дома, отказаться от посещения общественных мест. Полимеразная цепная реакция: описание метода диагностики, показания, преимущества, подготовка, сроки, стоимость. Пройдите ПЦР в клинике ПрофМедЛаб.
Сколько можно болеть: почему даже спустя месяц ПЦР-тест на ковид остается положительным
Можно ли брать анализ у себя самого и отправлять в лабораторию? Расставить все по полочкам мы попросили заведующего лабораторией редактирования генома Национального медицинского исследовательского центра им. Фото: АГН «Москва» — Денис Владимирович, сориентируйте, пожалуйста, наших читателей в многообразии имеющихся диагностических тестов. Но суть теста от этого не меняется, это обычная ДНК-диагностика.
В подавляющем большинстве случаев она основана на методе ПЦР — полимеразной цепной реакции. Это самый надежный метод ДНК-диагностики, золотой стандарт определения вирусных инфекций. В среднем исследование занимает 3-4 часа.
Но поскольку надо доставить образец в лабораторию, зарегистрировать его и пр. Как правило лаборатории заявляют, что выполнят тест от 8 часов до 2-3 дней. Если некоторые лаборатории заявляют, что «Результат будет сегодня», а другие обещают это только через 3 дня, это связано не с продолжительностью собственно анализа, а с логистикой обработки биоматериала.
Более-менее все они одинаковы по своей чувствительности и специфичности. Хотя самые первые тесты, рекомендованные к применению в феврале, отличались немного пониженной чувствительностью.
Бедняга Муллис и его последователи сначала использовали тупо три водяных бани с разной температурой, вручную перемещая из одной в другую ценные пробирки с реакцией. Мы на практике в универе почему-то делали так же... Но как только мир понял, что ПЦР - это офигенно, сразу появились лабораторные приборы, которые этот процесс автоматизируют. Фактически это просто нагревательный блок, способный очень точно держать температуру в течение заданного времени и быстро его менять. Сейчас их на рынке пруд пруди, на любой вкус и цвет, чуть ли не кофе умеют готовить. Но как нам это все помогает при анализах на вирус?
Вот такой милаха прогонит ПЦР за полчасика Медицинское применение. Причем ее может быть изначально очень мало, но цепной характер реакции позволит нам ее приумножить. Но если изначально целевой ДНК в пробе нет, то и реакция не пройдет. Добавляем полимеразу и праймеры, которые сядут именно и только на определенное место в ДНК какого-то интересующего нас патогена ДНК патогена ведь сильно отличается от нашей. Запускаем реакцию и смотрим, прошла она или нет! Если прошла - значит, пациент был заражен этим патогеном, а на нет и суда нет. Получился очень точный, быстрый и относительно дешевый метод выявления патогенов - прикиньте, раньше пока анализ на какую-нибудь бактерию высеешь на питательную среду, дождешься, чтобы оно подросло, определишь, что выросло - несколько дней пройдет. А тут готовый результат за пару часов!
Осталось только подобрать такие праймеры, чтобы они садились "отжигались" действительно только на ДНК патогена, а не на человеческую ДНК. Этот трудоемкий процесс и называется созданием тест-системы - наверняка слышали такое словосочетание в новостях! Этим занимаются, как правило, крупные компании, вкладывающие в этот процесс большие деньги и время. Но тут что хорошо - один раз подобрал такие праймеры - и все, дальше любой лаборант с минимальным опытом сможет провести сам анализ. Дальнейшее развитие ПЦР пошло по пути ответа на вопрос "прошла реакция или нет? Логичным ответом на него стала ПЦР в реальном времени англ.
Возможность проведения анализа сразу на несколько возбудителей из одного образца биоматериала, что делает метод удобным для пациента — не нужно несколько раз сдавать анализ. Не нужно выделять и выращивать возбудителя на питательных средах, как это делается при бактериологическом исследовании. Результат может быть готов уже в день сдачи анализа. С помощью ПЦР выявляют возбудителей латентных заболеваний, когда возбудитель в организме есть, но он еще не вызвал заболевание, или когда пациент является носителем инфекции гепатита или ВИЧ.
Низкая стоимость. Цена анализа ПЦР на одного возбудителя составляет 250-500 рублей. Чуть дороже стоит полуколичественный анализ на вирусы — около 1000 рублей. Недостатки анализа ПЦР является высокотехнологичным методом исследованием и предъявляет высокие требования к оснащению лаборатории.
У таких людей могут быть отрицательные результаты тестов на наличие коронавируса, однако потом появляются антитела. Жемчугов выразил уверенность, что их также надо учитывать в составе иммунной прослойки. В связи с этим иммунолог поддержал решение Минздрава РФ, согласно которому граждане с 21 февраля смогут получить сертификат при наличии антител к коронавирусу. Ранее в четверг в федеральном оперативном штабе по борьбе с коронавирусом сообщили, что диагноз COVID-19 специалисты теперь смогут поставить по результатам экспресс-теста. Подтверждать его результат ПЦР-тестом больше не нужно.
Специфическая
- Что такое ПЦР, и с чем её едят | Пикабу
- Как определить коронавирус или что такое метод полимеразной цепной реакции (ПЦР)?
- Как определить коронавирус или что такое анализ ПЦР?
- ПЦР-диагностика
- Какие инфекции определяются с помощью ПЦР?
Что такое ПЦР? О методе полимеразной цепной реакции
Неправильный выбор температуры отжига приводит либо к плохому связыванию праймеров с матрицей при завышенной температуре , либо к связыванию в неверном месте и появлению неспецифических продуктов при заниженной температуре. Время стадии отжига — 30 секунд [ источник не указан 800 дней ], одновременно, за это время полимераза уже успевает синтезировать несколько сотен нуклеотидов. Элонгация править ДНК-полимераза реплицирует матричную цепь, используя праймер в качестве затравки. Это — стадия элонгации.
Температура элонгации зависит от полимеразы. Время элонгации зависит как от типа ДНК-полимеразы, так и от длины амплифицируемого фрагмента. Обычно время элонгации принимают равным одной минуте на каждую тысячу пар оснований.
После окончания всех циклов часто проводят дополнительную стадию финальной элонгации, чтобы достроить все одноцепочечные фрагменты. Эта стадия длится 7—10 минут. Количество специфического продукта реакции ограниченного праймерами теоретически возрастает пропорционально 2n — 2n, где n — число циклов реакции [15].
Число «длинных» копий ДНК тоже растёт, но линейно, поэтому в продуктах реакции доминирует специфический фрагмент. Рост требуемого продукта в геометрической прогрессии ограничен количеством реагентов, присутствием ингибиторов , образованием побочных продуктов. На последних циклах реакции рост замедляется, это называют «эффектом плато».
Время получения данных анализа составляет от нескольких часов до трех суток в зависимости от лаборатории. Идеальным можно считать вариант, когда от момента первичного обращения к врачу до интерпретации проб проходит не более суток в клиниках, оснащенных современными лабораториями. Однако и она не исключает ложноположительных или ложно отрицательных ответов.
В основном это связано с погрешностями при заборе лабораторного материала. Нельзя утверждать, что кровь может быть универсальным материалом для установки диагноза. В идеале должна забираться биологическая проба из предполагаемого места воспаления.
Так, для половых инфекций более актуальным будет исследование соскоба эпителия урогенитального тракта. Ошибки могут скрываться и на этапе обработки исследуемого материала и быть технической погрешностью работы персонала. Таким образом, все достоинства метода нуклеарного поиска инфекции способны раскрыться при использовании качественных реактивов и аппаратуры высоко квалифицированным персоналом.
Если вам необходимо сдать анализы на ПЦР исследования, обращайтесь к грамотным венерологам.
Сегодня это наиболее достоверный диагностический метод. Риск получения ошибочного результата Вероятность получения ложноположительного результата невелика. Вирус может попасть в биоматериал пациента извне при условии нарушения санитарных правил. Поэтому проходить обследование лучше в надежных лабораториях, где подобное исключено. Ложноотрицательные результаты встречаются чаще. Во избежание их получения перед забором биоматериала нельзя курить и дезинфицировать носоглотку антисептиками. Исказить клиническую картину также могут: ошибки медработника при взятии мазка; забор материала на поздней стадии, когда концентрация вируса минимальна; отсутствие микроорганизмов в носоглотке. Последнее возможно, если коронавируса там не было изначально попал в организм иным путем, например, через кровь. Бывает, что в носоглотке возбудитель не оседает, а сразу продвигается в легкие и выявляется только на компьютерной томографии.
Экспресс-тест на коронавирус Экспресс-тест можно сделать в домашних условиях. Он не предполагает лабораторных исследований, не требует специального оборудования. Достаточно купить набор в аптеке. Например, к Standard Q Covid-19 прилагается подробная инструкция. Для проведения экспресс-теста на коронавирус понадобятся: стерильный тампон человек берет у себя мазок сам ; одноразовая кассета в индивидуальной упаковке; пробирка с реактивом; насадка с капельницей. При наличии инфекции в организме контакт биоматериала с реактивом приводит к окрашиванию контрольной полоски. Результат появляется через 20-30 минут. Наибольшую точность тест показывает в первую неделю после заражения. В дальнейшем повышается вероятность получения ложноотрицательного результата. Для уточнения диагноза лучше сделать ПЦР-тест.
Анализ на антитела к коронавирусу Анализ на антитела к коронавирусу показывает не присутствие инфекции в организме, а ответ иммунной системы на нее. В ответ на заражение она вырабатывает несколько типов иммуноглобулинов: IgA являются реакцией непосредственно на коронавирус; IgM синтезируются при наличии инфекции в организме указывают на острое течение заболевания ; IgG появляются, когда тело «запоминает» вирус и формирует иммунитет к нему. Недостаточно, чтобы антитела были просто выявлены.
Это значит, что положительный анализ ПЦР приходит даже при малых концентрациях возбудителя в крови. Поэтому он имеет высокую точность диагностирования заболевания и может применяться на ранних стадиях. Что означает ПЦР положительный анализ? Если при проведении метода полимеразной цепной реакции выявляется ДНК искомого организма, такой анализ ЦПР является положительным. Данный результат показывает, что в организме в текущее время присутствует возбудитель. Хоть эти методы и направлены на одни и те же цели, механизм действия у них отличается: ПЦР показывает наличие элементов ДНК или РНК возбудителя в биологическом материале.
Для ПЦР чаще используется материал из предполагаемого очага инфекции. ИФА или анализ на антитела позволяет идентифицировать реакцию антиген-антитело. Иммуноферментный анализ используется для уточнения стадии заболевания.
Что такое анализ ПЦР?
Поэтому Корейский центр по управлению и контролю за болезнями больше не требует изоляции в таких случаях. В общей популяции пациенты у которых была коронавирусная инфекция в течение 10-14 дней, вероятно, больше не представляют опасность для окружающих. Однако это правило может не распространяться на все категории пациентов, в частности, иммунокомпрометированных пациентов или тяжело больных пациентов, находящихся в больнице. Ann Intern Med. Troy Brown, RN. May 2020.
Если результат положительный — его повторяют, и только в случае двойного положительного результата пациенту сообщают о болезни. Анна Солдатова.
Со специфическим фрагментом генома вируса с продуктами реакции , связывается флюоресцентная метка — своеобразный маркер, который мы можем определить и измерить, поймав оптико-флюоресцентный сигнал. Существуют различные модификации этого метода, но цель их одна — поиск специфических участков генома вируса, присутствие которых позволяет сделать вывод, что в данном биоматериале вирус есть. Все — и азиатские врачи, и европейцы, и американцы, и мы в России и в Израиле — все работают этим методом.
Отрицательный и ложноотрицательный результат Однако, отрицательный результат ПЦР-анализа, к сожалению, не говорит об обратном, не исключает наличие вируса в организме. Мы можем только говорить, что вирус не обнаружен. Не обнаружен в исследуемом биоматериале, которым чаще всего является мазок из рото- или носоглотки.
Почему так происходит? Потому что вирус совсем недолго находится на слизистой верхних дыхательных путей, спускаясь в бронхи и лёгкие — мишень поражения. Поэтому лучше искать его ниже — в мокроте, выделяемой при кашле, и смывах из нижних дыхательных путей бронхоальвеолярный лаваж.
Участки генома вируса способны связываться с гемом, нарушая функцию гемоглобина в эритроцитах. Это мешает транспортировке кислорода клетками крови и именно гипоксия недостаток кислорода негативно влияет на лёгкие. Влияние вируса на кровь подталкивает к мысли, что именно в ней мы можем найти SARS-Cov-2 в тяжёлых клинических случаях, хотя не обнаруживаем его на слизистых верхних дыхательных путей.
Мы должны научиться выделять вирус из крови.
Количественные результаты оцениваются непосредственно врачом, поскольку этот показатель индивидуален. Ещё одно достоинство метода — он обнаруживает даже мизерное количество вирусов и бактерий и, соответственно, распознаёт болезнь, когда видимых клинических проявлений ещё нет. Благодаря этому лечение начинается на первичной стадии, задолго до того как появляются разного рода осложнения. ПЦР более объективен, чем многие другие иммунологические способы диагностики, поскольку практически не даёт ложно-положительных ложно-отрицательные значительно более редки ввиду высокой чувствительности метода.
Результаты ПЦР диагностики
По его мнению, у многих пациентов положительный тест ПЦР сохраняется на месяцы, при этом люди не являются ни больными, ни заразными. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – это метод молекулярно-генетической диагностики, позволяющий обнаружить в организме человека различные инфекционные заболевания. Тест на полимеразную цепную реакцию (ПЦР) на COVID-19 – это молекулярный тест, который анализирует ваш образец верхних дыхательных путей в поисках генетического материала SARS-CoV-2. ПЦР (полимеразная цепная реакция) представляет собой метод выявления присутствующего в организме вируса – у человека для этого берутся мазки из носа, ротоглотки. Если у человека положительный ПЦР-тест, первое, что он должен сделать — это позвонить в свое лечебное учреждение. Если человек сдал тест на коронавирус, а результат оказался положительным, то это означает, что он является носителем вируса, в данный момент болеет COVID-19 или уже вылечился, но в его организме сохранились антитела.
Как сдать кровь на ПЦР
- Преимущества ПЦР-диагностики
- Что еще почитать
- Преимущества метода ПЦР
- Что это такое
- Что такое ПЦР-тесты и зачем их сдавать
- ПЦР: что это за метод, для чего используется анализ | МРТ Эксперт
ПЦР-тест и тест на антитела к коронавирусу: как разобраться в результатах?
В зависимости от причины проведения ПЦР-теста положительный результат может указывать на наличие исследуемого возбудителя. Отрицательный результат будет говорить об отсутствии возбудителя в организме. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — это метод молекулярно-генетической диагностики, позволяющий обнаружить в организме человека различные инфекционные заболевания. Таким образом, при простуде ПЦР-тест не может дать положительный результат на коронавирус. ПЦР-тестирование рекомендовано для диагностирования COVID-19 ВОЗ и Центром по контролю и профилактике заболеваний США. ПЦР положительный анализ означает инфицирование организма определенным микроорганизмом. На ранних стадиях болезни получить положительный результат значительно выше. «После четвертого-пятого дня болезни вероятность обнаружить вирус в носоглотке снижается, а респираторные симптомы могут быть в это время в самом разгаре.
Результаты ПЦР диагностики
Сообщить о результате теста в медучреждение по месту жительства. Напомним, что больничные листы с подтвержденным положительным ПЦР будут открыты с момента фиксации вашего результата в системе ЕМИАС. Полимеразная цепная реакция — метод, позволяющий обнаружить конкретный генетический материал в образце. О частоте ложно-положительных результатов диагностического теста можно судить по показателю, который называется специфичность. Анализ — полимеразная цепная реакция имеет аббревиатуру — ПЦР. ПЦР-тест даст более точный результат, если врач возьмет у пациента мазок с первого по пятый день заболевания.
Статьи по теме
- Для чего применяют анализы ПЦР в медицине?
- Специфическая
- Что такое ПЦР-тесты и зачем их сдавать
- Анализ ПЦР 12 инфекций
Диагностика коронавируса COVID-19
ПЦР (метод полимеразной цепной реакции) — экспериментальный метод, использующийся при лабораторной диагностике многих инфекционных заболеваний и позволяющий обнаружить большинство микроорганизмов. ПЦР (полимеразная цепная реакция) – это высокоточный метод молекулярно-генетический диагностики. ПЦР — это полимеразная цепная реакция. Положительный результат ПЦР указывает на выявление следов инфекции в исследуемой биологической пробе. С большой точностью положительный результат указывает на наличие инфекции в данный момент времени. ПЦР-тест даст более точный результат, если врач возьмет у пациента мазок с первого по пятый день заболевания.