Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) обладает высокой специфичностью при выявлении РНК SARS-CoV-2. О том, как берутся образцы биологического материала и подготовке к сдаче анализа читайте в нашей статье. Ученые из Италии проверили, может ли появиться жизнеспособный вирус в дыхательных путях людей, выздоровевших от COVID-19 и потом снова получивших положительный результат ПЦР-теста. У подавляющего большинства таких пациентов, скорее всего, нет вируса. диагностика гепатитов. ПЦР тест на коронавирус – это анализ полимеразной цепной реакции (PCR), который проводится с помощью взятия мазка со слизистой рта и носоглотки и позволяет диагностировать даже бессимптомное течение болезни.
Что такое ПЦР? О методе полимеразной цепной реакции
Что такое ПЦР–тест. диагностика гепатитов. Как работает ПЦР тест на коронавирус. ПЦР-тестирование (также известное как тестирование полимеразной цепной реакции) — это тип лабораторного исследования, который сообщает, есть ли у кого-то в настоящее время COVID-19.
Диагностика коронавируса COVID-19
положительный, IgM – положительный. Вы находитесь на поздней стадии заболевания или выздоровления. ПЦР (метод полимеразной цепной реакции) — экспериментальный метод, использующийся при лабораторной диагностике многих инфекционных заболеваний и позволяющий обнаружить большинство микроорганизмов. 1. Как быстро будет готов результат ПЦР-теста? После того как у человека взяли мазок, у лаборатории есть 24 часа на доставку материала на исследование и ещё 24 часа – на проведение исследования и выдачу результата.
В Минздраве объяснили, от чего зависит результат ПЦР-теста
это крайне чувствительная вещь, то он не отличает живой вирус от мертвого. Положительный ПЦР означает только то, что Вы заразны для окружающих и выделяете вирус. ПЦР (полимеразная цепная реакция): что это, показания к анализу, виды тестов и методы диагностики, преимущества и недостатки. Полимеразная цепная реакция, или ПЦР, используется для диагностики язвы желудка, колита, энтерита. Полимеразная цепная реакция, или ПЦР, используется для диагностики язвы желудка, колита, энтерита. Подробное описание: что такое ПЦР-тест на ковид, что показывает и как узнать результат. Как проводится забор биоматериала, как подготовиться.
Что такое ПЦР: достоверность и точность
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – молекулярно-генетический анализ. Что делать, если пришел положительный результат анализа COVID-19. положительный, IgM – положительный. Вы находитесь на поздней стадии заболевания или выздоровления. Госпитализированы в основном потому, что положительный ПЦР. Если у человека положительный ПЦР-тест, первое, что он должен сделать — это позвонить в свое лечебное учреждение.
Может ли ПЦР-тест на COVID-19 показать положительный результат при простуде
Он отметил, что в РФ вакцинация обязательна только для определенной категории граждан, за отказ от прививки не предусмотрены административная или уголовная ответственность. В некоторых других странах, подчеркнул Медведев, дела обстоят иначе.
Например, при диагностике хламидийной инфекции, где ПЦР относится к основным методам, наряду с хламидией, можно обнаружить и нейссерию гонококк — возбудитель гонореи. Причем, на достоверности результатов это негативно не отражается; Тестирование методом ПЦР выявляет опасные микроорганизмы в инкубационном периоде, когда они еще не успели нанести ощутимый вред организму, то есть, ранняя диагностика предупреждает о грядущем развитии патологического процесса, что дает возможность подготовиться к нему и принять во всеоружии.
Кроме этого, во избежание недоразумений, иной раз возникающих при диагностике, ПЦР защищает себя еще и тем, что ее результаты могут зафиксироваться фотография, компьютер с целью использования их в экспертных целях, если будет на то необходимость. Нормой в ответах ПЦР считают отрицательный результат, указывающий на отсутствие фрагментов чужеродных нуклеиновых кислот, положительный ответ будет свидетельствовать о наличии инфекции в организме, цифровые значения означают состояние вируса и его концентрацию на момент тестирования. Однако полную расшифровку анализа осуществляет врач, прошедший специальную учебу по теме «ПЦР». Пытаться же интерпретировать результаты самостоятельно не имеет никакого смысла, поскольку можно, что скорее всего и произойдет, неправильно понять и начать заранее волноваться.
Чего «боится» ПЦР, что она умеет и как к ней подготовиться? Как в любых других исследованиях, иной раз результаты теста оказываются ложноположительными или ложноотрицательными, где ПЦР исключением не является. Подобное может происходить в случаях: Нарушения технологического процесса на одном из этапов реакции; Несоблюдения правил забора материала, его хранения или транспортировки; Присутствие посторонних примесей в материале. Это говорит о том, что к ПЦР — диагностике инфекций нужно подходить внимательно, осторожно и аккуратно, иначе образцы материала могут поменять свое структурное строение или вовсе разрушиться.
Этапы ПЦР-диагностики. Ложные результаты могут дать нарушения на любом из этапов исследования ПЦР-диагностика инфекций относится к категории «золотых стандартов» среди других лабораторных методов, поэтому ее можно применить для поиска возбудителей многих заболеваний, на первый взгляд не имеющих ничего общего между собой: Туберкулез различной локализации, пневмония в том числе и атипичная, вызванная хламидией ; Детские инфекции коревая краснуха, паротит, корь ; Дифтерия; Зоонозная инфекционная болезнь — листериоз заболевание характеризуется многообразием симптомов с поражением лимфоузлов, ЦНС, внутренних органов ; Заболевания, обусловленные проникновением вируса Эпштейн-Барра инфекционный мононуклеоз и др.
Первые циклы проводят при температуре выше оптимальной температуры отжига, затем каждые несколько циклов температуру отжига постепенно снижают до оптимальной. Это делается для того, чтобы праймер гибридизовался с комплементарной цепью всей своей длиной; тогда как при оптимальной температуре отжига, праймер частично гибридизуется с комплементарной цепью. Частичная гибридизация праймера на геномной ДНК приводит к неспецифической амплификации, если участков связывания для праймера достаточно много. В точках, содержащих анализируемую ДНК, происходит амплификация с образованием молекулярных колоний. Вторая полимераза необходима для коррекции ошибок, внесённых первой, так как Taq-полимераза останавливает синтез ДНК, если был добавлен некомплементарный нуклеотид.
Этот некомплементарный нуклеотид удаляет Pfu-полимераза. Смесь полимераз берётся в отношении 50:1 или даже меньше 100:1, где Taq-полимеразы берётся в 25—100 раз больше, чем Pfu-полимеразы. RAPD Random Amplification of Polymorphic DNA [en] , ПЦР со случайной амплификацией полиморфной ДНК — используется тогда, когда нужно различить близкие по генетической последовательности организмы, например, разные сорта культурных растений, породы собак или близкородственные микроорганизмы. В этом методе обычно используют один праймер небольшого размера около 10 п. Этот праймер будет частично комплементарен случайным участкам ДНК исследуемых организмов. Подбирая условия длину праймера, его состав, температуру и пр. Групп-специфическая ПЦР group-specific PCR — ПЦР для родственных последовательностей внутри одного или между разными видами с использованием консервативных праймеров к этим последовательностям.
Например, подбор универсальных праймеров к рибосомальным генам 18S и 26S для амплификации видоспецифического межгенного спейсера: последовательность генов 18S и 26S консервативна между видами, поэтому ПЦР между этими генами будет проходить для всех исследуемых видов.
Самочувствие пациента. Если анализ теста на коронавирус положительный, но самочувствие пациента нормальное, он все равно является носителем COVID-19. Поэтому чтобы инфекция не распространялась, человек должен строго соблюдать правила двухнедельной самоизоляции. В этом случае прекращаются все контакты с посторонними людьми. В случае сочетания положительного теста с выраженными симптомами коронавируса мучительный кашель, высокая температура, потеря вкуса и обоняния , пациент может нуждаться в госпитализации. В некоторых случаях инфекция, попавшая в организм, вызывает тяжелые осложнения: вирусную пневмонию, сердечную и легочную недостаточность, расстройства в работе печени, почек, головного мозга. В таких ситуациях больной нуждается в постоянном медицинском наблюдении и специальном лечении, которое возможно осуществить только в условиях стационара. В любом случае, если человек получил положительный тест на COVID-19, что предпринимать дальше самостоятельно он не решает.
Скрыть результаты тестирования тоже не представляется возможным, так как оно проводится в лабораторных учреждениях, контролируемых Министерством Здравоохранения и Роспотребнадзором. В эти организации сразу же отправляются сведения о новых выявленных больных коронавирусом. На дом к больному выезжает бригада медицинских работников, которые, после обследования, изучения клинической картины и оценки общего состояния больного определяют дальнейший алгоритм действий. Положительный результат без наличия симптомов Отсутствие симптомов при положительном результате на COVID-19 — распространенная ситуация. Бессимптомное течение означает, что проникнув в организм, инфекцию быстро атаковал иммунитет и легко справился с ней. По сути, вирус находится в организме, но не вызывает заболевания.
Различие тестов на коронавирус
Тогда для загрязнения достаточно попадания капель или даже аэрозоля с этого образца, — говорит Наталья Гасилова. Есть также требование — оставлять зонд, которым берется биоматериал, в пробирке. Его полагается отламывать или отрезать ножницами. При выполнении этой операции тоже есть риск испачкать перчатки, поэтому их надо каждый раз менять. По словам специалиста, загрязнение «чистого» образца может случиться и при транспортировке анализов.
В итоге пробирка снаружи будет контаминирована и, если потом пробирки ставятся в один штатив и перчатки не меняются, частицы вируса могут «переноситься» в другой образец. Еще такое бывает, когда в пробирке оставляются достаточно крупные зонды. В этом случае крышка микропробирки закрывается с усилием, может периодически приоткрываться, а вытекающие капельки биоматериала опять же попадают на стенку пробирки снаружи, — поясняет медик.
Пациент перенес данное заболевание в прошлом, возможно бессимптомно и не является больным на момент обследования. В подобном случае необходима детализация анализов крови и консультация врача, ведь нужно разобраться, что именно дает положительную реакцию.
Что делать, если пришел положительный ПЦР анализ? К сожалению, симптомы некоторых заболеваний не всегда видны, и в организме человека таятся скрытые инфекции. После получения положительного результата ПЦР, не стоит сразу паниковать и волноваться. Существует вероятность ложно-позитивной реакции ПЦР. В подобной ситуации необходимо повторно выполнить данный анализ.
Если при первом диагностировании сдавался ПЦР качественный, то при повторном рекомендуется проходить ПЦР количественный. Выполняйте ПЦР анализы в лаборатории при профильной клинике.
Реактивы для количественных ПЦР-тестов более дорогие, а методика сложнее, так что количественные тесты дороже качественных. Чтобы сравнить цены в разных клиниках, мы выбрали один анализ — на гепатит С, для которого берут кровь из вены.
Цены указаны с учетом взятия крови. Запомнить ПЦР-тесты помогают обнаружить фрагменты генетического материала бактерий, вирусов или других людей. Но для каждого микроорганизма реактив нужен свой, так что универсальных тестов ПЦР на все инфекции сразу не бывает.
Среди них 285 пациентов в последующем имели положительный результат теста при повторном тестировании. Однако ни одного из 790 проживающих с ними членов семьи или ближайших контактов инфицирования коронавирусом не выявлено. Это свидетельствует о том, что при обнаружении вирусной РНК на этой стадии люди перестают быть заразными. Поэтому Корейский центр по управлению и контролю за болезнями больше не требует изоляции в таких случаях. В общей популяции пациенты у которых была коронавирусная инфекция в течение 10-14 дней, вероятно, больше не представляют опасность для окружающих. Однако это правило может не распространяться на все категории пациентов, в частности, иммунокомпрометированных пациентов или тяжело больных пациентов, находящихся в больнице.
Что такое ПЦР: достоверность и точность
ИФА анализ крови на антитела показывает наличие иммуноглобулинов в крови. Наличие антител определяется вне зависимости от места локализации очага инфекции Анализ крови на антитела поможет обнаружить в крови наличие: Иммуноглобулинов типа IgA Иммуноглобулинов типа IgG Иммуноглобулинов типа IgM Обнаружение в крови Иммуноглобулинов типа говорит об активном инфекционном процессе IgM. Если заболевание протекает в активной стадии, пациенту требуется пройти лечение. Если ПЦР отрицательный, а анализ на антитела положительный, что это значит? Подобное может произойти вследствие нескольких факторов: Остаточный или иммунологический след, который остается в результате выработки иммуноглобулина. Пациент перенес данное заболевание в прошлом, возможно бессимптомно и не является больным на момент обследования. В подобном случае необходима детализация анализов крови и консультация врача, ведь нужно разобраться, что именно дает положительную реакцию. Что делать, если пришел положительный ПЦР анализ? К сожалению, симптомы некоторых заболеваний не всегда видны, и в организме человека таятся скрытые инфекции.
Он отметил, что в РФ вакцинация обязательна только для определенной категории граждан, за отказ от прививки не предусмотрены административная или уголовная ответственность. В некоторых других странах, подчеркнул Медведев, дела обстоят иначе.
В первую стадию денатурация происходит так называемое раскручивание ДНК — то есть разделение связанных между собой двух цепей ДНК. Во вторую отжиг - происходит присоединение праймера к участку нити ДНК. И, наконец, в заключительной третьей стадии, "фермент-строитель" достраивает нити, восстанавливая ДНК. В настоящее время весь этот сложный процесс протекает в одной пробирке и состоит из повторяющихся циклов размножения амплификаций определяемой ДНК с целью получения большого количества копий, которые могут быть, затем выявлены обычными методами. То есть из одной нити ДНК мы получаем сотни тысяч или миллионы копий. Поначалу для каждой стадии использовали отдельную водяную баню, что сильно увеличивало время получения результата. Поставить "на поток" метод помогли специальные автоматические термостаты - амплификаторы, в которых изменение температуры происходит по заданной программе. Современный амплификатор — сложный электронный прибор, не только управляющий циклами амплификации и поддерживающий необходимые температуры, но и делающий количественные замеры после каждого цикла. В её основе лежит принцип флуоресцентной детекции продуктов ПЦР непосредственно в ходе амплификации. Детекция продуктов амплификации проводится прямо в реакционной среде через стенки или крышку закрытой пробирки. Для этого в состав реакционной смеси, наряду с праймерами и другими компонентами реакции, добавлены специальные флуоресцентные метки зонды. Флуоресцентный зонд выполнен по той же технологии, что и праймер и отличается он него тем, что на одном его конце прикреплена флуоресцентная молекула флуорофор , а на другом конце расположена специальная молекула-гаситель флуоресценции. За счёт близости гасителя, энергия поглощаемая флуорофором не вызывает флуоресцентного свечения, а целиком передаётся гасителю. При этом, при облучении смеси ультрафиолетом, флуоресцентный отклик полностью отсутствует. Дальше всё происходит, так же, как было описано выше: В ходе ПЦР при повышении температуры происходит денатурация ДНК с распадом на две половинки. Зонд вместе с праймерами присоединяется к комплементарному участку ДНК. При этом флуорофор и гаситель освобождаются, расстояние между ними увеличивается и эффект гашения перестаёт работать. Теперь при облучении смеси ультрафиолетом, мы получим устойчивый флуоресцентный сигнал-отклик от флуорофора. Изготавливая молекулы флуорофора с разным цветом свечения можно проводить одновременный поиск разных возбудителей в одной пробирке. Большинство используемых сегодня, для ПЦР диагностики, амплификаторов , относится к классу автоматических, высокоскоростных многофункциональных Real Time аппаратов. Они позволяют проводить множественный ПЦР анализ до 5 мишеней цветных флуоресцентных красителей в 96 пробирках одновременно. Это полностью автоматические термоциклеры со встроенным оптическим блоком и возможностью детекции накопления продуктов амплификации непосредственно в пробирке во время протекания реакции. Весь процесс амплификации протекает в закрытых одноразовых пробирках, считывание происходит через прозрачные стенки пробирок, без их открытия. Но они напрямую связаны с его достоинствами и с тем, что называется "человеческим фактором".
Этот человек является вирусовыделителем. Иногда мы таких пациентов выписываем, но предупреждаем, что нужно изолироваться. Андрей Поздняков, врач-инфекционист, главный врач клинико-диагностической лаборатории ООО «Инвитро — Сибирь», напротив, замечает, что сейчас превалирующим штаммом является «дельта», кардинальное отличие которого заключается в том, что он активно размножается в организме: — Отсюда его способность «пробивать» иммунную защиту. Более активное размножение в сравнении ведет к тому, что вирусных частиц на оболочках слизистых становится на несколько порядков больше. Соответственно, они более длительное время могут улавливаться методиками обнаружения, в том числе ПЦР. То есть время выделения вируса просто стало больше. Андрей Поздняков подтверждает, что при положительном тесте, который приходит на протяжении долгого времени, есть вероятность, что это РНК уже инактивированного вируса, но ПЦР-методика не может дифференцировать РНК «неживого» вируса от РНК жизнеспособного. Поэтому определить, заразен ли человек при получении положительного результата ПЦР, не представляется возможным. Терапевт Ирина Непомнящих объясняет, что в такой ситуации нужно изолироваться и ждать отрицательного результата: — Сейчас часто бывает, что ПЦР долгое время остается положительным. Ничего не нужно делать — просто сдавать тест и сидеть дома до отрицательного результата. Это могут быть остатки разрушенного вируса. Именно они могут давать такой результат, но пока нужно всё равно сдавать тесты. Ранее мы рассказывали, почему долгое время держится температура 37 и что с этим делать.
Мясников рассказал, почему при положительном ПЦР-тесте человек не болен COVID
| ПЦР-тест: что это, расшифровка анализа, как его делают | Госпитализированы в основном потому, что положительный ПЦР. |
| «Вероятность обнаружить вирус снижается». Когда нужно сдавать ПЦР-тест | ПЦР, бактериологические посевы. |
| Что такое ПЦР-анализ? | полимеразная цепная реакция. |
ПЦР ДИАГНОСТИКА. Что это такое?
Мокроту следует собирать утром, сразу после пробуждения. Предварительно нужно почистить зубы и прополоскать рот, нельзя есть до взятия биоматериала. Важно собирать не слюну или носоглоточную слизь, а мокроту. Сделайте несколько глубоких вдохов, чтобы вызвать «мокрый» кашель. Необходимо откашлять содержимое глубоких дыхательных путей. Сплюньте мокроту в заранее подготовленный стерильный контейнер с плотно закрывающейся крышкой. Минимальный объём мокроты — 1 мл. Доставьте контейнер в лабораторное отделение в день взятия биоматериала. Подготовка к соскобу из зева За 24 часа до исследования по предварительному согласованию с лечащим врачом следует отказаться от терапии полости рта какими-либо лекарственными препаратами. Подготовка к соскобу из влагалища или урогенитального тракта За 30 дней до исследования следует прекратить применение антибиотиков по согласованию с лечащим врачом. За 24 часа до исследования не следует проводить спринцевание, внутривагинальную терапию свечи, тампоны , не использовать антисептические средства в том числе мирамистин , исключить половой контакт.
В день исследования запрещается проводить туалет половых органов. Женщинам рекомендуется сдавать анализ до менструации или через 5 дней после её окончания.
Наиболее часто заразившийся сталкивается с респираторными симптомами, что может говорить не только о коронавирусе, но и ряде других заболеваний, включая грипп и ОРВИ. По этой причине единственным способом диагностики коронавируса остается ПЦР-тестирование. В частности, тогда считалось, что в большей части случаев на это влияют ошибки при заборе материала и качество самого теста. Тем не менее существует и другое обоснование. По словам заместителя директора по клинико-аналитической работе ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора профессора Натальи Пшеничной, на результате анализа сказывается период заболевания, в который заболевший сдает ПЦР-тест. На ранних стадиях болезни получить положительный результат значительно выше. Если проводить тестирование в эти сроки, то можно получить отрицательный результат», — приводит слова специалиста РИА «Новости».
Сейчас мы знаем, что и то, и другое возможно, хотя встречается нечасто. Неясно и то, опасен ли вновь обнаруженный вирус для пациента и для окружающих. Итальянские исследователи проверили, является ли такой вирус жизнеспособным и передающимся. Авторы работы изучили мазки 176 выздоровевших пациентов, которые прекратили изоляцию, но еще находились в амбулаторном отделении больницы.
Критериями выздоровления были отсутствие повышенной температуры в течение 3 дней подряд, снижение симптоматики и 2 отрицательных ОТ-ПЦР теста на РНК коронавируса с интервалом 24 часа.
Можно исследовать не только биологические жидкости кровь, мочу и ткани организма, но и воду, землю. Высокая специфичность. Метод может со стопроцентной вероятностью указать на конкретного возбудителя, потому что весь миллиард полученных ДНК — точные копии той самой первой, которая изначально присутствовала в материале. Можно исследовать гены людей, любых микробов, животных, растений. В одном и том же материале можно изучать разные виды ДНК. Диагностика инфекций — лишь одна из сфер применения полимеразной цепной реакции. ПЦР используют, чтобы изучать новые гены, устанавливать отцовство, обнаруживать наследственные заболевания. Какие инфекции можно диагностировать при помощи ПЦР?
ПЦР помогает диагностировать инфекции мужской и женской мочеполовой системы: уреаплазмоз, хламидиоз, герпес, гонорею, микоплазмоз, гарднереллез, папилломавирусную инфекцию. В гастроэнтерологии метод применяют для выявления возбудителя язвенной болезни H. ПЦР помогает обнаруживать возбудителей дифтерии, кишечных инфекций сальмонеллеза , вирусных гепатитов B, C, G , онковирусов, цитомегаловирусов. Что сдают на ПЦР-анализ? Как мы уже разобрались, ПЦР можно проводить на каком угодно материале.