ПЦР – это тест, позволяющий определить или исключить наличие конкретной инфекции у пациента, то есть исследование представляет собой этиологическую диагностику патогенного возбудителя. Положительный результат такого теста требует обязательной проверки методом ПЦР (полимеразной цепной реакции). Суть полимеразной реакции.
Положительный ПЦР-тест на коронавирус после выздоровления, как правило, не опасен
Также метод активно применяется для диагностики вирусных, хламидийных, уреаплазменных и большинства других бактериальных инфекций. Суть метода Впервые методика полимеразной цепной реакции была использована почти 30 лет назад. Практически сразу исследование стало одним из основных способов диагностики инфекционных заболеваний. В 1993 году создатель анализа был награжден Нобелевской премией за огромный вклад в развитие всей мировой медицины. Каждый живой организм имеет уникальный набор хромосом. В том числе это касается вирусов, грибов и других возбудителей различных заболеваний. Все хромосомы образованы ДНК.
Дезоксирибонуклеиновая кислота представляет собой биологический полимер, который обеспечивает хранение, передачу и реализацию генов. Состоит из множества молекул, называемых нуклеотидами. РНК — это рибонуклеиновая кислота, еще один вид биологического полимера, который по своему химическому строению близок к ДНК. Молекула РНК также состоит из множества звеньев — нуклеотидов. Именно РНК является носителем генетической информации у ряда вирусов. Кроме этого, рибонуклеиновая кислота выполняет передачу данных от ДНК к белку.
Эта последовательность всегда уникальна, за исключением некоторых схожих участков ДНК, которые отвечают за однообразие в пределах одного вида. При помощи методики ПЦР можно найти даже мельчайшие фрагменты нуклеиновой кислоты, чтобы определить, к какому виду принадлежит микроорганизм. Однако анализ ДНК небольшого количества микробов достаточно мало информативен, из-за чего требуется увеличить количество нуклеотидов. Именно с этими целями используется ПЦР, позволяющий многократно дублировать цепочку нуклеотидов.
Анализ может идентифицировать как определенный вирус например, вирус герпеса , так и его конкретный штамм например, 8 тип герпесвируса. Узнать больше на эту тему:.
В острый период болезни их концентрация будет максимальной.
Обычно ко второй неделе заражения организм вырабатывает антитела класса IgG, чтобы «запомнить врага». Такие антитела сохраняются долгое время после выздоровления. Биоматериалом для исследования антител является кровь из вены. До сдачи анализа нельзя есть в течение восьми часов, запрещено ужинать накануне жирной пищей, а за 24 часа — пить алкоголь и употреблять лекарства. Кроме того, за два часа до сдачи крови нельзя курить, физически и эмоционально перенапрягаться, пить можно только негазированную воду. Также нежелательно сдавать тест на антитела после медицинских процедур: физиотерапии, инструментального обследования, рентгенологического и ультразвукового исследования, массажа и так далее.
На сегодня отправка второго образца анализа из клиники идет для повторного подтверждения не в Новосибирск, а в московский региональный центр. На это уходит 1,5-2 дня. Но смею вас заверить, сегодня все тесты уже относятся к разряду высокочувствительных. В течение этих трех дней человек должен быть изолирован. Если оба раза тест будет выдавать отрицательный результат, то в этом случае диагноз COVID-19 не ставится. После него не назначают повторный анализ? То есть, любой житель города может заказать диагностику и ему на дом привезут все необходимое. Брать мазок из горла должен врач или обученный лаборант. Если пациент сам не туда попадет, у него может быть ложно-отрицательный ответ. Это альтернатива ПЦР? Анализ вирусных частиц можно произвести при помощи ИФА, но вряд ли его сегодня будут использовать. Дело в том, что по точности и чувствительности он сильно уступает вышеописанному способу ПЦР.
Что выбрать: ПЦР-тест или тест на антитела к COVID-19?
Чаще всего ПЦР-тест показывает ложноположительный результат из-за наличия в носу или ротоглотке фрагментов уже погибшего вируса, рассказал в интервью Лайфу доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Антон Ершов. Полимеразная цепная реакция — метод, позволяющий обнаружить конкретный генетический материал в образце. ПЦР (полимеразная цепная реакция) – это прямой метод выявления возбудителя, то есть с помощью него можно определить РНК вируса со слизистой ротоглотки или носоглотки, то есть можно определить сам коронавирус.
Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
Нередко встречается и ложноположительные результаты ПЦР сразу после лечения. Когда разрушенные участки генетического материала уже погибшего возбудителя еще сохраняются в крови или биологических средах. Результат становится отрицательным по истечении шести-девяти месяцев после терапии. Какой врач проводит расшифровку ПЦР-исследований Первично назначается анализ либо венерологом, либо урологом, либо гинекологом для женщин. Оценка анализа и выставление результатов в бланке ответа — это функция врача-лаборанта, проводившего исследование. Дальнейшая интерпретация полученных данных — это функционал узкого специалиста, к которому обращается пациент.
Врач назначает такие исследования обычно при: признаках острого воспаления урогенитального тракта, для уточнения причины воспаления, перед планируемой беременностью или эко, у беременных с отягощенной акушерской историей, для контроля эффекта от проводимого лечения по поводу вензаболевания не раньше, чем спустя месяц после окончания терапии , в качестве скрининга для исключения бессимптомного течения инфекции при наличии более одного партнера за год. Методы молекулярной биологии имеют важное от культуральных или серологических методик отличие. Они не требуют определенного накопления возбудителя или антител к нему и чувствительны практически сразу от момента заражения. Нет смысла выдерживать паузу в течение предполагаемого инкубационного периода венерической инфекции.
В таком случае ПЦР-тест всегда даст положительный результат. Ранее Дмитрий Медведев заявил, что в плане регламентирования коронавирусных ограничений и ответственности за их нарушение российское законодательство остается очень либеральным. Он отметил, что в РФ вакцинация обязательна только для определенной категории граждан, за отказ от прививки не предусмотрены административная или уголовная ответственность.
Количества анализов, которые вы собираетесь сдавать. Типа анализов. Реактивы для количественных ПЦР-тестов более дорогие, а методика сложнее, так что количественные тесты дороже качественных. Чтобы сравнить цены в разных клиниках, мы выбрали один анализ — на гепатит С, для которого берут кровь из вены.
Цены указаны с учетом взятия крови.
Если результат положительный — его повторяют, и только в случае двойного положительного результата пациенту сообщают о болезни. Анна Солдатова.
Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
Закройте контейнер крышкой и плотно закрутите её. Доставьте контейнер в лабораторное отделение в течение 2 часов после взятия биоматериала. Подготовка к ПЦР-анализу кала Кал следует сдавать до приёма антибиотиков или не ранее, чем через 12 часов после приёма препарата. За 72 часа до исследования откажитесь от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, а также прекратите приём препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала. Соберите образец кала после естественного опорожнения кишечника без применения клизм или слабительных средств. Позаботьтесь о том, чтобы в биоматериал не попали посторонние примеси: вода, моча, выделения половых органов, дезинфицирующие средства и химические вещества, содержащиеся в подгузниках: перед дефекацией вымойте и высушите промежность; соберите кал с чистой и не впитывающей влагу поверхности: это может быть чистый пакет из полиэтилена, клеёнка, чистое судно или горшок. Собирать кал из унитаза, пелёнок или подгузников — нельзя! Поместите 1—2 чайные ложки биоматериала в герметичный контейнер.
Если нужно выполнить несколько анализов, подготовьте для каждого исследования отдельную порцию биоматериала в отдельном контейнере. Доставьте контейнер в лабораторное отделение в течение 2 часов после сбора. Чтобы сохранить температуру контейнера, можно поместить его в термос с кубиком льда или в пакет с хладоэлементами. Если отслеживаете показатели в динамике, сдавайте каждый анализ при одинаковых условиях: в том же лабораторном отделении, тем же методом. Исследования для оценки эффективности лечения, как правило, проводят через 2—4 недели после приёма антибактериальных препаратов.
Этот некомплементарный нуклеотид удаляет Pfu-полимераза. Смесь полимераз берётся в отношении 50:1 или даже меньше 100:1, где Taq-полимеразы берётся в 25—100 раз больше, чем Pfu-полимеразы. RAPD Random Amplification of Polymorphic DNA [en] , ПЦР со случайной амплификацией полиморфной ДНК — используется тогда, когда нужно различить близкие по генетической последовательности организмы, например, разные сорта культурных растений, породы собак или близкородственные микроорганизмы. В этом методе обычно используют один праймер небольшого размера около 10 п. Этот праймер будет частично комплементарен случайным участкам ДНК исследуемых организмов. Подбирая условия длину праймера, его состав, температуру и пр. Групп-специфическая ПЦР group-specific PCR — ПЦР для родственных последовательностей внутри одного или между разными видами с использованием консервативных праймеров к этим последовательностям. Например, подбор универсальных праймеров к рибосомальным генам 18S и 26S для амплификации видоспецифического межгенного спейсера: последовательность генов 18S и 26S консервативна между видами, поэтому ПЦР между этими генами будет проходить для всех исследуемых видов. Противоположностью этому методу является уникальная ПЦР unique PCR , где задача состоит в подборе праймеров для амплификации только одной последовательности изо всех родственных. ПЦР с использованием горячего старта [en] hot start PCR — модификация ПЦР с использованием ДНК-полимеразы, в которой полимеразная активность блокируется при комнатной температуре антителами или имитирующими антитела небольшими молекулами типа Affibody [en] , то есть в момент постановки реакции до первой денатурации в ПЦР. Удобен при создании библиотеки вариантов в случае, когда фрагмент ДНК слишком велик для химического синтеза. UPSR [21] — метод ПЦР, применяемый, например, при работе с древней ДНК, когда даже незначительная контаминация смеси реактивов нежелательными последовательностями приводит к снижению выхода целевого продукта. Если нуклеотидная последовательность матрицы известна частично или неизвестна вовсе, можно использовать вырожденные праймеры, последовательность которых содержит вырожденные позиции, в которых могут располагаться любые основания.
ПЦР более объективен, чем многие другие иммунологические способы диагностики, поскольку практически не даёт ложно-положительных ложно-отрицательные значительно более редки ввиду высокой чувствительности метода. Следует учитывать, что точность и достоверность диагностики методом ПЦР зависит от возможностей лаборатории, квалификации врачей, качества забора материала и от соблюдения правил подготовки к сдаче анализа. Эти инструкции не сложны, но их точное выполнение гарантирует, что в исследуемый образец не попадут посторонние вещества или жидкости другого человека. В целом же, забор крови, взятие мазков и сбор биологических жидкостей ничем не отличаются от таковых для других методик.
Иммуноферментный анализ используется для уточнения стадии заболевания. ИФА анализ крови на антитела показывает наличие иммуноглобулинов в крови. Наличие антител определяется вне зависимости от места локализации очага инфекции Анализ крови на антитела поможет обнаружить в крови наличие: Иммуноглобулинов типа IgA Иммуноглобулинов типа IgG Иммуноглобулинов типа IgM Обнаружение в крови Иммуноглобулинов типа говорит об активном инфекционном процессе IgM. Если заболевание протекает в активной стадии, пациенту требуется пройти лечение. Если ПЦР отрицательный, а анализ на антитела положительный, что это значит? Подобное может произойти вследствие нескольких факторов: Остаточный или иммунологический след, который остается в результате выработки иммуноглобулина. Пациент перенес данное заболевание в прошлом, возможно бессимптомно и не является больным на момент обследования. В подобном случае необходима детализация анализов крови и консультация врача, ведь нужно разобраться, что именно дает положительную реакцию. Что делать, если пришел положительный ПЦР анализ?
ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео)
ПЦР – это тест, позволяющий определить или исключить наличие конкретной инфекции у пациента, то есть исследование представляет собой этиологическую диагностику патогенного возбудителя. ПЦР положительный анализ означает инфицирование организма определенным микроорганизмом. Выводы. Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR), открытая американцем Кэрри Муллисом в 1983 году, и метод детекции ДНК, разработанный на ее основе, принесли ученому Нобелевскую премию по химии 1993 года. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — метод молекулярной биологии. В результате известные фрагменты оказываются на обоих концах неизвестного участка, после чего можно проводить ПЦР как обычно. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – это современный инструмент диагностики разнообразных инфекций, отличающийся высокой точностью. Подробное описание: что такое ПЦР-тест на ковид, что показывает и как узнать результат. Как проводится забор биоматериала, как подготовиться.
Результаты ПЦР диагностики
Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR) — это точный метод лабораторной диагностики, который используют для выявления возбудителей инфекционных заболеваний. ПЦР-тест даст более точный результат, если врач возьмет у пациента мазок с первого по пятый день заболевания. В свою очередь главврач клинико-диагностической лаборатории "Инвитро — Сибирь" Андрей Поздняков считает, что надолго сохраняющийся положительный ПЦР-тест может быть связан с особенностями дельта-варианта коронавируса.
Анализ ПЦР 12 инфекций
Мы можем каким-то образом облегчить симптомы заболевания коронавирусом, но выздоровление идет за счет сил самой иммунной системы человека, — считает иммунолог Владимир Болибок. Иммунолог Николай Крючков считает, что продолжительное выявление коронавируса у уже, казалось бы, выздоровевшего человека может говорить о том, что организм не может эффективно подавить вирус — недостаточно синтезирует IgA в слизистых, позже реагирует специфический иммунитет. Это нужно иметь в виду, потому что человек может оставаться заразным. Врач-инфекционист Андрей Поздняков говорит, что при положительном тесте, который приходит на протяжении долгого времени, есть вероятность, что это РНК уже инактивированного вируса, но ПЦР-методика не может дифференцировать РНК «неживого» вируса от РНК жизнеспособного. Поэтому определить, заразен ли человек при получении положительного результата ПЦР, не представляется возможным. Поэтому единственной гарантией от дальнейшего распространения вируса в данном случае может служить продолжение изоляции. Это могут быть остатки разрушенного вируса.
Следует учитывать, что точность и достоверность диагностики методом ПЦР зависит от возможностей лаборатории, квалификации врачей, качества забора материала и от соблюдения правил подготовки к сдаче анализа. Эти инструкции не сложны, но их точное выполнение гарантирует, что в исследуемый образец не попадут посторонние вещества или жидкости другого человека. В целом же, забор крови, взятие мазков и сбор биологических жидкостей ничем не отличаются от таковых для других методик. Лаборатория медицинского центра Бест Клиник располагает современным оборудованием и высококвалифицированными врачами, что гарантирует высокую точность и достоверность выполняемых исследований.
В первом случае человеку предлагается сдать кровь в медицинском учреждении. У анализа есть преимущества: низкая цена по сравнению с ПЦР; высокая скорость до получаса ; простота реализации. Однако точность его вызывает сомнения. Экспресс-анализ показывает только присутствие компонентов вируса, а не его самого.
Поэтому все положительные пробы важно перепроверять методом ПЦР. С экспресс-наборами например, Standard Q Covid-19 человек работает сам. Это не аналог иммунохроматографии: кровь здесь не понадобится, достаточно мазка из носоглотки. Что именно нужно делать — написано в инструкции.
При контакте биоматериала с реагентом происходит реакция с окрашиванием как с тестом на беременность. Такое исследование на коронавирус достаточно быстрое до 20 минут , однако не слишком точно. Тест на антитела Антитела к коронавирусу, выявленные в организме, показывают его реакцию на возбудитель. Если он вырабатывает специфические иммуноглобулины, это может означать, что: человек переболел COVID-19 в том числе бессимптомно ; антитела способны бороться с вирусом в случае его повторного проникновения в кровь; человек может быть донором и спасать других зараженных, кто переносит заболевание тяжелее.
Если тестирование показало, что антитела к коронавирусу присутствуют, это еще не значит, что их носитель больше никогда не заболеет. Хотя статистика имеется небольшая, вирусологи пришли к выводу, что положительный тест на антитела может ненадолго приравниваться к вакцинации. Однако это справедливо в течение полугода после выявления инфекции. По истечении этого срока вновь появляются риски, и пациенту рекомендована прививка.
Как расшифровать анализ на антитела? Обследуемый на антитела может иметь в организме несколько видов белков, вырабатываемых иммунной системой: IgM — реакция на любую острую инфекцию. Обычно присутствуют в организме в течение месяца после заражения, однако при COVID-19 этот срок увеличивается до 3 месяцев. Могут сохраняться даже в отсутствие вируса.
Их количество должно снижаться по мере выздоровления. IgG — запоминающая реакция организма на перенесенную инфекцию. Синтезируются через 6 недель после заражения и формируют иммунитет. Если в анализе на антитела есть IgA, значит, человек столкнулся с коронавирусом.
В эти организации сразу же отправляются сведения о новых выявленных больных коронавирусом. На дом к больному выезжает бригада медицинских работников, которые, после обследования, изучения клинической картины и оценки общего состояния больного определяют дальнейший алгоритм действий. Положительный результат без наличия симптомов Отсутствие симптомов при положительном результате на COVID-19 — распространенная ситуация.
Бессимптомное течение означает, что проникнув в организм, инфекцию быстро атаковал иммунитет и легко справился с ней. По сути, вирус находится в организме, но не вызывает заболевания. Такие пациенты являются опасными для окружающих, так как, не подозревая о своем носительстве, быстро и беспрепятственно распространяют вирус среди других людей.
Так что же делать, если тест на коронавирус положительный, но болезнь протекает бессимптомно? Если больной живет не один, другие члены семьи тоже должны оставаться дома, так как они являются потенциальными носителями COVID-19. Регулярно поддерживать связь с врачом, строго выполнять его предписания и рекомендации.
Рекомендована обычная столовая вода без газа, теплый чай с лимоном и медом, разбавленные соки, компот из сухофруктов, морс. Питье должно быть комфортной температуры, но ни в коем случае не холодным или горячим. В течение дня желательно выпивать не менее 2 литров жидкости.
Это поможет предотвратить обезвоживание и перегрев. В закрытом помещении концентрация вируса заметно возрастает.
«Вероятность обнаружить вирус снижается». Когда нужно сдавать ПЦР-тест
Каждый набор реагентов, как правило, поставляется в комплекте для анализа 96-ти образцов. Поэтому цифры поставленных тест-систем иногда плавают: кто-то считает комплектами, кто-то единицами тестов. Более корректно считать в единицах. А сегодня нам сообщают, что Россия поставляет тест-системы в 30 стран мира. У нас действительно хватает тестов на всю страну?
У нас исторически хорошие мощности по производству такого рода реагентов. Если в Москве мы обнаруживали положительный образец, должны были контрольную копию доставить в Новосибирск. Пока анализы доставлялись туда, потом обратно, проходило как раз несколько суток. На сегодня отправка второго образца анализа из клиники идет для повторного подтверждения не в Новосибирск, а в московский региональный центр.
На это уходит 1,5-2 дня. Но смею вас заверить, сегодня все тесты уже относятся к разряду высокочувствительных. В течение этих трех дней человек должен быть изолирован.
Общая Она включает в себя основные клинические исследования: ОАК. Кровь анализируется на лейкопению снижение числа лейкоцитов , лимфопению уменьшение количества лимфоцитов , тромбоцитопению недостаток тромбоцитов. Биохимический анализ крови.
Такой метод позволяет оценить состояние внутренних органов, на которые влияет новая инфекция. Производится лабораторная диагностика печеночных ферментов электролитов, мочевины, билирубина, альбумина и глюкозы. Анализ этих показателей помогает определить, есть ли функциональные отклонения в организме, и правильно назначить лечение, учитывая выявленные нарушения. Эта диагностическая процедура призвана оценить уровень кислорода в крови. Плюс метода в том, что цельность кожного покрова не нарушается. Замер происходит с помощью прибора пульсоксиметра.
Анализ уровня CRP. Этот маркер наличия коронавирусной инфекции показывает количество С-реактивного белка в организме. Исследования доказали, что его концентрация значительно повышается при ковидном заболевании. Такие показатели наблюдались при тяжелой и легкой форме течении инфекции.
Расставить все по полочкам мы попросили заведующего лабораторией редактирования генома Национального медицинского исследовательского центра им. Фото: АГН «Москва» — Денис Владимирович, сориентируйте, пожалуйста, наших читателей в многообразии имеющихся диагностических тестов. Но суть теста от этого не меняется, это обычная ДНК-диагностика. В подавляющем большинстве случаев она основана на методе ПЦР — полимеразной цепной реакции.
Это самый надежный метод ДНК-диагностики, золотой стандарт определения вирусных инфекций. В среднем исследование занимает 3-4 часа. Но поскольку надо доставить образец в лабораторию, зарегистрировать его и пр. Как правило лаборатории заявляют, что выполнят тест от 8 часов до 2-3 дней. Если некоторые лаборатории заявляют, что «Результат будет сегодня», а другие обещают это только через 3 дня, это связано не с продолжительностью собственно анализа, а с логистикой обработки биоматериала. Более-менее все они одинаковы по своей чувствительности и специфичности. Хотя самые первые тесты, рекомендованные к применению в феврале, отличались немного пониженной чувствительностью. Кроме того, есть и фактор «врача»: в одном случае у пациента могли взять побольше вируса и его система «увидела», в другом — в пробирку попало меньше вирусных частиц, и ответ был ложно-отрицательным.
Комплементарными являются пары Тимин - Аденин и Гуанин — Цитозин. Практически это означает, что напротив аденина A в одной цепочке ДНК, в другой цепочке обязательно стоит тимин T , а напротив гуанина G — цитозин C. Схематически всё это выглядит следующим образом: Кроме ДНК, точно такую же структуру имеет РНК рибонуклеиновая кислота , отличающаяся от ДНК тем, что вместо тимина в ней используется урацил и комплементарная пара имеет вид A — U. РНК — является хранителем генетической информации у некоторых вирусов, которые называются ретровирусами. Наиболее известный и активно изучаемый представитель этого поганого семейства — ВИЧ. Не смотря на то, что размеры клетки исчисляются микронами, из-за очень специфической плотной упаковки спирали, ядро клетки свободно вмещает десятки хромосом.
Итак, пора переходить к решению задачи. Рассматривая поставленную выше задачу, мы уже увидели две основных проблемы на пути к её решению. Понятно, что с одной стороны, выискивать клетку возбудителя инфекции среди миллионов клеток крови — занятие достаточно бесперспективное, если не сказать бестолковое, а с другой стороны, выделять ДНК из клеток " в рукопашную" — тоже не вариант, из-за опасности порвать на кусочки, всё что мы с таким трудом отыскали… Поэтому, нам очень помог бы какой-нибудь метод, позволяющий активно размножать ДНК, но делающий это только с определёнными, "избранными" экземплярами. Это позволит увеличивать концентрацию интересующей культуры до уровней, безошибочно определяемых и не требующих длительного поиска. Вот этим чудо-методом и стал метод полимеразной цепной реакции ПЦР. Эта реакция носит название репликации ДНК.
Так это звучит сухим академическим языком. Но мы задались целью, объяснить Вам всё, буквально, "на пальцах", а потому продолжим свой рассказ о том, как всё происходит. На первом этапе реакции надо разъединить двойную нить ДНК. Этот процесс называется денатурацией и проходит при температуре 93 - 95 градусов Цельсия. Уже через 30 - 40 секунд связи нуклеотидов разрываются и вместо двойной цепи получаются две одиночные. Надо заметить, что если после этого, снова, просто понизить температуру, то разделившиеся половинки достаточно быстро находят друг друга и всё возвращается, практически, к исходному состоянию.
Следовательно, нам надо не дать соединиться половинкам интересующей нас ДНК. Как этому помешать? Тогда, место на половинке-основании окажется занято, при попытке присоединения, свойство комплементарности окажется нарушено, и вторая половинка не сможет прицепиться на своё "законное" место. Это "что-то" названное праймером, синтезируется в научной или промышленной лаборатории и представляет собой цепочку синтетических нуклеотидов олигонуклеотидов , расположенных в таком же порядке, как и у того вируса бактерии и так далее , на который делается анализ. Например, если делают анализ на хламидии, то праймер соответствует специфическому участку гена, кодирующего главный белок наружной мембраны МОМР Chlamydia trachomatis. Итак, вторая стадия - присоединение праймеров к ДНК также называется отжигом длится от 20 до 60 секунд.