Роспотребнадзор напоминает о ключевых особенностях тестирования методом ПЦР и отвечает на самые часто задаваемые вопросы. Анализ крови на ПЦР – лабораторный анализ, помогающий выявить наличие бактериальных и вирусных возбудителей. ПЦР-тест или полимеразная цепная реакция – метод молекулярно-генетического исследования, указывающий на наличие или отсутствие инфекции в организме больного.
12 методов в картинках: полимеразная цепная реакция
Родоначальником метода ПЦР (полимеразной цепной реакции) считается ученый из Норвегии Х. Клеппе. Исследование для выявления возбудителя гепатита C (HCV), в ходе которого с помощью метода полимеразной цепной реакции в реальном времени (РТ-ПЦР) определяется наличие генетического материала (РНК) вируса и его количество (вирусная нагрузка) в образце крови. это определение вируса в мазке из ротоглотки методом ПЦР. Как расшифровать ПЦР Как работает ПЦР тест Ответы на эти и другие вопросы читайте в статье на нашем сайте.
Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
Трёхбуквенный вариант — это аббревиатура названия «полимеразная цепная реакция». Анализы при гепатите С с расшифровкой (ПЦР) являются надежным показателем наличия вируса в крови человека. ПЦР-тест на ковид – надежный метод, позволяющий определить наличие ДНК вируса в организме с первого дня инфицирования. Если ПЦР, экспресс-тест и IgM-антитела отрицательные, это скорее всего значит, что в последние 2-3 недели коронавируса у вас не было.
Анализ ПЦР на гепатит C
Диагностика инфицирования ВГС проводится в два этапа: Для выявления лиц с вирусной инфекцией выполняется серологическое исследование на антитела к ВГС. У таких пациентов даже при отсутствии инфекции результат исследования на антитела к ВГС будет положительным Тест на наличие РНК ВГС может быть выполнен в лаборатории или с помощью простого аппарата в клинике. Новые инновационные пробы, например на коровый антиген ВГС, находятся в стадии экспериментального тестирования и позволят в будущем проводить одноэтапную диагностику активной инфекции гепатита С. В случае диагностирования хронической инфекции ВГС пациента необходимо обследовать для определения степени поражения печени фиброз и цирроз печени. Это можно сделать с помощью биопсии печени или различных неинвазивных тестов. Решение относительно методов лечения и ведения пациента принимается на основе данных о степени поражения печени. Ранняя диагностика позволяет предотвратить развитие осложнений, связанных с инфекцией, и дальнейшую передачу вируса.
ВОЗ рекомендует проводить тестирование лиц в группах повышенного риска инфицирования. ВОЗ рекомендует, чтобы все взрослые имели доступ к тестированию на ВГС и имели возможность его проведения в сочетании с получением услуг по профилактике, оказанию помощи и лечению. Во всем мире хронические заболевания печени являются одной из основных причин заболеваемости и смертности среди людей, живущих с ВИЧ. Как выполняется анализ Для выявления антител к гепатиту С используется венозная кровь: Анализ удобен тем, что не требует специальной подготовки. Его сдают в утреннее время натощак. Кровь доставляется в лабораторию в чистой пробирке, после чего обрабатывается иммуноферментным методом.
После образования пар «антиген — антитело» обнаруживаются те или иные иммуноглобулины. Такой анализ является первым этапом диагностики гепатита С. Ее проводят при нарушении функций печени, появлении определенных симптомов, изменении состава крови, планировании и ведении беременности, подготовке к хирургическим вмешательствам. Антитела к вирусному гепатиту С чаще всего обнаруживаются случайно. Человека этот диагноз всегда шокирует. Однако не стоит впадать в панику, в некоторых случаях анализ оказывается ложноположительным.
При выявлении антител к гепатиту необходимо и начать дальнейшее обследование. Возможные показания для проведения HCV анализа Для прохождения исследования на предмет наличия гепатита С, не нужны разрешения или направления от лечащего врача, на сегодняшний день существует масса лабораторий и медицинских центров, где любой желающий может пройти HCV анализ крови. Тем не менее, существует перечень состояний, которые являются показанием к проведению данного исследования, к ним относят: Желание стать донором. Наличие в анамнезе жизни заменного переливания крови или ее компонентов. Исключение гепатита С при наличии его вторичных признаков. Выяснение эффективности лечения гепатита С.
Сдавать HCV анализ крови необходимо не ранее чем через 5-6 недель после первичного предполагаемого заражения, в противном случае даже при наличии инфекции в организме, иммуноглобулины могут выработаться не в достаточном количестве и дать ложноотрицательный результат. Необходимо сдавать после двенадцатичасового перерыва в еде — прием пищи влияет на реологические характеристики плазмы. Забор проводить утром — это связано с тем, что большинство нормативных показателей рассчитывались в утренние часы, так что для снижения вероятности ложноположительного результата, необходимо следовать этому правилу. Необходимо исключить за сутки прием гормональных, антивирусных и цитостатических препаратов. Так же следует воздержаться от приема алкоголя вечером перед посещением лаборатории. Виды антител к гепатиту С Существует два основных класса антител к гепатиту С: Антитела класса IgM вырабатываются в среднем спустя 4-6 недель после инфицирования и, как правило, свидетельствуют об остром или недавно начавшемся процессе.
Антитела класса IgG образуются после первых и указывают на хроническое и затяжное течение заболевания. В рутинной клинической практике чаще всего определяют суммарные антитела к гепатиту С Anti-HCV total. Они вырабатываются на структурные компоненты вируса спустя примерно месяц после его попадания в организм и сохраняются либо пожизненно, либо до тех пор, пока инфекционный агент не будет удален. В некоторых лабораториях определяют антитела не к вирусу вообще, а к отдельным его белкам: Anti-HCV core IgG — антитела, образующиеся в ответ на структурные протеины вируса. Они появляются спустя 11-12 недель после заражения. Anti-NS3 отражают острый характер процесса.
Anti-NS4 указывают на длительность заболевания и, возможно, имеют определенную связь со степенью поражения печени. В практической деятельности наличие антител к белкам NS3, NS4 и NS5 определяют редко, поскольку это значительно повышает общую стоимость диагностики. Более того, в подавляющем большинстве случаев выявление суммарных антител к гепатиту С и уровня вирусной нагрузки бывает достаточно для постановки положительного результата, определения стадии заболевания и планирования лечения. Кроме того, зарегистрировано более 80 субтипов генома. К каждому из них образуются антитела. Показания для сдачи анализа Антитела в крови могут обнаруживаться через несколько месяцев после инфицирования.
Поэтому человек должен пройти не менее трех тестов в следующих случаях: После незащищенного полового контакта с незнакомым партнером. Доказательств того, что гепатит С может передаваться половым путем, не найдено, однако заболевание часто обнаруживается у пациентов, ведущих беспорядочную интимную жизнь. Гепатит С диагностируют у инъекционных наркоманов. Появление антител в крови возможно после стоматологической операции, нанесения татуировок или после посещения косметолога, однако подобные случаи редки. Перед сдачей крови доноры проходят тест на анти-HCV в обязательном порядке. Анализы делаются и перед хирургическими вмешательствами.
Такое исследование проводится одинаково для диагностики любого заболевания. Разница может быть лишь в исследуемом субстрате. Для этого пробирку с биоматериалом помещают в реактор, где с помощью катализаторов происходит процесс копирования молекул ДНК возбудителя инфекции.
Метод ПЦР очень быстрый и простой. В качестве результата, вы получаете заключение врача лаборанта. В результате четко будет прописано: получен положительный результат или отрицательный.
Ответ приходит на конкретную инфекцию. Когда вы сдавали палитру инфекции напротив каждого возбудителя будет указано получен положительный или отрицательный результат. Если вы сомневаетесь в результатах, покажите бланк вашему лечащему врачу.
Доктор поможет интерпретировать результат ПЦР и подберёт правильное лечение. Исследование методом ПЦР не всегда можно использовать в медицинской практике. Такие исследования не проводятся при контрольном тестировании после проведения лечения.
О принимаемых лекарствах следует предупредить медсестру, а также врача, который выполняет диагностику или назначает лечение. Исследования для оценки эффективности лечения, как правило, проводят через 1—2 недели после последнего приёма препарата. Подготовка к ПЦР-анализу мочи За 24 часа до анализа следует исключить из рациона продукты, меняющие цвет и химический состав мочи: алкогольные напитки, «красящие» овощи — свёклу и морковь, а также специи и соль. По согласованию с врачом лучше отказаться от приёма мочегонных препаратов.
Перед взятием биоматериала необходимо тщательно вымыть наружные половые органы. Женщинам рекомендуется обработать половые губы ватными тампонами: сначала — смоченными в тёплой воде с мылом, затем — смоченными в чистой воде. Движения тампона должны быть направлены от лобка к заднему проходу. Лишнюю влагу удалить чистой салфеткой.
Мужчинам следует тщательно вымыть отверстие мочеиспускательного канала тёплой водой с мылом, оттянув кожную складку, промыть водой и промокнуть чистой салфеткой. Биоматериал следует собрать в одноразовый стерильный контейнер. Его можно бесплатно получить в любом лабораторном отделении Гемотест. Инструкция по использованию контейнера Открутите крышку контейнера и положите её, не касаясь внутренней части крышки.
Соберите первую порцию мочи в контейнер.
Но полимеразная цепная реакция дает однозначный ответ, практически сразу. Потому именно ПЦР считается предпочтительным вариантом и основной мерой диагностики. Венерические инфекции. Обследование проводится в любой момент. В качестве биоматериала забирают мазок со слизистых оболочек уретры. Методика предоставляет точные результаты. С ее же помощью можно обнаружить ход течения заболевания, давность, наличие иммунитета, сопротивляемость организма.
Проводится параллельно с микробиологическим исследованием или вместо него. Зависит от ситуации. На венерические инфекции указывают такие симптомы: боли в области половых органов, рези при мочеиспускании, жжение, зуд, выделения гнойного, прозрачного характера с неприятным запахом или без такового, нарушения отхождения урины. Герпесвирусные инфекции, папилломатоз. Другими способами определить патологические процессы, ассоциированные с этими возбудителями, не выйдет. Многие из них потенциально опасны. Некоторые штаммы вируса папилломы человека крайне агрессивны, онкогенны. Могут привести к сложным формам рака.
Потому так важна ранняя диагностика. Злокачественные процессы на начальной стадии. Пока еще симптомов нет. С помощью ПЦР-анализа удается обнаружить аномальные клетки, которые имеют одну, а то и несколько мутаций генетического материала. Как правило, это случайные находки. Например, при анализе соскоба со слизистых оболочек полости рта заядлого курильщика. Благодаря такому способу удается обнаружить проблему на ранней стадии, когда как таковой опухоли еще нет. Но предпосылки — представлены в полном объеме.
Исследование иммунной реакции на того или иного возбудителя. Изучают особые вещества, которые отвечают за инактивацию и сдерживание аномальных агентов, инфекционных структур. Методика отличается от схожего по целям ИФА. Обследование на предмет генетических аномалий. В рамках диагностики наследственных патологических процессов. В качестве основного метода. Также с помощью ПЦР возможно установление отцовства, родства двух людей. Но это тема для отдельного разговора.
Для исследования забирают биоматериал. Какой именно — зависит от конкретных показаний. Обычно берут мазки со слизистых оболочек полости рта, половых органов, уретры. В качестве исходного образца изучают мочу, кровь, мокроту, слюну.
Что такое ПЦР-анализ?
ПЦР (полимеразная цепная реакция) — это метод тестирования, который способен находить генетический материал вируса непосредственно в крови пациента, слюне или любой другой жидкости, изобретенный в 1983 году американским биохимиком Кэрри Муллисом. Разобравшись, чем отличается тест ПЦР от антител на КОВИД, удастся облегчить диагностику коронавирусной инфекции, избежать лишних финансовых трат на несвоевременные или недостоверные обследования. Расшифровка ПЦР на ВПЧ Помогите расшифровать результаты ПЦР ВПЧ 16, 31, 33, 35, 52. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – наиболее информативный, точный и современный метод диагностики инфекционных заболеваний, позволяющий обнаружить возбудителя в организме пациента, даже если количество вредоносных клеток исчисляется единицами. ПЦР — это полимеразная цепная реакция. За звучной аббревиатурой ПЦР скрывается сложная и не слишком понятная для рядового пациента расшифровка — полимеразная цепная реакция.
Анализы на коронавирус. Какие сдавать и что означают результаты?
Цепочка может расти до пределов, которые задаются количеством реагентов, затем достигает состояния плато. Для обнаружения гепатита в применяют два типа реакции: количественную и качественную. Измерение проводится после каждого этапа, то есть в режиме реального времени. Это достигается при помощи флюоресцентных зондов, которые включаются в цепочку молекул и светятся в определенный период исследования. Данный способ применяют для обнаружения фрагментов ДНК, которые являются маркерами вируса гепатита. С помощью количественного метода удается точно выделить генотип вируса.
Другими словами, подсчитывают количество копий генома ВГВ на количество клеток больного. Количественный анализ дает ответы на следующие вопросы: С какой интенсивностью прогрессирует болезнь. Насколько эффективно проводимое лечение. Развилась ли резистентность к назначенным препаратам. Также количественное измерение необходимо для диагностики хронической стадии инфекции.
При острой фазе количество антител значительно выше. При антивирусной терапии повышение количества антител свидетельствует о развившейся устойчивости к лекарствам, это является сигналом для корректировки лечения. Если они отсутствуют, то пациент не заражен, при попадании возбудителя в кровь результат будет положительным. Однако, с помощью качественной реакции невозможно уточнить геном вируса, этап заболевания. Поэтому для диагностики ВГВ проводят как количественное, так и качественное измерение.
Подготовка к обследованию Для проведения анализа методом полимеразной реакции необходима венозная кровь. Это необходимо сделать утром на голодный желудок. Пациенту следует правильно подготовиться к исследованию: За 10 часов отказаться от пищи, можно пить только чистую воду. Накануне прекратить прием алкоголя, за 4 часа не курить.
Чаще всего при отрицательном результате речь идет о том, что специфические для искомого возбудителя ДНК или РНК не обнаружены. Или концентрация генетического материала ниже пороговой чувствительности теста. Как выглядит бланк результатов ПЦР анализов?
Первый вариант говорит о наличии инфекционного процесса, вызванного искомым возбудителем. Второй — об отсутствии генетического материала инфекционного агента или его количестве ниже порога чувствительности. Расшифровка результатов ПЦР исследований проводится в тот же день, когда получены результаты или в момент обращения к врачу. Время получения данных анализа составляет от нескольких часов до трех суток в зависимости от лаборатории. Идеальным можно считать вариант, когда от момента первичного обращения к врачу до интерпретации проб проходит не более суток в клиниках, оснащенных современными лабораториями. Однако и она не исключает ложноположительных или ложно отрицательных ответов. В основном это связано с погрешностями при заборе лабораторного материала.
Нельзя утверждать, что кровь может быть универсальным материалом для установки диагноза. В идеале должна забираться биологическая проба из предполагаемого места воспаления. Так, для половых инфекций более актуальным будет исследование соскоба эпителия урогенитального тракта. Ошибки могут скрываться и на этапе обработки исследуемого материала и быть технической погрешностью работы персонала. Таким образом, все достоинства метода нуклеарного поиска инфекции способны раскрыться при использовании качественных реактивов и аппаратуры высоко квалифицированным персоналом. Если вам необходимо сдать анализы на ПЦР исследования, обращайтесь к грамотным венерологам. ПЦР анализ — что это такое, расшифровка диагностики инфекционных заболеваний.
Методика ПЦР — популярная диагностика вирусов и бактерий, которая в основе своего исследования берет принципы и научную базу молекулярной биологии. Биоматериал для ПЦР исследования берется с кожи, слизистых, крови, слюны, мочи и т. Эта методика не раз доказала свою эффективность и сверхчувствительность к различным видам возбудителей поэтому многие врачи часто назначают пациентам такие анализы. ПЦР исследование: что это такое? В чем преимущества и недостатки? ПЦР сейчас повсеместно используют в медицинских клиниках для точного диагностирования вирусов и бактерий. Точное расшифровка названия ПЦР — это полимеразная цепная реакция, которая способна выявлять даже единичные бактерии и вирусы, то есть в очень малых концентрациях.
ПЦР исследует всего лишь ДНК вируса и искусственно увеличивает его генетическую информацию методом копирования, используя специальные реагенты, ферменты для каждого вируса и инфекции. Обнаружение чужеродных, нехарактерных участков ДНК- пробы указывает на наличие инфекции. Данная методика быстро и в кротчайшие сроки обнаруживает возбудителя и это значительно уменьшает время и ресурсы врача для постановки диагноза. Исследование проводится буквально 1-2 рабочих дня, чтобы точно ответить на вопрос о наличии или отсутствии инфекционного агента. Таким образом, главное преимущество анализа — это его быстрота, универсальность и высокая чувствительность. Но, однако, нередко пациенты жалуются, что результаты ПЦР-исследования получаются ложноположительными или ложноотрицательными, что подрывает доверие людей к этому анализу. Однако, дело не в самой методике, которая признана точной и эффективной, а в ряде человеческих и профессиональных факторов, среди которых нужно выделить: Игнорирование пациентом требований врача или правил подготовки к исследованию; Непрофессионализм врача; Недостаточная квалификация медицинского работника медсестра ; Дешевые реагенты лаборатории; Несоблюдение стандартов тест-систем лабораториями.
Это копирование идет в несколько этапов по типу «цепной реакции», и в конечном итоге из одной копии генетического материала могут образоваться сотни и тысячи копий. Затем идет анализ и сравнение результата с имеющейся базой данных о строении различных возбудителей. Посредством ПЦР можно не только выявить тип возбудителя, но и выдать количественный результат анализа, то есть как много возбудителей в организме человека. Метод ПЦР в настоящее время расширяет круг возможностей проводимых исследований: введение мутаций, сращивание фрагментов ДНК, и получил широкое распространение в медицине, к примеру, для установления отцовства, появление новых генов и прочее. Материал для исследования и правила его забора Материалом для ПЦР-исследования, в котором можно выявить чужеродную ДНК бактерии или ДНК или РНК вируса могут служить различные биологические среды и жидкости человека: слизи, моче, крови, мокроте, соскобе эпителиальных клеток, тканях плаценты, крови, соке простаты, околоплодные воды, плевральная жидкость.
При обследовании на инфекции, передающиеся половым путем ИППП , у мужчин и женщин забираются выделения из половых органов, мазок или соскоб из шейки матки, мазок или соскоб из уретры мочеиспускательного канала , моча. Нередко для обследования на поражение нервной системы при ряде исследований забирается спинномозговая жидкость. В пульмонологии материалом служит мокрота, плевральная жидкость. При обследовании на внутриутробные инфекции — околоплодные воды, ткани плаценты. Подготовка к сдаче материала и проведению ПЦР-диагностики Практически все пациенты, которым проводится ПЦР-диагностика, вправе рассчитывать на достоверный, точный и быстрый результат, зависящий в большой степени от возможности лаборатории, профессионализма врача-лаборанта.
Вместе с тем, многие не задумываются, что эта самая достоверность во многом зависит и от нас самих, а именно от рекомендаций лечащего доктора, образа жизни и правильности забора материала. При заборе материала требуются условия, исключающие контаминацию загрязнение материала и, соответственно, ставящие под сомнение объективность анализа. Правильная подготовка к сдаче материала не представляет особых сложностей.
Общую картину по тестированию на COVID-19 также дополняет тот факт, что среди новых заболевших появляются и вакцинированные люди, но они при этом выделяют вирус в меньшем количестве и не такое продолжительное время, констатировала замдиректора Московского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Г. Габричевского Татьяна Руженцова.
Однако сомнительный или ложный результат может давать любая тестовая система. Эксперты неоднократно выражали мнение, что ложные результаты на коронавирус связаны связаны как с ошибками медработников, так и пациентов. Иными словами, речь идет о несоблюдении правил и рекомендаций по тестированию. Еще одну версию выдвигал директор Института медицинской паразитологии, тропических и трансмиссивных заболеваний Сеченовского университета Александр Лукашев. Газете «Известия» он рассказывал, что COVID-19 — специфический вирус в том плане, что его можно не обнаружить в доступном биоматериале.
Почему "ошибаются" ПЦР-тесты - эксперт
Если результат отрицательный, человек скорее всего здоров. Но для полного исключения заражения рекомендуют повторить исследование через 7—10 дней. Если же РНК вируса обнаружена, проводят дальнейшие тесты количественный и генотипирование. Показания к проведению лабораторного теста Основным показанием к сдаче крови на гепатит С методом полимеразной цепной реакции является положительный результат иммуноферментного анализа вне зависимости от разновидности: Total, дифференцированный тест на IgG и IgM. Кроме того, провериться нужно: в период беременности тест делают дважды — в первом триместре и за 7—10 недель до родов ; при работе, связанной с повышенным риском инфицирования медсестры, лаборанты, работники донорских центров, косметологи и т.
Рост заболеваемости растет с каждым годом. Поэтому для раннего выявления инфекции лабораторные тесты на HCV рекомендуют сдавать один раз в год. Где сдать анализ При обращении в поликлинику, пациент имеет право на бесплатные анализы. Но сначала сдают тест ИФА.
И только при положительном либо сомнительном результате показано исследование методом ПЦР. Поэтому провести срочную диагностику можно обратившись в платную лабораторию, где сдать кровь на ПЦР можно в удобное для пациента время. Одновременно рекомендуют сразу проверить показатели печеночных ферментов, стандартные клинические параметры крови. Как правило, изучение крови методом ПЦР доступно практически в любой лаборатории.
Если пункт забора крови не оснащен должным оборудованием, биологический материал транспортируют для проведения исследования с соблюдением температурного режима и других условий. Проведение ПЦР в поликлинике возможно только после других обследований, результаты которых косвенно укажут на наличие гепатита С. Как правильно сдавать кровь Перед тем, как сдавать кровь на обнаружения возможного вируса, следует соблюсти ряд правил подготовки к анализу. Основные аспекты указаны в памятке: За 5—7 дней отказаться от потребления жирной, жареной пищи, алкоголя.
За 12—14 часов до проведения исследования не есть. Пить можно только воду. Сдать кровь лучше в первой половине дня. До процедуры не курить.
Также следует предупредить доктора о принимаемых лекарственных препаратах, возможных проблемах со здоровьем, хронических заболеваниях. Забор крови выполняется из вены. После окончания процедуры место прокола медсестра заклеивает стерильным пластырем, предупреждает о необходимости согнуть руку и держать ее в таком положении 10—15 минут. В противном случае высока вероятность появления болезненной гематомы.
Сколько по времени делается исследование? Сколько делается анализ, зависит от лаборатории. Средний срок выполнения колеблется в пределах 1—3 дней. Некоторые клиники предоставляют платную услугу быстрой постановки ПЦР, однако время проведения ограничивается возможностями медицинской аппаратуры.
В поликлинике результаты могут передаваться врачу в течение 7—10 дней. Это связывают с большим наплывом пациентов. При этом биологический материал хранится в соответствии со всеми требованиями.
Типа анализов.
Реактивы для количественных ПЦР-тестов более дорогие, а методика сложнее, так что количественные тесты дороже качественных. Чтобы сравнить цены в разных клиниках, мы выбрали один анализ — на гепатит С, для которого берут кровь из вены. Цены указаны с учетом взятия крови. Запомнить ПЦР-тесты помогают обнаружить фрагменты генетического материала бактерий, вирусов или других людей.
Диагностику заболевания в инкубационном периоде. Анализ определяет возбудителя, а не реакцию организма на него. Выходит, что можно поставить точный диагноз, когда болезнь еще никак себя не проявила. Для анализа подходит большинство разновидностей биоматериала — слизь, моча, кровь, сыворотка, мокрота, эякулят, соскоб эпителиальных клеток, гной, жидкости из абсцессов. Особенности применения ПЦР-теста Метод используют везде, где нужен быстрый, точный и надежный результат. Возбудители многих инфекций имеют несколько штаммов, поэтому точная диагностика гарантирует и эффективность лечения.
Анализ проверен временем, тщательно апробирован клинически, поэтому его часто назначают в качестве дополнительного обследования, чтобы выявить определенный тип вируса или микроба. Кроме медицины метод нашел применение в генетике, криминалистике, археологии. ПЦР-диагностика играет ведущую роль в выявлении неврологических и урологических заболеваний. Использование передовых технологий позволяет: определить причины острых уретритов — берут соскоб клеток из мочеиспускательного каналы у мужчины или женщины, влагалища, цервикального канала; диагностировать циститы, особенно хронические — через мочу или соскоб из шейки мочевого пузыря; тщательно обследовать простатит — берется секрет простаты; определить воспалительные заболевания головки полового члена и крайней плоти — соскоб клеток высыпаний; диагностировать ряд кожных патологий. В гинекологии ПЦР-анализы — обязательная диагностическая процедура, входящая в профиль обследований различных женских патологий. В первую очередь это диагностика широкого спектра заболеваний, передающихся половым путем.
Они заболевают еще быстрее, а порой просто увольняются. В результате две недели назад коммерческие лаборатории просто остановились, поскольку все стало совсем плохо", - считает Раманкулов. Директор Национального центра биотехнологии отмечает, что "летняя" пневмония в 98 процентах случаев - вирусная. Если у вас все симптомы коронавируса, а результаты теста оказались отрицательными, то это ничего не означает. Значит, плохо выделили РНК.
Нужно сдавать еще раз", - говорит он. И добавляет: "Я бы посоветовал людям, которые чувствуют у себя легкую форму коронавируса, не сдавать тест. Ведь человек без хронических заболеваний перенесет все легко. Даже если вы с помощью ПЦР узнаете, что это коронавирус, что это изменит? В больницу все равно вас не примут, а если и примут, то положат в лучшем случае в коридоре.
И за вами будут ухаживать загнанные медсестры, которые на вас даже внимание обращать не будут". Поэтому, говорит он, сдавать тест стоит только при симптомах. Не бойтесь ехать в лабораторию сдавать тест. Для вас уже никто не представляет опасности, так как вы уже заболели коронавирусом", - добавляет специалист. Что такое экспресс-тест?
Осталось лишь разграничить понятия "ПЦР" и "экспресс-тест". Если первый показывает, есть в организме вирус или нет прямо сейчас, то второй указывает на наличие антител.
ПЦР: сверхчувствительная диагностика инфекций
Их уровень снижается после выздоровления, примерно к 1,5- 2 месяцам после инфицирования. Иммуноглобулины G IgG синтезируются последними, через 5-6 недель с момента попадания вируса в организм, и сохраняют информацию о коронавирусе. Обычно IgG являются архивом памяти перенесеных инфекций, в большинстве случаев пожизненно, либо на несколько лет. Механизмы развития иммунной реакции на коронавирус пока изучаются. Неясно, стойкий иммунитет формируется или нет. Это предстоит узнать. Но в любом случае, выявление IgG свидетельствует о факте попадания коронавируса в организм и иммунном ответе организма.
Кому показаны тесты на определение антител к новой коронавирусной инфекции - Тем, кто хочет узнать, перенес он инфекцию или нет независимо от того, были признаки простуды или не было. Только следует понять, что если были подозрительные признаки, целесообразнее обследоваться на IgG спустя 5 недель от предполагаемого периода. Если признаков не было, сроки неважны, обследуйтесь в любое время. Иногда такое бывает. Это комплексный тест, определяет иммуноглобулины классов М и G, результат по каждому антителу. Выполняется иммунохроматографическим методом ИХГА.
Возможен ложноположительный результат при хронических заболеваниях Поэтому целесообразно провести исследование мазка из зева методом ПЦР. Если результат ПЦР отрицательный или нет признаков болезни, повторить тест на антитела через 2-3 недели.
Он фиксирует лишь факт заражения, но не определяет, стал ли конкретный вид ВПЧ провокатором заболевания. Однако вместе с цитологическим мазком, такой ПЦР-анализ повышает эффективность выявления ассоциированных с ВПЧ заболеваний половых органов. Количественный анализ ПЦР Количественный анализ диагностически более значим, чем качественный, ведь он определяет вирусную нагрузку на организм. Обычно назначается при положительных результатах качественного теста. Концентрация вируса в тканях отражает тяжесть течения инфекции, позволяет врачу составить прогноз ее течения с учетом клинических симптомов или отследить результативность проведенного лечения.
В количественном анализе подсчитывается число копий вируса, приходящихся на число клеток эпителия. Это значит, что вирус для организма неопасен и, скорее всего, иммунная система успешно подавит его. Такой результат у женщины дает основания для беспокойства. Скорее всего, врач назначит кольпоскопию с биопсией, чтобы выяснить, в каком состоянии находится эпителий шейки матки. При лечении заболеваний, ассоциированных с ВПЧ, имеет значение отслеживание вирусной нагрузки в динамике. Если же вирусная нагрузка в контрольных анализах через 3, 6 9, 12 месяцев после лечения на порядок увеличилась — это признак рецидива инфекции. Крем и таблетки: цена, отзывы, аналоги Результаты количественного или качественного анализа обычно готовы уже на следующий день после сдачи.
Он позволяет выявить конкретные штаммы, присутствующие в клинически значимой концентрации. Этот анализ и самый дорогой. Его цена примерно в два раза выше, чем у качественного анализа на такое же количество штаммов в среднем 2200 против 1200 не считая стоимости забора материала. Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью. Поэтому многие развитые страны включают в скрининговое исследование именно его. Тест может быть комплексным — для группы низкого и повышенного риска, или проводиться отдельно для каждой группы. Оценивается только присутствие вирусов в клинически значимой концентрации, то есть одновременно оценивается и вирусная нагрузка.
В группе высокоонкогенных вирусов проверяется наличие 13 типов: 16, 18, 31, 33, 39, 35, 45, 51, 52, 56, 59, 58, 68 штаммов. В группе вирусов с низким риском — 6, 11, 42, 44, 43. Полученные результаты не дифференцируются по штаммам. Ошибки при нахождении штамма практически исключены. Концентрация обозначается в других единицах, нежели в анализе ПЦР — не в геном-эквивалентах, а в относительных единицах они отражают отношение количества копий вируса к значению, которое считается пороговым. Положительным считается результат, превышающий 1 относительную единицу. В отличие от ПЦР-анализа, ответы Digene-теста клиники готовят в течение 10 дней.
Если получен результат ниже количественно значимого порога, будет выдан ответ «не обнаружено». Поэтому результаты дайджен-теста и качественного ПЦР-анализа, в котором даже минимальное количество вируса считается положительным результатом, могут быть противоположными. Врачи рекомендуют проходить digene-тест, поскольку при прочих равных он выгоднее в финансовом плане — после получения результатов не придется отдельно проводить количественный анализ. Подготовка к анализам Как уже говорилось, и в ПЦР-анализе, и в дайджин-тесте используется генетический материал. Для его получения необходимо выполнить забор клеток эпителия из урогенитального тракта. Обычно у женщин берут соскоб из цервикального канала, у мужчин — из уретры. Иногда используется материал из прямой кишки, полости рта — при наличии там новообразований.
В отличие от многих других ПЦР-анализов, при исследовании ВПЧ не используют кровь, поскольку вирус в ней практически не обнаруживается. Рекомендации для женщин: Чтобы получить достоверные результаты, женщине рекомендуют сдавать анализ не раньше чем через 5 дней после начала менструального цикла и не позже чем за пять дней до его окончания.
Результат становится отрицательным по истечении шести-девяти месяцев после терапии. Какой врач проводит расшифровку ПЦР-исследований Первично назначается анализ либо венерологом, либо урологом, либо гинекологом для женщин. Оценка анализа и выставление результатов в бланке ответа — это функция врача-лаборанта, проводившего исследование. Дальнейшая интерпретация полученных данных — это функционал узкого специалиста, к которому обращается пациент. Врач назначает такие исследования обычно при: признаках острого воспаления урогенитального тракта, для уточнения причины воспаления, перед планируемой беременностью или эко, у беременных с отягощенной акушерской историей, для контроля эффекта от проводимого лечения по поводу вензаболевания не раньше, чем спустя месяц после окончания терапии , в качестве скрининга для исключения бессимптомного течения инфекции при наличии более одного партнера за год. Методы молекулярной биологии имеют важное от культуральных или серологических методик отличие.
Они не требуют определенного накопления возбудителя или антител к нему и чувствительны практически сразу от момента заражения. Нет смысла выдерживать паузу в течение предполагаемого инкубационного периода венерической инфекции. Анализ можно сдавать сразу после того, как возникли подозрения о возможном заражении или развитии инфекционного агента. ПЦР: результат отрицательный Отсутствие возможности даже ускоренного ферментами удвоения фрагментов генетического материала говорит об отрицательном результате исследования.
В соответствии с названием, качественный метод отвечает только лишь на вопрос, присутствует ли вирус в организме; при исследовании же количественным методом мы получаем информацию, сколько именно единиц вируса содержится в 1 мл крови, то есть можем судить о том, насколько активно размножается вирус. Вирус гепатита С имеет 6 генотипов и большое число подтипов. В нашей стране наиболее распространены первые генотипы 1, 2 и 3. Основная информация, которую дает врачу результат данного анализа, - к каким препаратам вирус чувствителен, то есть определяет выбор правильной схемы лечения. Конечно, в наше время существуют уже и так называемые «пангенотипические» схемы, которые эффективны против всех генотипов вируса.
Однако в случае, если генотип вируса известен, количество схем, из которых можно выбирать наиболее подходящую каждому конкретному пациенту с учетом сопутствующих заболеваний и других лекарственных препаратов, которые тот принимает , существенно расширяется. Также данный результат дает дополнительную информацию при дальнейшем наблюдении за пациентом. В случае, если после проведенного курса терапии вновь выявляется вирус, можно с большей вероятностью выяснить, является ли это неудачей лечения или повторным заражением. Именно поэтому в современных рекомендациях по лечению гепатита С — как в Европе, так и в Америке рекомендуется проводить генотипирование до начала терапии.
Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
| ПЦР тест: что это такое? — Блог MyGenetics | Как расшифровать ПЦР Как работает ПЦР тест Ответы на эти и другие вопросы читайте в статье на нашем сайте. |
| Результаты ПЦР | Молекулярное тестирование, включая тестирование с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР), выявляет генетический материал вируса и, таким образом, может определить, инфицирован ли человек SARS-CoV-2 в настоящее время. |
| Что такое анализ ПЦР? - статья лаборатории ДНКОМ | Расшифровка ПЦР на ВПЧ Помогите расшифровать результаты ПЦР ВПЧ 16, 31, 33, 35, 52. |
Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК
Кроме медицины метод нашел применение в генетике, криминалистике, археологии. ПЦР-диагностика играет ведущую роль в выявлении неврологических и урологических заболеваний. Использование передовых технологий позволяет: определить причины острых уретритов — берут соскоб клеток из мочеиспускательного каналы у мужчины или женщины, влагалища, цервикального канала; диагностировать циститы, особенно хронические — через мочу или соскоб из шейки мочевого пузыря; тщательно обследовать простатит — берется секрет простаты; определить воспалительные заболевания головки полового члена и крайней плоти — соскоб клеток высыпаний; диагностировать ряд кожных патологий. В гинекологии ПЦР-анализы — обязательная диагностическая процедура, входящая в профиль обследований различных женских патологий. В первую очередь это диагностика широкого спектра заболеваний, передающихся половым путем. Врач может назначить анализ при подозрении на хламидиоз, гонорею, герпес, вирусы папилломы человека.
В качестве биоматериала обычно выступают кровь, моча или вагинальный соскоб. Метод ПЦР — наиболее точный способ выявления Covid-19. Его преимущество в том, что он обнаруживает сам вирус. Подтвердить патогенного агента удастся даже при бессимптомном течении заболевания. И, наоборот, диагностика не даст положительного результата, если много антител, а самого вируса уже нет.
Для проведения теста у вас возьмут образец слизи из носа или горла.
В пробирке мы можем создать такую функцию, которую можно сравнить с поиском текста в компьютере. Сначала с помощью компьютера в базе данных генома человека мы подбираем две маленькие строчки, между которыми должен располагаться искомый текст. С помощью специального аппарата мы выращиваем нужные цепочки ДНК из последовательности букв нуклеотидов , получаем эти маленькие строчки в виде химического вещества в пробирке, добавляем в неё необходимые реактивы, меняем температуру, и в итоге получаем нужный нам участок генома. Дальше его можно анализировать с помощью разных способов. Как анализ конкретных участков ДНК помогает в лечении онкозаболеваний? Мы постоянно ищем такие участки. Отбираем группу пациентов с похожими заболеваниями, достаточно дорогостоящими методами анализируем всю кодирующую последовательность их геномов и смотрим какие-то закономерности, к примеру, что у этой группы встречается с большей вероятностью какой-то генетический вариант.
Дальше мы этот вариант будем проверять на расширенной группе больных и здоровых людей. Чтобы это сделать, мы разрабатываем ПЦР-тест, который будет «смотреть» конкретно этот вариант из всего генома, есть он у человека или нет. Если это наследственные раковые синдромы, которые мы ищем, то выделяем ДНК из крови. Также есть тесты на соматические мутации, но здесь уже используется биопсийный материал опухоли, в основном речь идет о выборе терапии, например, таргетных препаратов. Что это значит? Мы находимся только в первой половине этого пути познания и понимания. На самом деле это даже не расшифровка в буквальном смысле, а только прочитывание отдельных букв и слов, в отдельных случаях даже без понимания смысла. Мы понимаем только определенные слова — как последовательность ДНК преобразуется в последовательность белка — это и есть генетический код.
Только в прошлом году произошел значимый прогресс в предсказании того в какие объемные структуры превращаются эти белковые последовательности. Этому способствовало развитие методов глубокого машинного обучения и искусственных нейронных сетей.
Иногда перечень, наоборот, сокращается до «ПЦР 4» гонорея-трихомониаз-хламидиоз-микоплазмоз. ПЦР качественная и ПЦР количественная У этих двух видов ПЦР-диагностики принципиально разные цели: качественный анализ даёт ответ на вопрос, имеется ли вообще у пациента искомый микроб, то есть просто «да» или «нет».
Только что рассмотренный комплекс ПЦР 12 относится как раз к этой категории. Но существует ещё количественный анализ, или ПЦР в режиме реального времени. Метод основывается на том, что число новых ампликонов копий заданного участка ДНК возбудителя болезни прямо пропорционально их исходному количеству. То есть если в пробе с самого начала было много вредоносных молекул ДНК, то с каждым циклом полимеразной цепной реакции их будет становиться вдвое больше, а к концу процесса накопятся миллионы.
Современные приборы амплификаторы следят за тем, как меняется количество копий, и по итогам исследования вычисляют примерную концентрацию возбудителя в организме пациента. Для чего это нужно? В случае с бактериями, простейшими или грибками подобные сведения имеют спорную диагностическую ценность, поскольку численность колоний постоянно меняется под воздействием самых разных факторов, да и уничтожить такие микроорганизмы сравнительно просто. Другое дело — вирус.
Это неклеточная форма жизни, которую невозможно истребить подобно тому, как антибиотики справляются с бактериями. В борьбе с вирусами человек может твёрдо рассчитывать только на свой иммунитет, а возможности противовирусных средств сильно ограничены. Именно когда дело касается вирусов, становится особенно актуальной методика ПЦР в режиме реального времени. Вирусная нагрузка или виремия — это степень тяжести поражения организма вирусом.
Показатель рассчитывается путём определения числа вирионов в биологическом материале, измеряется в МЕ или в количестве копий на 1 мл крови и служит для контроля над ходом терапии и предупреждения распространения вируса. Но и в случае с другими вирусами определение нагрузки может оказаться полезным — например, когда речь идёт о цитомегаловирусе, герпесе или папилломовирусе. Анализ поможет понять, грозит ли человеку очередное обострение болезни, и насколько высока вероятность передачи инфекции.
ПРЦ определяет наличие всего 10—100 клеток в пробе, тогда как иммунологическими и микроскопическими тестами можно определить наличие инфекции при количестве клеток не менее 103—105. Сходство состава всех ДНК или РНК дает возможность применять универсальные методы лабораторных исследований, диагностируя сразу несколько возбудителей из одной биологической пробы. Скорость получения результатов. Поскольку для проведения ПЦР-диагностики не нужен посев и выделение культуры возбудителя, то и большого количества времени на нее не требуется.
Весь цикл — от забора биоматериала до получения результатов — занимает 4—5 часов. Диагностика латентных инфекций. ПЦР-методом диагностируются трудно культивируемые и некультивируемые формы микроорганизмов, встречающиеся в тех случаях, когда заболевание протекает в скрытой форме. Методом ПЦР можно выявлять возбудителей инфекции не только в организме человека, но и в почве, воде, продуктах питания. Ограничения метода Тем не менее не стоит думать, что ПЦР-диагностика не имеет недостатков. У нее есть свои ограничения, но их количество настолько незначительно, что не может отрицательно повлиять на популярность и эффективность метода: Вероятность амплификации ДНК не только живого, но и погибшего микроорганизма. При проведении ПЦР-диагностики для контроля эффективности лечения необходимо соблюдать определенные требования.
В частности, проводить ПЦР нужно после определенного промежутка времени 1—2 месяца , за который происходит полное исчезновение возбудителя инфекции в организме. Возможность возникновения перекрестной реакции. Подбор фрагментов ДНК праймеров осуществляется на основе знаний о генетическом строении конкретного микроорганизма. Но теоретически такой же фрагмент может присутствовать и у других микроорганизмов, геном которых на сегодняшний день еще не расшифрован. Их присутствие в пробе может привести к ложноположительному результату анализа. Изменчивость микроорганизмов. Эта способность возбудителей к мутации иногда приводит к тому, что некоторые их штаммы становятся неуловимыми в процессе ПЦР-анализа.
Чтобы уменьшить риски, разработаны стандарты объемов испытаний тест-систем ПЦР-диагностики, включающие проверку на перекрестные реакции и тестирование всех известных штаммов конкретного возбудителя. Забор биоматериала. Процедура, предшествующая непосредственному анализу, которая осуществляется в процедурном кабинете соответствующего профиля. Забор делается с помощью стерильного оборудования только в стерильные пробирки. Материалом для исследования могут быть: Эпителиальные соскобы со слизистых оболочек: из уретры, из цервикального канала, со слизистой дыхательных путей и зева, из конъюнктивы. Забор проводится с помощью специального ершика, при этом недопустимо попадание в материал следов крови. Собираются первые 50 г утренней мочи в стерильную емкость.
Материал используется для диагностики мочеполовых инфекций. Используется для ПЦР-диагностики туберкулеза и респираторных форм микоплазмоза и хламидиоза.