Полимеразная цепная реакция, ПЦР (англ. Если человек сдал тест на коронавирус, а результат оказался положительным, то это означает, что он является носителем вируса, в данный момент болеет COVID-19 или уже вылечился, но в его организме сохранились антитела. ПЦР (полимеразная цепная реакция) – это прямой метод выявления возбудителя, то есть с помощью него можно определить РНК вируса со слизистой ротоглотки или носоглотки, то есть можно определить сам коронавирус. Как работает ПЦР тест на коронавирус. ПЦР-тестирование (также известное как тестирование полимеразной цепной реакции) — это тип лабораторного исследования, который сообщает, есть ли у кого-то в настоящее время COVID-19.
Как определить коронавирус или что такое анализ ПЦР?
ПЦР (полимеразная цепная реакция) – это высокоточный метод молекулярно-генетический диагностики. метод применяется в медицине, биологии, ветеринарии, криминалистике, санитарной службе и других отраслях деятельности человека. Если его результат положительный, то этот результат верный. «Если экспресс-тест показал положительный результат, а ПЦР-тест — отрицательный, такое может быть, потому что вирусы не сидят и не ждут. ПЦР или полимеразная цепная реакция является золотым стандартом в диагностике многих инфекций. Если у человека положительный ПЦР-тест, первое, что он должен сделать — это позвонить в свое лечебное учреждение.
Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
Излечился, а ПЦР положительный: врач объяснила причину. 44300. Излечился, а ПЦР положительный: врач объяснила причину. 44300. ПЦР тест на коронавирус – это анализ полимеразной цепной реакции (PCR), который проводится с помощью взятия мазка со слизистой рта и носоглотки и позволяет диагностировать даже бессимптомное течение болезни. Пцр положительный обозначает, что в организме человека присутствует ДНК или РНК возбудителя. Оценивать результаты реакции должен практический врач, который лечит конкретного больного. Положительный результат ПЦР теста означает, что пациент в настоящее время инфицирован определенным патогеном.
ПЦР-диагностика
Обнаружение инфекции заключается в нахождении фрагментов ДНК дезоксирибонуклеиновой кислоты патогенного микроорганизма или его штаммов в крови, слюне, соскобе эпителиальных клеток, спинномозговой жидкости и других биологических жидкостях. ПЦР может быть положительна как на «мертвую» инфекцию, так и на активную инфекцию. Если инфекция была пролечена и «убита», то ее следы а точнее фрагменты ДНК все равно будут циркулировать в организме.
Если результат положительный — его повторяют, и только в случае двойного положительного результата пациенту сообщают о болезни. Анна Солдатова.
Этот человек является вирусовыделителем. Иногда мы таких пациентов выписываем, но предупреждаем, что нужно изолироваться. Андрей Поздняков, врач-инфекционист, главный врач клинико-диагностической лаборатории ООО «Инвитро — Сибирь», напротив, замечает, что сейчас превалирующим штаммом является «дельта», кардинальное отличие которого заключается в том, что он активно размножается в организме: — Отсюда его способность «пробивать» иммунную защиту. Более активное размножение в сравнении ведет к тому, что вирусных частиц на оболочках слизистых становится на несколько порядков больше. Соответственно, они более длительное время могут улавливаться методиками обнаружения, в том числе ПЦР. То есть время выделения вируса просто стало больше. Андрей Поздняков подтверждает, что при положительном тесте, который приходит на протяжении долгого времени, есть вероятность, что это РНК уже инактивированного вируса, но ПЦР-методика не может дифференцировать РНК «неживого» вируса от РНК жизнеспособного. Поэтому определить, заразен ли человек при получении положительного результата ПЦР, не представляется возможным. Терапевт Ирина Непомнящих объясняет, что в такой ситуации нужно изолироваться и ждать отрицательного результата: — Сейчас часто бывает, что ПЦР долгое время остается положительным. Ничего не нужно делать — просто сдавать тест и сидеть дома до отрицательного результата. Это могут быть остатки разрушенного вируса. Именно они могут давать такой результат, но пока нужно всё равно сдавать тесты. Ранее мы рассказывали, почему долгое время держится температура 37 и что с этим делать.
При обследовании на внутриутробные инфекции — околоплодные воды, ткани плаценты. Подготовка к сдаче материала и проведению ПЦР-диагностики Практически все пациенты, которым проводится ПЦР-диагностика, вправе рассчитывать на достоверный, точный и быстрый результат, зависящий в большой степени от возможности лаборатории, профессионализма врача-лаборанта. Вместе с тем, многие не задумываются, что эта самая достоверность во многом зависит и от нас самих, а именно от рекомендаций лечащего доктора, образа жизни и правильности забора материала. При заборе материала требуются условия, исключающие контаминацию загрязнение материала и, соответственно, ставящие под сомнение объективность анализа. Правильная подготовка к сдаче материала не представляет особых сложностей. Существуют следующие рекомендации врачей для пациентов: 1 не жить половой жизнью за сутки до сдачи материала; 2 кровь для исследования сдается утром натощак не есть, не пить ; 3 при сдаче мочи собирается первая утренняя порция в чистый стерильный контейнер. Сроки готовности ПЦР-анализа Окончательный результат готов через 1,5-2х суток после сдачи материала. В некоторых случаях результат готов в первый же день. Расшифровка результатов ПЦР Отрицательный результат ПЦР указывает на то, что в исследуемом материале на момент его сдачи не обнаружено никаких следов инфекционных агентов. Большинство случаев показывает отсутствие инфекции, которую пытались найти в исследуемой пробе. Положительный результат ПЦР указывает на выявление следов инфекции в исследуемой биологической пробе. С большой точностью положительный результат указывает на наличие инфекции в данный момент времени. Существуют ситуации, когда ПЦР оказывается положительной, а об активной инфекции говорить нельзя — это так называемое «здоровое носительство» без клинических симптомов болезни, которое не требует лечения, но требует динамического наблюдения у врача.
Результаты ПЦР диагностики
В настоящее время ПЦР-диагностика подвергается существенному развитию. Происходит совершенствование самого метода, вновь и вновь появляются новые разновидности ПЦР, на медицинский рынок поступают новые тест-системы для данной реакции. Благодаря этому стоимость ПЦР-исследований с каждым годом становится доступнее для широкого круга пациентов. В ходе исследования копируется только тот участок, который подходит под заданные условия, и только в ситуации присутствия его в исследуемой пробе. Например, материал для исследования, в котором предполагается наличие фрагментов ДНК или РНК возбудителя слюна, кровь, моча, выделения из половых органов , помещается в специальный реактор амплификатор. Далее к нему добавляются специфические ферменты, которые связываются с ДНК или РНК патогена, и происходит синтез ее копии. Это копирование идет в несколько этапов по типу «цепной реакции», и в конечном итоге из одной копии генетического материала могут образоваться сотни и тысячи копий. Затем идет анализ и сравнение результата с имеющейся базой данных о строении различных возбудителей. Посредством ПЦР можно не только выявить тип возбудителя, но и выдать количественный результат анализа, то есть как много возбудителей в организме человека. Метод ПЦР в настоящее время расширяет круг возможностей проводимых исследований: введение мутаций, сращивание фрагментов ДНК, и получил широкое распространение в медицине, к примеру, для установления отцовства, появление новых генов и прочее.
Материал для исследования и правила его забора Материалом для ПЦР-исследования, в котором можно выявить чужеродную ДНК бактерии или ДНК или РНК вируса могут служить различные биологические среды и жидкости человека: слизи, моче, крови, мокроте, соскобе эпителиальных клеток, тканях плаценты, крови, соке простаты, околоплодные воды, плевральная жидкость. При обследовании на инфекции, передающиеся половым путем ИППП , у мужчин и женщин забираются выделения из половых органов, мазок или соскоб из шейки матки, мазок или соскоб из уретры мочеиспускательного канала , моча. Нередко для обследования на поражение нервной системы при ряде исследований забирается спинномозговая жидкость.
У меня есть случаи, когда пациент был два с половиной месяца ложноположительный по ПЦР, это было в первую волну. И представляете, он измучился, не мог с карантина выйти Антон Ершов Доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор По словам практикующего врача, понять, что результат теста ложноположительный, можно на двух основаниях: отсутствие каких-либо симптомов болезни и как минимум два отрицательных ПЦР-теста в следующие несколько дней. Просто делаем нормальную санацию слизистой, очищаем её от этого всего, промываем и так далее — и потом дважды пациент ПЦР сдаёт, и он отрицательный Антон Ершов Доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Кроме того, иногда тест находит ковидные РНК у здорового человека в тот момент, когда вирус только что оказался на слизистой оболочке и ещё не успел там обосноваться, добавил профессор. Я вакцинирован, причём с хорошим титром, и не заражусь.
Поставить диагноз на основании полимеразной цепной реакции можно через 48 часов после сдачи биологического материала, что дает возможность своевременно начать лечение. Возможность количественного анализа. Эта характеристика важна при выявлении заболеваний, вызываемых условно патогенной микрофлорой например, кандидоза. К недостаткам ПЦР-диагностики можно отнести необходимость в высокотехнологичном оборудовании и высококвалифицированных специалистах. Кроме этого, из-за крайне высокой чувствительности есть риск неверного результата, если пациент инфицирован сразу несколькими видами микроорганизмов. Специфичность и применение Анализ методом полимеразной цепной реакции стал «золотым стандартом» для выявления ряда инфекций. Сегодня можно говорить о том, что такое исследование проверено временем, а строгие клинические испытания только подтвердили его эффективность и точность. Метод ПЦР позволяет определить наличие возбудителя заболевания, даже если в образце присутствует всего несколько молекул ДНК. ПЦР диагностирует наличие патогенов, которые растут в течение длительного времени, не прибегая к трудоемким процедурам, что особенно важно в гинекологии и урологии при выявлении различных урогенитальных инфекций, передающихся половым путем. Такой анализ позволяет обнаружить даже одну бактериальную или вирусную клетку, что зачастую невозможно при использовании других иммунологических, бактериологических или микроскопических методик. Метод эффективен даже для форм микроорганизмов, которые трудно диагностировать или невозможно культивировать в лабораториях. Именно поэтому процедуру часто применяют для обнаружения скрытых и хронических инфекций. В основе специфичности такого анализа — образование комплементарных комплексов между матрицей и праймерами — небольшими синтетическими нуклеотидами. В результате этого каждая из таких частей комплементарна с одной из цепей двуцепочечной матрицы, то есть позволяет выявить начало и конец участка. Метод обладает высокой антигенной изменчивостью, поэтому очень эффективен для выявления внутриклеточных микроорганизмов. С помощью метода ПЦР можно обнаружить патогены не только в полученном клиническом материале от пациента, но даже в мазке с поверхностей и т. Поэтому методика имеет широкую сферу применения.
Температура отжига зависит от состава праймеров и обычно выбирается на 5 градусов меньше, чем температура плавления праймеров. Неправильный выбор температуры отжига приводит либо к плохому связыванию праймеров с матрицей при завышенной температуре , либо к связыванию в неверном месте и появлению неспецифических продуктов при заниженной температуре. Время стадии отжига — 30 секунд [ источник не указан 800 дней ], одновременно, за это время полимераза уже успевает синтезировать несколько сотен нуклеотидов. Элонгация править ДНК-полимераза реплицирует матричную цепь, используя праймер в качестве затравки. Это — стадия элонгации. Температура элонгации зависит от полимеразы. Время элонгации зависит как от типа ДНК-полимеразы, так и от длины амплифицируемого фрагмента. Обычно время элонгации принимают равным одной минуте на каждую тысячу пар оснований. После окончания всех циклов часто проводят дополнительную стадию финальной элонгации, чтобы достроить все одноцепочечные фрагменты. Эта стадия длится 7—10 минут. Количество специфического продукта реакции ограниченного праймерами теоретически возрастает пропорционально 2n — 2n, где n — число циклов реакции [15]. Число «длинных» копий ДНК тоже растёт, но линейно, поэтому в продуктах реакции доминирует специфический фрагмент. Рост требуемого продукта в геометрической прогрессии ограничен количеством реагентов, присутствием ингибиторов , образованием побочных продуктов.
Диагностика инфекций методом ПЦР: что это такое?
Врач-инфекционист Андрей Поздняков говорит, что при положительном тесте, который приходит на протяжении долгого времени, есть вероятность, что это РНК уже инактивированного вируса, но ПЦР-методика не может дифференцировать РНК «неживого» вируса от РНК жизнеспособного. Поэтому определить, заразен ли человек при получении положительного результата ПЦР, не представляется возможным. Поэтому единственной гарантией от дальнейшего распространения вируса в данном случае может служить продолжение изоляции. Это могут быть остатки разрушенного вируса. Именно они могут давать такой результат, но пока нужно всё равно сдавать тесты. Владимир Болибок полагает, что само ощущение выздоровления у человека может быть ложным — пациент может чувствовать себя хорошо относительно того состояния, которое было при госпитализации или начале болезни. После затяжного течения вирусной инфекции было бы целесообразно обратиться за консультацией к иммунологу.
Что означает ПЦР положительный анализ? Если при проведении метода полимеразной цепной реакции выявляется ДНК искомого организма, такой анализ ЦПР является положительным. Данный результат показывает, что в организме в текущее время присутствует возбудитель. Хоть эти методы и направлены на одни и те же цели, механизм действия у них отличается: ПЦР показывает наличие элементов ДНК или РНК возбудителя в биологическом материале. Для ПЦР чаще используется материал из предполагаемого очага инфекции. ИФА или анализ на антитела позволяет идентифицировать реакцию антиген-антитело. Иммуноферментный анализ используется для уточнения стадии заболевания. ИФА анализ крови на антитела показывает наличие иммуноглобулинов в крови.
Наличие антител определяется вне зависимости от места локализации очага инфекции Анализ крови на антитела поможет обнаружить в крови наличие: Иммуноглобулинов типа IgA Иммуноглобулинов типа IgG Иммуноглобулинов типа IgM Обнаружение в крови Иммуноглобулинов типа говорит об активном инфекционном процессе IgM.
Нормой в ответах ПЦР считают отрицательный результат, указывающий на отсутствие фрагментов чужеродных нуклеиновых кислот, положительный ответ будет свидетельствовать о наличии инфекции в организме, цифровые значения означают состояние вируса и его концентрацию на момент тестирования. Однако полную расшифровку анализа осуществляет врач, прошедший специальную учебу по теме «ПЦР». Пытаться же интерпретировать результаты самостоятельно не имеет никакого смысла, поскольку можно, что скорее всего и произойдет, неправильно понять и начать заранее волноваться. Чего «боится» ПЦР, что она умеет и как к ней подготовиться?
Как в любых других исследованиях, иной раз результаты теста оказываются ложноположительными или ложноотрицательными, где ПЦР исключением не является. Подобное может происходить в случаях: Нарушения технологического процесса на одном из этапов реакции; Несоблюдения правил забора материала, его хранения или транспортировки; Присутствие посторонних примесей в материале. Это говорит о том, что к ПЦР — диагностике инфекций нужно подходить внимательно, осторожно и аккуратно, иначе образцы материала могут поменять свое структурное строение или вовсе разрушиться. Этапы ПЦР-диагностики. Ложные результаты могут дать нарушения на любом из этапов исследования ПЦР-диагностика инфекций относится к категории «золотых стандартов» среди других лабораторных методов, поэтому ее можно применить для поиска возбудителей многих заболеваний, на первый взгляд не имеющих ничего общего между собой: Туберкулез различной локализации, пневмония в том числе и атипичная, вызванная хламидией ; Детские инфекции коревая краснуха, паротит, корь ; Дифтерия; Зоонозная инфекционная болезнь — листериоз заболевание характеризуется многообразием симптомов с поражением лимфоузлов, ЦНС, внутренних органов ; Заболевания, обусловленные проникновением вируса Эпштейн-Барра инфекционный мононуклеоз и др.
Доказано, что хеликобактер становится причиной развития рака желудка или 12-перстной кишки; Кандидоз и практически все ЗППП. ПЦР-диагностика инфекций, передающихся половым путем, имеет особую значимость, поскольку заболевания, вызванные таким образом, часто длительное время протекают без каких бы то ни было клинических проявлений, зато при беременности начинают активизироваться и, таким образом, угрожать здоровью и даже жизни ребенка. Некоторые из них «торч» относятся одновременно и к ИППП, поэтому последние требуют более подробного рассмотрения.
Что означает ПЦР положительный анализ? Если при проведении метода полимеразной цепной реакции выявляется ДНК искомого организма, такой анализ ЦПР является положительным. Данный результат показывает, что в организме в текущее время присутствует возбудитель. Хоть эти методы и направлены на одни и те же цели, механизм действия у них отличается: ПЦР показывает наличие элементов ДНК или РНК возбудителя в биологическом материале. Для ПЦР чаще используется материал из предполагаемого очага инфекции.
ИФА или анализ на антитела позволяет идентифицировать реакцию антиген-антитело. Иммуноферментный анализ используется для уточнения стадии заболевания. ИФА анализ крови на антитела показывает наличие иммуноглобулинов в крови. Наличие антител определяется вне зависимости от места локализации очага инфекции Анализ крови на антитела поможет обнаружить в крови наличие: Иммуноглобулинов типа IgA Иммуноглобулинов типа IgG Иммуноглобулинов типа IgM Обнаружение в крови Иммуноглобулинов типа говорит об активном инфекционном процессе IgM.
Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен
По сути, это аварийная ситуация, которая требует проведения срочных мер в лаборатории. В этом исследовании ее риск минимален, поскольку пробирка после амплификации не открывается, и ампликоны во внешнюю среду не попадают. Возможные причины ложноотрицательных результатов По словам Натальи Гасиловой, здесь основная причина кроется в чувствительности тест-системы, которая применяется в конкретной лаборатории. Она позволяет выявлять вирус как у бессимптомных и контактных в начале развития инфекции, так и в конце заболевания — уже на этапе выздоровления. Но если в образце количество вируса будет меньше порога чувствительности, то лаборатория выдаст ложноотрицательный результат, — поясняет эксперт. Еще на результат влияет корректность взятия биоматериала со слизистой оболочки носо- и ротоглотки: к примеру, мазок взяли только из зева, а надо еще и из носа.
Повлияет на него также малая вирусная нагрузка в биоматериале — когда тест выполняется в самом начале болезни или, наоборот, практически при выздоровлении, когда вирус уже уходит из организма. Читайте также «Зимой в лесу грибов нет».
В 1983 году его открыл американский ученый Кэри Мюллис, за что впоследствии и получил Нобелевскую премию. Изначально метод использовался в основном для научных целей, но затем, разглядев перспективность и эффективность, его стали продвигать в практическую медицину. Что представляет собой ПЦР Анализ абсолютно специфичен.
При правильном выполнении он не может дать ложноположительный результат, поэтому его используют для диагностики инфекционных и наследственных заболеваний, для установления отцовства, клонирования генов, введения мутаций, выделения новых генов. В основу положена возможность значительно увеличивать малые концентрации определенных фрагментов ДНК. Для исследования потребуется небольшое количество биоматериала, например крови, слюны или мазок из половых органов. Анализ проводят в искусственных условиях in vitro. ДНК содержит генетическую информацию любого живого организма.
Молекула состоит из двух цепочек, сплетающихся в единую спираль. Их последовательность уникальна для каждого организма, как отпечаток пальца или скан сетчатки глаза. Поскольку для каждого возбудителя зарегистрированы типичные укороченные последовательности нуклеотидов, то они хранятся в лабораториях в виде праймеров. Их в свою очередь присоединяют к ДНК возбудителя в пробе, и они многократно воспроизводят свои дубли под действием катализаторов.
Один ген может состоять из 20-200 таких нуклеотидов. Например, наш ген, определяющий выработку инсулина, состоит из 60 пар нуклеотидов. Но всё дело в том, что половинки не могут соединяться, как попало, а только особыми "комплементарными" парами.
Комплементарность — это точное взаимное соответствие и взаимное дополнение. Если хотите - единство противоположностей! Нуклеотиды обладают свойством комплементарности, то есть сцепляться друг с другом могут только нуклеотиды, входящие в одну комплементарную пару. Никакие другие связи в природе не возможны. Это весьма напоминает поведение магнитов, когда южный полюс легко сцепляется с северным, а попытки соединить юг с югом и север с севером обречены на провал… Здесь тоже самое, только полюсов не два, а четыре попробуйте это себе представить. Свойство комплементарности - ключевое в методе ПЦР. Комплементарными являются пары Тимин - Аденин и Гуанин — Цитозин.
Практически это означает, что напротив аденина A в одной цепочке ДНК, в другой цепочке обязательно стоит тимин T , а напротив гуанина G — цитозин C. Схематически всё это выглядит следующим образом: Кроме ДНК, точно такую же структуру имеет РНК рибонуклеиновая кислота , отличающаяся от ДНК тем, что вместо тимина в ней используется урацил и комплементарная пара имеет вид A — U. РНК — является хранителем генетической информации у некоторых вирусов, которые называются ретровирусами. Наиболее известный и активно изучаемый представитель этого поганого семейства — ВИЧ. Не смотря на то, что размеры клетки исчисляются микронами, из-за очень специфической плотной упаковки спирали, ядро клетки свободно вмещает десятки хромосом. Итак, пора переходить к решению задачи. Рассматривая поставленную выше задачу, мы уже увидели две основных проблемы на пути к её решению.
Понятно, что с одной стороны, выискивать клетку возбудителя инфекции среди миллионов клеток крови — занятие достаточно бесперспективное, если не сказать бестолковое, а с другой стороны, выделять ДНК из клеток " в рукопашную" — тоже не вариант, из-за опасности порвать на кусочки, всё что мы с таким трудом отыскали… Поэтому, нам очень помог бы какой-нибудь метод, позволяющий активно размножать ДНК, но делающий это только с определёнными, "избранными" экземплярами. Это позволит увеличивать концентрацию интересующей культуры до уровней, безошибочно определяемых и не требующих длительного поиска. Вот этим чудо-методом и стал метод полимеразной цепной реакции ПЦР. Эта реакция носит название репликации ДНК. Так это звучит сухим академическим языком. Но мы задались целью, объяснить Вам всё, буквально, "на пальцах", а потому продолжим свой рассказ о том, как всё происходит. На первом этапе реакции надо разъединить двойную нить ДНК.
Если кровь, то особо готовиться не надо. Для других материалов есть несложные правила — если их соблюдать, анализ будет точнее. Если вам назначили качественный ПЦР-анализ, имеет смысл сдавать его или в государственной лаборатории если обследование положено по ОМС , или в частной, где окажутся подходящие цены. Если вам назначили количественный ПЦР-анализ, врач напишет в направлении не только название исследования, но и предпочтительный метод, которым нужно провести ПЦР-анализ.
Если указания на метод нет — выбирайте ту лабораторию, цены в которой вас устраивают.
Что такое ПЦР тест на коронавирус и как правильно сдавать мазок
Как прочитать результат ПЦР-теста. О частоте ложно-положительных результатов диагностического теста можно судить по показателю, который называется специфичность. В свою очередь главврач клинико-диагностической лаборатории "Инвитро — Сибирь" Андрей Поздняков считает, что надолго сохраняющийся положительный ПЦР-тест может быть связан с особенностями дельта-варианта коронавируса. Положительный ПЦР означает только то, что Вы заразны для окружающих и выделяете вирус. ПЦР (полимеразная цепная реакция) – достижение молекулярной биологии, одна из главных методик клинической лабораторной диагностики конца 20-го и начала 21-го веков, приносящая огромную пользу в различных областях медицинской науки. читайте в медицинском журнале клиники Адмиралтейские Верфи.