ПЦР (полимеразная цепная реакция) представляет собой метод выявления присутствующего в организме вируса – у человека для этого берутся мазки из носа, ротоглотки.
ПЦР-тестирование: как работает метод ПЦР в диагностике
Положительный результат такого теста требует обязательной проверки методом ПЦР (полимеразной цепной реакции). Анализ — полимеразная цепная реакция имеет аббревиатуру — ПЦР. О положительном результате ПЦР. Положительный результат ПЦР-диагностики, с большой долей вероятности позволяет говорить, что пациент инфицирован коронавирусом – SARS-Cov-2. Отрицательный и ложноотрицательный результат.
ПЦР-тест и тест на антитела к коронавирусу: как разобраться в результатах?
Метод ПЦР в настоящее время расширяет круг возможностей проводимых исследований: введение мутаций, сращивание фрагментов ДНК, и получил широкое распространение в медицине, к примеру, для установления отцовства, появление новых генов и прочее. Материал для исследования и правила его забора Материалом для ПЦР-исследования, в котором можно выявить чужеродную ДНК бактерии или ДНК или РНК вируса могут служить различные биологические среды и жидкости человека: слизи, моче, крови, мокроте, соскобе эпителиальных клеток, тканях плаценты, крови, соке простаты, околоплодные воды, плевральная жидкость. При обследовании на инфекции, передающиеся половым путем ИППП , у мужчин и женщин забираются выделения из половых органов, мазок или соскоб из шейки матки, мазок или соскоб из уретры мочеиспускательного канала , моча. Нередко для обследования на поражение нервной системы при ряде исследований забирается спинномозговая жидкость. В пульмонологии материалом служит мокрота, плевральная жидкость. При обследовании на внутриутробные инфекции — околоплодные воды, ткани плаценты.
Подготовка к сдаче материала и проведению ПЦР-диагностики Практически все пациенты, которым проводится ПЦР-диагностика, вправе рассчитывать на достоверный, точный и быстрый результат, зависящий в большой степени от возможности лаборатории, профессионализма врача-лаборанта. Вместе с тем, многие не задумываются, что эта самая достоверность во многом зависит и от нас самих, а именно от рекомендаций лечащего доктора, образа жизни и правильности забора материала. При заборе материала требуются условия, исключающие контаминацию загрязнение материала и, соответственно, ставящие под сомнение объективность анализа. Правильная подготовка к сдаче материала не представляет особых сложностей. Существуют следующие рекомендации врачей для пациентов: 1 не жить половой жизнью за сутки до сдачи материала; 2 кровь для исследования сдается утром натощак не есть, не пить ; 3 при сдаче мочи собирается первая утренняя порция в чистый стерильный контейнер.
Сроки готовности ПЦР-анализа Окончательный результат готов через 1,5-2х суток после сдачи материала. В некоторых случаях результат готов в первый же день.
Известно, что результаты ПЦР-теста на коронавирус могут быть как ложноположительными, так и ложноотрицательными.
Заведующая лабораторией молекулярной диагностики «Инвитро» в Москве Наталья Гасилова объяснила «Доктору Питеру», какие причины могут повлиять на результат в процессе тестирования. К примеру, за несколько часов до взятия мазка не рекомендуется есть и пить, пользоваться спреями для горла и носа, а также чистить зубы и красить губы. Всё это, по словам специалистов, может повлиять на правильность результата.
Заведующая московской лабораторией молекулярной диагностики «Инвитро» Наталья Гасилова назвала «Доктору Питеру» еще несколько причин, которые могут приводить к выдаче ложных результатов ПЦР-теста. Ложноотрицательный — когда человек на самом деле инфицирован, но лаборатория выдает «-». Как получают ложноположительные результаты?
Основная причина — так называемая кросс-контаминация, перекрестное загрязнение одного образца содержимым другого.
К тому же в тот период тесты делали не так быстро, как заявляли об этом, поэтому ожидание негативно влияло на общее состояние. Новосибирцы с трудом переживают изоляцию и нахождение в больницах, если тесты долго показывают наличие коронавируса Источник: Александр Ощепков Как это объясняют врачи Терапевт центра семейной медицины «Здравица» Варвара Веретюк рассказывает, что концентрация РНК SARS-CoV-2, измеряемая в образцах из верхних дыхательных путей, а также вероятность его репликации размножения снижаются после появления симптомов: — По данным исследований, у пациентов с легкой и среднетяжелой формой COVID-19 не отмечалось репликации вируса после 10-го дня от начала симптомов. У некоторых пациентов с тяжелой формой репликация отмечалась до 20-го дня, что в некоторых случаях осложнялось иммунодефицитным состоянием. Крупное исследование по отслеживанию контактов показало, что контакты с пациентами из группы высокого риска в домашних условиях и в больницах после 6-го дня от начала заболевания не приводили к развитию инфекции. При этом, добавляет Варвара Веретюк, у выздоровевших пациентов могут продолжать обнаруживать РНК SARS-CoV-2 в образцах из верхних дыхательных путей до 12 недель, хотя у них уже через 3 недели не отмечалось выделения вируса, способного к размножению. Исключение могут составлять пациенты с иммунодефицитным состоянием, которое имелось до начала инфекции: в таких случаях есть риск длительного выделения способного к репликации вируса. Для людей с тяжелым течением болезни этот срок продлевают до 20 дней. Если у человека с положительным тестом не было симптомов болезни, то Минздрав США рекомендует в таких случаях прекратить самоизоляцию через 10 дней со дня положительного теста.
Для людей с тяжелым иммунодефицитом инфекционист может рассмотреть стратегию тестирования для решения о сроке выхода из самоизоляции, — привела пример Варвара Веретюк. Но, по ее словам, пока нет в наличии коммерческих тест-систем, которые способны отличить «боеспособный» коронавирус от его фрагментов. Дмитрий Денисов, медицинский директор лабораторной службы «Хеликс», дополняет, что, согласно исследованиям, вирусная РНК может выделяться со слизистых верхних дыхательных путей до 21-го дня с момента появления симптомов или начала активной репликации вируса при бессимптомном течении заболевания, иногда даже более этого срока. А наиболее активно вирус выделяется за 1—3 дня до появления симптомов. Прежде всего необходимо понять, какой именно тест-системой пользовался человек. Доктора рекомендуют перепроверять результаты домашних экспресс-тестов в лабораториях Источник: Александр Ощепков При ситуации, когда положительный результат в течение месяца подтверждается лабораторией, важно понять, есть ли у человека какие-то жалобы и симптомы болезни, добавляет врач.
Хожу к людям, которые на меня чихают коронавирусом, и тут же в течение получаса иду сдавать ПЦР. И он у меня засветится, потому что именно в этот момент во мне был вирус. Но он скорее даже не ложноположительный, он транзиторно там оказался Антон Ершов Доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Врач также отметил, что чаще результаты ПЦР оказываются ложноотрицательными, а не ложноположительными. По его словам, даже у ещё болеющих ковидом ПЦР уже может не обнаруживать ковид, поскольку вирус продвинулся в нижние дыхательные пути и в верхних его уже нет.
ПЦР-тест и тест на антитела к коронавирусу: как разобраться в результатах?
| ПЦР: что это за метод, для чего используется анализ | МРТ Эксперт | Как прочитать результат ПЦР-теста. |
| Ложноположительный ПЦР: Почему так бывает? | это крайне чувствительная вещь, то он не отличает живой вирус от мертвого. |
| Сколько можно! Почему долгое время держится положительный ПЦР-тест на коронавирус | Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — метод молекулярной биологии. В результате известные фрагменты оказываются на обоих концах неизвестного участка, после чего можно проводить ПЦР как обычно. |
| ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео) | Аббревиатура ПЦР расшифровывается как полимеразная цепная реакция. |
| ПЦР-тест и тест на антитела к коронавирусу: как разобраться в результатах? | Аббревиатура ПЦР расшифровывается как полимеразная цепная реакция. |
Форма поиска
- «Вероятность обнаружить вирус снижается». Когда нужно сдавать ПЦР-тест
- Что еще почитать
- В Минздраве объяснили, от чего зависит результат ПЦР-теста
- Может ли ПЦР-тест на COVID-19 показать положительный результат при простуде
Что такое ПЦР: достоверность и точность
| Сколько можно болеть: почему даже спустя месяц ПЦР-тест на ковид остается положительным | Чаще всего ПЦР-тест показывает ложноположительный результат из-за наличия в носу или ротоглотке фрагментов уже погибшего вируса, рассказал в интервью Лайфу доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Антон Ершов. |
| ПЦР: метод тестирования, который слишком недооценен | MedAboutMe | О положительном результате ПЦР. Положительный результат ПЦР-диагностики, с большой долей вероятности позволяет говорить, что пациент инфицирован коронавирусом – SARS-Cov-2. Отрицательный и ложноотрицательный результат. |
| Сколько можно! Почему долгое время держится положительный ПЦР-тест на коронавирус | Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — высокоточный метод диагностики заболеваний, основанный на копировании ДНК или РНК патогена в пробе. Содержание. |
| Специалист лаборатории объяснила, почему ПЦР-тесты на коронавирус могут выдавать ошибку | Чаще всего ПЦР-тест показывает ложноположительный результат из-за наличия в носу или ротоглотке фрагментов уже погибшего вируса, рассказал в интервью Лайфу доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Антон Ершов. |
| ПЦР положительный это значит возбудитель обнаружен и надо лечиться. | ПЦР (полимеразная цепная реакция) представляет собой метод выявления присутствующего в организме вируса – у человека для этого берутся мазки из носа, ротоглотки. |
Всегда ли положительный тест на COVID-19 означает, что пациент заразен?
Или концентрация генетического материала ниже пороговой чувствительности теста. Как выглядит бланк результатов ПЦР анализов? Первый вариант говорит о наличии инфекционного процесса, вызванного искомым возбудителем. Второй — об отсутствии генетического материала инфекционного агента или его количестве ниже порога чувствительности. Расшифровка результатов ПЦР исследований проводится в тот же день, когда получены результаты или в момент обращения к врачу. Время получения данных анализа составляет от нескольких часов до трех суток в зависимости от лаборатории. Идеальным можно считать вариант, когда от момента первичного обращения к врачу до интерпретации проб проходит не более суток в клиниках, оснащенных современными лабораториями. Однако и она не исключает ложноположительных или ложно отрицательных ответов.
В основном это связано с погрешностями при заборе лабораторного материала. Нельзя утверждать, что кровь может быть универсальным материалом для установки диагноза.
Сроки выполнения анализов во многом зависят от клиники. Чаще всего время ожидания теста составляет 24-48 часов.
В большинстве клиники вам потребуется предварительная регистрация на официальном сайте для сдачи анализа. Какие еще есть тесты Помимо ПЦР-теста, существует еще более быстрая диагностика. На ранних стадиях заболевания применяют антигенные тесты, выявляющие в вирусе определенный белок. Для анализа берут забор материала из рото- или носоглотки.
В отличие от ПЦР-теста, данный анализ проводится намного быстрее, его результаты готовы спустя 15-30 минут. Но на сегодняшний день ПЦР-диагностика является намного достовернее и информативнее. Преимущества проведения тестирования на наличие коронавирусной инфекции в «Бэби Плюс» В Одинцово и Голицыно сдать тесты на выявление коронавирусной инфекции или определение титра антител можно в нашем медицинском центре. Мы проводим анализы в предельно сжатые сроки и гарантируем их точность и достоверность.
Ознакомьтесь с ценами на тесты в нашем прайс-листе. Для проведения анализа вы должны записаться по телефону или на официальном сайте нашего центра. Дата публикации: 05.
Особенности применения ПЦР-теста Метод используют везде, где нужен быстрый, точный и надежный результат. Возбудители многих инфекций имеют несколько штаммов, поэтому точная диагностика гарантирует и эффективность лечения.
Анализ проверен временем, тщательно апробирован клинически, поэтому его часто назначают в качестве дополнительного обследования, чтобы выявить определенный тип вируса или микроба. Кроме медицины метод нашел применение в генетике, криминалистике, археологии. ПЦР-диагностика играет ведущую роль в выявлении неврологических и урологических заболеваний. Использование передовых технологий позволяет: определить причины острых уретритов — берут соскоб клеток из мочеиспускательного каналы у мужчины или женщины, влагалища, цервикального канала; диагностировать циститы, особенно хронические — через мочу или соскоб из шейки мочевого пузыря; тщательно обследовать простатит — берется секрет простаты; определить воспалительные заболевания головки полового члена и крайней плоти — соскоб клеток высыпаний; диагностировать ряд кожных патологий. В гинекологии ПЦР-анализы — обязательная диагностическая процедура, входящая в профиль обследований различных женских патологий.
В первую очередь это диагностика широкого спектра заболеваний, передающихся половым путем. Врач может назначить анализ при подозрении на хламидиоз, гонорею, герпес, вирусы папилломы человека. В качестве биоматериала обычно выступают кровь, моча или вагинальный соскоб. Метод ПЦР — наиболее точный способ выявления Covid-19. Его преимущество в том, что он обнаруживает сам вирус.
ИФА-тест показывает реакцию иммунной системы на вторжение инфекции. Он также, как и ПЦР-тест, показывает наличие вируса, но относится к менее достоверным и точным методам диагностики. Отличие есть также в стоимости тестов. ИФА-тестирование намного доступнее. Показания к проведению ПЦР-диагностики появление у пациента признаков, типичных для коронавирусной инфекции; воспаление легких как возможное осложнение инфекции; работа медицинских работников в отделениях, где лечат больных с коронавирусной инфекцией; деятельность патологоанатомом или работа в судебно-медицинском бюро; в период подготовки к проведению хирургической операции.
Эти лица входят в перечень лиц, подлежащих обязательному тестированию. Все желающие, которые не входят в эту группу, могут сделать ПЦР-тест по своему желанию в медицинских центрах и клиниках. ПЦР-тест требуют при въезде в большинство стран как подтверждение отсутствия инфицирования. Положительный результат ПЦР-тестирования позволяет своевременно выявить заболевание, назначить нужное лечение и добиться изоляции пациента, что сохранит других людей от риска заражения. Ее наносят на тест-полоску для анализа наличия антител.
Обнаружение IgM указывает на то, что человек болеет коронавирусом или же переболел им относительно недавно. Наличие IgG свидетельствует о том, что инфицирование произошло давно и иммунитет практически отсутствует. Но даже высокий титр антител не является гарантией защиты от повторного инфицирования.
ПЦР ДИАГНОСТИКА. Что это такое?
Результат ПЦР-анализа либо положительный, либо отрицательный. Положительный указывает на то, что у человека присутствуют фрагменты ДНК возбудителя заболевания, то есть, что человек заражен и ему необходимо лечение. ПЦР расшифровывается как “полимеразная цепная реакция”. Такой метод диагностики направлен на обнаружение РНК коронавируса COVID-19. Если его результат положительный, то этот результат верный. «Если экспресс-тест показал положительный результат, а ПЦР-тест — отрицательный, такое может быть, потому что вирусы не сидят и не ждут. Что такое полимеразная цепная реакция (ПЦР)? Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — метод молекулярной биологии. В результате известные фрагменты оказываются на обоих концах неизвестного участка, после чего можно проводить ПЦР как обычно. Положительный ПЦР означает только то, что Вы заразны для окружающих и выделяете вирус.
Различие тестов на коронавирус
Подготовка к исследованию Меры зависят от того, какой биоматериал будут брать. Вот некоторые варианты: Моча Изучение урины требуется, когда проводят диагностику мочеполовых инфекций, поражений венерического плана у мужчин и женщин. У первых методика применяется не всегда. Часто ее заменяют забором соскоба из уретры. Перед проведением обследования, накануне запрещена гигиена репродуктивных органов. Анализ сдают в течение суток с момента подозрительного полового акта. Но это не строгое требование, а скорее рекомендация по раннему выявлению патологического процесса.
Кровь Также ее отдельные компоненты: сыворотка и пр. Забирают для определения гепатитов разных форм, дифференциальной диагностики патологий печени, выявления герпеса, СПИДа, также при обследовании на предмет генетических аномалий. Особых правил подготовки в этом случае нет. Кровь сдают натощак, это единственное требование к пациенту. Мокрота Отделяемое слизистой оболочки дыхательных путей. Исследуется для диагностики респираторных патологий, пневмонии, бронхита, определения источника процесса.
Также в рамках выявления других поражений: будь то легочные формы микоплазмоза или прочие. Специальная подготовка не требуется. Биоптат Биологический материал слизистой оболочки пищевода и желудка. Используется для диагностики причин язвы, гастрита и прочих патологий этой области. Например, таким способом удается надежно обнаружить хеликобактер, который чаще всего и оказывается виновником патологических процессов. Подготовки опять же не нужно.
Соскобы со слизистых оболочек Используются особенно часто. В основном, в рамках выявления венерических заболеваний, коронавируса. Но не только. Достаточно временно ограничить гигиену половых органов или полости рта, чтобы не смыть следы патогенной флоры, вирусов. Другие биологические жидкости Будь то ликвор, секрет предстательной железы и прочие. По показаниям.
Подготовка будет специфической. Вопрос стоит уточнить у лечащего врача. Основном требование подготовки к анализу ПЦР и его проведению — это забор биоматериала в стерильную посуду. Кроме того, образец не должен контактировать с окружающей средой и руками медицинского персонала. Как показывает практика, больше половины случаев неверного результата обусловлена именно нарушениями технологии получения биоматериала. Потому для ПЦР-анализа используются одноразовые колбы, пробирки, вакуумные системы забора крови, которые обеспечивают полную стерильность условий обследования.
В случае, если у врача есть подозрения на неточность анализа, диагностика проводится еще раз. Полимеразная цепная реакция Методы проведения теста Существует как минимум десяток способов ПЦР, но многие из них не относятся к медицине и используются в научных целях. В качестве вариантов исследования назначают такие вариации: Обратная транскрипция.
Он хотел создать метод, благодаря которому можно было бы амплифицировать ДНК увеличивать число её копий в ходе многократных последовательных удвоений исходной молекулы ДНК с помощью фермента ДНК-полимеразы. Это событие стало поистине революционным и оказало в последующем серьёзное влияние на развитие молекулярной биологии, генетики и медицины. Подтверждение этому - Нобелевская премия в области химии, которой был удостоен К. Муллис в 1993 году. Помимо медицины метод нашёл применение в генетике, криминалистике, археологии.
А сегодня нам сообщают, что Россия поставляет тест-системы в 30 стран мира. У нас действительно хватает тестов на всю страну? У нас исторически хорошие мощности по производству такого рода реагентов. Если в Москве мы обнаруживали положительный образец, должны были контрольную копию доставить в Новосибирск. Пока анализы доставлялись туда, потом обратно, проходило как раз несколько суток. На сегодня отправка второго образца анализа из клиники идет для повторного подтверждения не в Новосибирск, а в московский региональный центр. На это уходит 1,5-2 дня.
Но смею вас заверить, сегодня все тесты уже относятся к разряду высокочувствительных. В течение этих трех дней человек должен быть изолирован. Если оба раза тест будет выдавать отрицательный результат, то в этом случае диагноз COVID-19 не ставится. После него не назначают повторный анализ? То есть, любой житель города может заказать диагностику и ему на дом привезут все необходимое.
Его можно бесплатно получить в любом лабораторном отделении Гемотест. Инструкция по использованию контейнера Открутите крышку контейнера и положите её, не касаясь внутренней части крышки. Соберите первую порцию мочи в контейнер. Если мочу на анализ берут у ребёнка, можно использовать мочеприёмник. Закройте контейнер крышкой и плотно закрутите её. Доставьте контейнер в лабораторное отделение в течение 2 часов после взятия биоматериала. Подготовка к ПЦР-анализу кала Кал следует сдавать до приёма антибиотиков или не ранее, чем через 12 часов после приёма препарата. За 72 часа до исследования откажитесь от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, а также прекратите приём препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала. Соберите образец кала после естественного опорожнения кишечника без применения клизм или слабительных средств. Позаботьтесь о том, чтобы в биоматериал не попали посторонние примеси: вода, моча, выделения половых органов, дезинфицирующие средства и химические вещества, содержащиеся в подгузниках: перед дефекацией вымойте и высушите промежность; соберите кал с чистой и не впитывающей влагу поверхности: это может быть чистый пакет из полиэтилена, клеёнка, чистое судно или горшок. Собирать кал из унитаза, пелёнок или подгузников — нельзя! Поместите 1—2 чайные ложки биоматериала в герметичный контейнер. Если нужно выполнить несколько анализов, подготовьте для каждого исследования отдельную порцию биоматериала в отдельном контейнере.
Может ли ПЦР-тест на COVID-19 показать положительный результат при простуде
Основная причина — так называемая кросс-контаминация, перекрестное загрязнение одного образца содержимым другого. Это может произойти на любом этапе тестирования — взятии мазка, транспортировки или уже в лаборатории. Тогда для загрязнения достаточно попадания капель или даже аэрозоля с этого образца, — говорит Наталья Гасилова. Есть также требование — оставлять зонд, которым берется биоматериал, в пробирке. Его полагается отламывать или отрезать ножницами. При выполнении этой операции тоже есть риск испачкать перчатки, поэтому их надо каждый раз менять. По словам специалиста, загрязнение «чистого» образца может случиться и при транспортировке анализов. В итоге пробирка снаружи будет контаминирована и, если потом пробирки ставятся в один штатив и перчатки не меняются, частицы вируса могут «переноситься» в другой образец.
Именно РНК является носителем генетической информации у ряда вирусов. Кроме этого, рибонуклеиновая кислота выполняет передачу данных от ДНК к белку. Эта последовательность всегда уникальна, за исключением некоторых схожих участков ДНК, которые отвечают за однообразие в пределах одного вида. При помощи методики ПЦР можно найти даже мельчайшие фрагменты нуклеиновой кислоты, чтобы определить, к какому виду принадлежит микроорганизм. Однако анализ ДНК небольшого количества микробов достаточно мало информативен, из-за чего требуется увеличить количество нуклеотидов.
Именно с этими целями используется ПЦР, позволяющий многократно дублировать цепочку нуклеотидов. Катализатором такого процесса выступают нити РНК, они крепятся к изучаемому гену. В результате всего за несколько часов из одного фрагмента можно получить достаточно биологического материала для изучения. После изобретения метода ПЦР были изучены и зафиксированы уникальные нуклеотидные последовательности праймеры длиной 15-30 штук , характерные только для конкретного патогена. Если поместить такие праймеры в пробирку с исследуемым материалом, в котором есть ДНК или РНК «живых» патогенов, начнется реакция репликации — создание большого количества копий, которые можно визуально идентифицировать.
И при расчете результатов сотрудники лаборатории могут определить, присутствуют ли в исследуемом образце определенные бактерии и вирусы, поэтому результаты анализа в основном качественные. Метод ПЦР строго специфичен и при правильном выполнении не может дать ложноположительного результата. То есть, если инфекции нет, анализ никогда не покажет, что она есть. Поэтому очень часто ПЦР-анализ проводится дополнительно для подтверждения диагноза, а также для того, чтобы определить патоген и его природу. Преимущества и недостатки На сегодняшний день ПЦР считается наиболее информативным способом определения возбудителей инфекционных заболеваний.
Диагностика с помощью этого метода позволяет найти возбудителя, присутствующего в исследуемых материалах. Это — наиболее точный анализ на половые инфекции, скрытые инфекции и другие заболевания, передающиеся половым путем.
Известно, что результаты ПЦР-теста на коронавирус могут быть как ложноположительными, так и ложноотрицательными. Заведующая лабораторией молекулярной диагностики «Инвитро» в Москве Наталья Гасилова объяснила «Доктору Питеру», какие причины могут повлиять на результат в процессе тестирования. К примеру, за несколько часов до взятия мазка не рекомендуется есть и пить, пользоваться спреями для горла и носа, а также чистить зубы и красить губы. Всё это, по словам специалистов, может повлиять на правильность результата. Заведующая московской лабораторией молекулярной диагностики «Инвитро» Наталья Гасилова назвала «Доктору Питеру» еще несколько причин, которые могут приводить к выдаче ложных результатов ПЦР-теста. Ложноотрицательный — когда человек на самом деле инфицирован, но лаборатория выдает «-». Как получают ложноположительные результаты? Основная причина — так называемая кросс-контаминация, перекрестное загрязнение одного образца содержимым другого.
Одна из причин - небрежный забор биоматериала из носоглотки. Это приводит к тому, что тест становится неинформативным. А вот есть он или нет у человека - зависит от того, насколько технически правильно был взят мазок. Иными словами, если есть клиника вирусной пневмонии, но тест отрицательный, то всё равно лечим как COVID. Или повторяем тест после забора материала во время бронхоскопии.
Тест требует специальной довольно сложной аппаратуры. Его сверхчувствительность приводит и к нежелательным последствиям. Тест может определять "обрывки", фрагменты вируса и приводить к ложноположительным результатам. При большой нагрузке на лабораторию она становится контаминированной, "загрязненной" с вирусологической точки зрения и выдавать ошибки", - отмечает доктор.
ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео)
Что берут для анализа: кровь или мочу? Сколько это стоит? Как долго придется ждать результата? Чтобы эффективно лечить инфекцию, нужно знать в лицо возбудителя. Но обнаружить «виноватого» вируса или микроба иногда бывает очень непросто: не все микроорганизмы получается выращивать в лаборатории на специальных питательных средах; некоторые возбудители находятся в скрыто существующих формах, при этом инфекция имеет латентное или хроническое течение; существуют микробы, которые паразитируют внутри клеток человека и за счет этого успешно скрываются; некоторые возбудители обладают высокой антигенной изменчивостью. Все эти сложности помогает преодолеть особый метод диагностики: полимеразная цепная реакция, или, сокращенно, ПЦР по-английски — PCR. Придумал её в 1983 году американский ученый Кэри Мюллис. Открытие совершило настолько сильный переворот в медицине, что в 1993 году Мюллис получил за него Нобелевскую премию. Почему полимеразная реакция — цепная?
Она позволяет взять одну или несколько молекул дезоксирибонуклеиновой кислоты и быстро размножить их. В результате получают достаточно большое количество генетического материала, доступного для исследования. Реакцию проводят в специальном аппарате — амплификаторе. Сначала исследуемый образец нагревают, чтобы ДНК которая в норме представляет собой двухцепочечную спираль денатурировала и распалась на две отдельные цепочки.
Какие есть недостатки Единственный серьезный недостаток, связанный с методом полимеразной цепной реакции, - его высокая технологичность. Исследования ПЦР требуют строжайших соблюдений правил и серьезной оснащенности лабораторного комплекса. Не каждая лаборатория может позволить себе все необходимое оборудование.
Урогинекология диагностика инфекций, передающихся половым путем: хламидиоз, уреаплазма, микоплазма, кандиды, гарднерелла, герпесвирусы. Важное значение для женского и мужского здоровья играет ВПЧ — вирус папилломы человека. Доказано, что у женщин онкогенные штаммы этого вируса способны вызывать рак шейки матки. Существует целый ряд инфекций, способных поражать плод еще в материнской утробе. Среди них вирусы герпеса, токсоплазмы, краснухи. ПЦР-диагностика позволяет правильно определить тактику ведения и риски внутриутробной инфекции. Респираторные заболевания.
Диагностика методом ПЦР стала в 2020 году актуальной как никогда и продемонстрировала свою незаменимость и эффективность. ПЦР-анализ — главный тест и «золотой стандарт» диагностики коронавирусной инфекции Sars-Cov-2 COVID-19 , ставшей причиной самой масштабной пандемии последних десятилетий. Наследственные заболевания и отцовство также диагностируются при помощи метода ПЦР. ПЦР-тесты применяются везде, где нужен быстрый, точный и надежный результат. Подготовка к проведению ПЦР-теста Еще одно немаловажное преимущество ПЦР-анализов — это отсутствие специфической подготовки к проведению тестов. Достаточно следовать стандартным рекомендациям специалиста: Анализ сдается утром натощак. При этом ряд генетических исследований проводится в произвольное время, удобное пациенту.
С их помощью диагностируются гепатиты, герпес, ВИЧ-инфекция. Для анализа используется венозная кровь 1—1,5 мл , собранная у пациента натощак в стерильную пробирку. Замораживать кровь категорически запрещается. Биологические жидкости. К ним относятся слюна, сок простаты, околоплодная, плевральная, спинномозговая, суставная жидкости.
Собираются при помощи пункции с использованием стерильного инструментария в количестве 0,1—1,5 мл в стерильные пробирки. Биоптаты, то есть материалы, полученные путем биопсии. Обычно на анализ отправляют биоптаты двенадцатиперстной кишки или желудка, чтобы выявить хеликобактерную инфекцию. Объем материала 2—3 мм3. Хранение и транспортировка биоматериала.
Хранить образцы можно при комнатной температуре не более 2 часов. Оттаивание и повторное замораживание проб запрещено. Транспортировка, если она необходима, должна проводиться в специальных термоконтейнерах или термосах с соблюдением всех правил хранения и перевозки биоматериалов. Выделение ДНК из образца. Способ выделения зависит от вида определяемого микроорганизма и от вида биологического образца.
Если, например, анализируется соскоб эпителиальных клеток, используется так называемый метод твердофазной сорбции, заключающийся в добавлении в образец специального вещества, концентрации ДНК на сорбенте и его многократной отмывке буферным раствором. Проведение ПЦР. Некоторое количество образца из биологической пробы переносится в специальную микроцентрифужную пробирку. Туда же добавляется амплификационная смесь, имеющая сложный состав, в объеме 25 мл. Пробирки устанавливают в программируемый термостат, и автоматическом режиме проводится амплификация.
Время ее проведения зависит от заданной программы и составляет 2—3 часа. Одновременно с опытными пробами проводятся контрольные — положительные, включающие в себя контрольный препарат ДНК исследуемого возбудителя, и отрицательные, не содержащие исследуемую ДНК. Количество циклов амплификации варьирует от 30 до 40, более 40 циклов проводить не рекомендуется, так как это способствует увеличению количества неспецифических продуктов в пробе. Регистрация результатов. Фрагмент ДНК, характерный для возбудителя инфекции, выделяют методом электрофореза в присутствии специального вещества — бромистого этидия.
Его соединение с фрагментами ДНК дает светящиеся полосы при облучении ультрафиолетовым излучением. Образец помещают в камеру для электрофореза и в течение 35—40 минут проводят разделение продуктов амплификации.
Так или иначе, в итоге вся ДНК в клетке удваивается, и вот теперь клетка может спокойно делиться. Прочитали до сюда?
Вот теперь можем переходить непосредственно к ПЦР. Ученые уже десятилетия изучают свойства ДНК. Выделяют из живых организмов, синтезируют искусственно... Потому что когда его мало, то труднее ставить эксперименты - проще запороть, загрязнить чем-то чужеродным и т.
И тогда в далеком 1983м один любящий галлюциногены ученый Кэри Муллис решил использовать для этого то, что давно уже придумала природа - репликацию, только искусственную, в пробирке. Нобелевку по химии за это получил, кстати... За основу взяли все основное, что есть в "натуральной" репликации - собственно ДНК, полимеразу, свободные буквы-нуклеотиды, чтобы ей было что вставлять в новую цепь, и праймеры - затравку, которая покажет полимеразе, откуда ей начать свое грязное дело. Путем долгих манипуляций и экспериментов выяснилось, что оптимальнее всего смешать все это и поставить на определенный температурный режим, где каждый этап реакции будет происходить на своей заданной температуре.
Этапа всего три: 1 Денатурация. При 95 градусах двойная спираль ДНК распадается на две нити разрушаются те самые слабые водородные связи между комплементарными нуклеотидами. При 40-60 градусах в зависимости от ряда факторов маленькие затравки находят комплементарный участок на одиночной цепи и садятся на него. При 72 градусах полимераза садится на затравку и начинает достраивать новую цепь, пользуясь старой как шаблоном.
Откуда именно 72 градуса - очень интересная история о пользе фундаментальной науки, как-нибудь в другой раз. В результате такого цикла из одной двойной спирали получаются две! Как несложно догадаться, теперь надо все это повторить еще раз, чтобы из 2 сделать 4, потом 8... Ну, вы поняли - это цепная реакция!
Тем не менее, этого хватает, чтобы получить рабочие концентрации ДНК, с которыми можно уже делать серьезное дело. Аппаратная база.
Результаты ПЦР диагностики
анализ ПЦР положительный Положительный анализ ПЦР (полимеразной цепной реакции) обозначает, что в изученном материале была обнаружена инфекция, которую искали. Положительный результат ПЦР теста означает, что пациент в настоящее время инфицирован определенным патогеном. Анализ — полимеразная цепная реакция имеет аббревиатуру — ПЦР.