Хромосомный микроматричный анализ. Моногенные наследственные заболевания.
Хромосомный микроматричный анализ: характеристика, использование и эффективность метода
Хромосомная патология является причиной рождения ребенка с врожденными пороками развития, умственной отсталостью, а также потери беременности. Многие признаки хромосомной патологии выявляются во время беременности с помощью ультразвукового исследования, однако настоящая их причина часто оставалась неизвестной. Развитие современных технологий привело к разработке молекулярного исследования, которое оптимально подходит для диагностики хромосомных перестроек во время беременности.
Это позволяет диагностировать все известные хромосомные синдромы в том числе микроделеционные и микродупликационные. Помимо вариаций числа копий ДНК, хромосомный микроматричный анализ "Стандартный" позволяет определять точечные мутации в генах, связанных с аутосомно-доминантными и аутосомно-рецессивными заболеваниями, участки отсутствия гетерозиготности, которые имеют важное значение при болезнях импринтинга, близкородственных браках, аутосомно-рецессивных заболеваниях, однородительские дисомии наличие в геноме двух хромосом от одного родителя. Особенностью "Стандартного" ХМА является возможность определять частую причину спинальной мышечной атрофии - делецию 7-8 экзонов гена SMN1 Анализ позволят установить наличие или отсутствие хромосомной патологии в случае недифференцированных синдромов у пациентов с малыми аномалиями развития, множественными врожденными пороками развития, расстройствами аутистического спектра, задержкой психомоторного развития. В некоторых случаях, по результатам ХМА может быть рекомендовано обследование родителей или других родственников пациента.
При выполнении ХМА с помощью специальной методики исследуются последовательности генетического материала во всех хромосомах и могут быть выявлены избыток или недостаток генетического материала числовые аномалии, дупликации и делеции хромосом, несбалансированные транслокации. ХМА имеет высокую разрешающую способность, то есть позволяет выявить достаточно мелкие структурные изменения. Хромосомный микроматричный анализ ХМА является сложной молекулярной технологией, позволяющей провести полногеномную амплификацию с последующим анализом множества отдельных фрагментов генома с применением специально подготовленной микроматрицы.
Тест ХМА проходит на микроматрице высокой плотности, состоящей из свыше 1 миллиона маркеров генома. Разрешающая способность стандартного ХМА-теста от 100 000 п. Какой биоматериал нужен для исследования? Материал для исследования: амниотическая жидкость, ворсины хориона, пуповинная кровь. Дополнительных правил подготовки к тесту нет.
Ответы врачей
- Хромосомный микроматричный анализ
- Показания к проведению хромосомного микроматричного анализа
- Материалы по теме
- Хромосомный микроматричный анализ экзонного уровня
Генетические анализы, проведение которых финансирует фонд для благополучателей
Для исследования подойдет любой материал, содержащий ДНК, — ворсина плаценты или жидкость внутри плодных оболочек. Учеными анализируются отдельные фрагменты генома с использованием специально подготовленной микроматрицы. В результате полученного метода одновременно исследуются более тысячи генов, в результате чего появилась возможность исключить более 250 тяжелых генетических заболеваний. Но каким бы опытным ни был специалист, есть разрешающая способность человеческого глаза. Так, может быть поврежден крохотный участок в каком-то плече хромосомы, и с помощью ХМА мы его «поймаем», а простой цитогенетикой — нет.
Это позволяет диагностировать не только все известные микроделеционные синдромы и синдромы связанные с аутосомно-доминантными заболеваниями в случае делеции генов , но и ранее не описанные или очень редко встречающиеся изменения структуры хромосом. Анализ позволят установить причину хромосомной патологии в случае недифферинцированных синдромов у детей с аутизмом, задержкой психомоторного развития, малыми аномалиями развития, множественными врожденными пороками развития. При выполнении исследования могут быть выявлены патогенные делеции исчезновение участков хромосом , дупликации появление дополнительных копий генетического материала , участки с потерей гетерозиготности, которые имеют важное значение при болезнях импринтинга, близкородственных браках, аутосомно-рецессивных заболеваниях. При наличии специфического фенотипа расширенный ХМА может быть информативен и при аутосомно-рецессивных заболеваниях в случаях делеций генов или экзонов генов, ассоциированных с такими заболеваниями. В некоторых случаях, по результатам расширенного ХМА может быть рекомендовано обследование родителей. Хромосомный микроматричный анализ стандартный Стандартный хромосомный микроматричный анализ проводится на микроматрице средней плотности которая содержит 750 тыс. Разрешающая способность стандартного ХМА от 200 000 п. При выполнении этого анализа с максимальной точностью исследуются все клинически значимые участки генома. Анализ позволяет установить нарушения в генах с известной клинической значимостью.
Этот метод поможет выявить все хромосомные нарушения плода. Ранее же для выявления подобных нарушений биоматериал изучали под микроскопом, что позволяло с точностью в сто процентов обнаружить крупные повреждения, например, синдром Дауна. Однако при стандартном методе выявить небольшие нарушения невозможно.
Исследование хромосомных отклонений методом ХМА Хромосомный микроматричный анализ ХМА — метод исследования кариотипа человека, который может выявить хромосомные нарушения, связанные с изменением структуры или числа хромосом. Наиболее распространённые хромосомные нарушения: дупликация — появление дополнительных копий генетического материала; транслокация — перенос участка одной хромосомы на другую; инверсия — изменение последовательности генетического материала. Кроме того, методом ХМА можно обнаружить и другие хромосомные аномалии, например, анеуплоидии, триплоидии, полиплоидии, микродупликации, микроделеции, несбалансированные транслокации, потерю участков гетерозиготности, однородительские дисомии. Такие аномалии часто становятся причиной наследственных заболеваний, которые можно подтвердить или исключить с помощью ХМА: синдрома Патау трисомия 13 , синдрома Эдвардса трисомия 18 , синдрома Дауна трисомия 21 , синдрома Ди Джорджи микроделеция 22-й хромосомы и многих других. Заказать анализ.
Башкирские генетики разработали новый метод пренатальной диагностики
В генах существуют участки, которые несут информацию и которые можно прочитать и воплотить в аминокислотную цепь в процессе синтеза белка. Но есть и участки, которые информации не несут, но они всё равно нужны. Поэтому генетический код можно сравнить с книгой, в которой не все страницы заполнены словами и буквами, а встречаются иногда значительные пробелы: или целых абзацев, и даже целых страниц. Поэтому секвенированием экзома называют процесс анализа всех участков ДНК, которая кодирует специфические белки, а «пустые разделы» последовательностей не исследуются. Что касается полного секвенирования генома, то во время этого метода изучается весь наследственный материал. При этом исследуются все, участки ДНК, включая и «пустые», на первый взгляд незначимые. Это исследование очень важно, потому что иногда в этих «пустых» участках могут скрываться особые мутации одного или нескольких генов, которые распределяются по всему геному, и только взгляд на весь геном дает понимание качества распределенной мутации.
Можно говорить, что показание к этому исследованию — это диагностических поиск непонятных наследственных патологий, очень похожих на другие болезни, у которой нет единого источника мутации, и они находятся в разных районах генома, лежащих далеко друг от друга. Эти методы применяются, когда другие способы генетического анализа крови оказались неэффективными, в том числе, для поиска причины умственной отсталости, при аутизме, при диагностике целых групп наследственных болезней, например, нейромышечных заболеваний. ТМС или тандемная масс-спектрометрия С помощью этого высокоточного метода можно провести сразу анализ для многих десятков, и даже сотен соединений в маленьком количестве биологического материала. По сути, при этом методе не исследуется наследственный материал, но зато можно распознать вещества, которые по своей структуре отклоняются от нормы. Речь идет в первую очередь об аминокислотах. Известно очень много наследственных заболеваний у новорождённых, при которых нарушается метаболизм белков, жиров и углеводов.
В том случае, если вследствие генетического отклонения организм начинает продуцировать какое-либо дефектное, не встречающееся у нормального человека вещество, либо оно начинает накапливаться в аномально больших количествах, то можно определить, какая генетическая болезнь может этому способствует. В настоящее время этот метод используется для того, чтобы из одного анализа крови узнать о том, нет ли у новорождённого несколько десятков наследственных болезней сразу. Раньше для проведения этого метода требовалось очень много биологического материала и проведение как минимум нескольких исследований, и это понятно. Метод тандемной масс-спектрометрии позволяет определить весь этот набор не только качественно, но и количественно, причём при сдаче одного — единственного анализа, например, генетический скрининг «пяточка» в роддоме. Можно с уверенностью диагностировать различные наследственные нарушения обмена белков, аминокислот, дефекты митохондрий, а в общей сложности — определить более 100 различных генетических заболеваний. В Российской Федерации в число обязательных и бесплатных входит пять наиболее часто встречающихся болезней.
Средняя частота встречаемости заболеваний, которые определяются методом тандемной масс-спектрометрии — один случай на 5000 новорождённых малышей.
Башкортостан — единственный регион России, где данное обследование по показаниям проводится беременным бесплатно за счет бюджета республики. В 2021 году запланировано 650 таких обследований. Сам метод инвазивный. Для исследования подойдет любой материал, содержащий ДНК, — ворсина плаценты или жидкость внутри плодных оболочек. Учеными анализируются отдельные фрагменты генома с использованием специально подготовленной микроматрицы.
Они отвечают за наследуемые физические характеристики рост, размер ноги, цвет волос и глаз , а также за умственное и психическое развитие, функционирование основных систем организма. Генетический материал распределён по хромосомам в строго определённом порядке, последовательность сохраняется одинаковой для всех людей. Полный хромосомный набор называют кариотипом. В норме кариотип человека содержит 46 хромосом, которые объединены в 23 пары. Нормальный мужской кариотип — 46,XY; нормальный женский — 46,XX. В норме в каждой клетке содержится полный хромосомный набор, исключение составляют половые клетки сперматозоиды и яйцеклетки , которые содержат лишь половину набора, то есть 23 хромосомы.
Хромосомный микроматричный анализ позволяет выявить участки с потерей гетерозиготности, что актуально при однородительских дисомиях диагностика болезней геномного импринтинга. Хромосомный микроматричный анализ не выявляет сбалансированные хромосомные транслокации, инверсии, низкоуровневый мозаицизм, точковые мутации, экспансию тринуклеотидных повторов, а также изменения, находящиеся за границей разрешающей способности метода. Интерпретация клинической значимости структурных изменений, выявленных по хромосомному микроматричному анализу, проводится по специализированным базам данных например, OMIM. По результатам ХМА необходима консультация врача-генетика, который может оценить клиническую значимость выявленных изменений у конкретного пациента, установить окончательный диагноз и дать прогноз потомства. Отсутствие хромосомных нарушений по результату молекулярного кариотипирования не исключает генетической природы заболевания, в т. Множественных врожденных пороков и малых аномалий в сочетании с задержкой психомоторного развития и умственной отсталостью, аутизмом или судорожным синдромом у детей разного возраста 2.
Хромосомный микроматричный анализ (XMA)
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) -молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК по сравнению с набором проб или маркеров. Хромосомный микроматричный анализ при неразвивающейся (замершей) беременности. Хромосомный микроматричный анализ позволяет выявлять анеуплоидии (количественные изменения хромосом), а также вариации числа копий ДНК, такие как делеции. * Обычно при хромосомном анализе можно визуально определить лишь делеции более 7-10 МБ. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) разработан с целью выявления микроскопических и субмикроскопических вариаций числа копий генов (CNV) в геноме [9, 10]. Анализ производится с использованием ДНК-микрочипов. Разрешение метода обычно составляет десятки тысяч пар оснований.
ХМА экзонного уровня
Для получения первичной медико-санитарной помощи на бюджетной основе пациентам с предполагаемым диагнозом наследственного или врожденного заболевания необходимо наличие следующих документов: 1. Паспорт гражданина РФ, свидетельство о рождении или паспорт ребенка. Копия истории болезни или подробная выписка из истории болезни, иные медицинские документы по предполагаемому диагнозу, включая врачебные заключения, копии результатов лабораторного и функционального обследования. Медико-генетическое консультирование и генетические исследования проводятся по адресу: г. Москва, 115522, ул. Москворечье, д.
Разрешающая способность данного анализа от 50 тыc. Методы диагностики хромосомной патологии.
На Конгрессе молодых ученых обсудили вопросы этической экспертизы в сфере генетических исследований Заседание рабочей группы по нормативному правовому регулированию и биоэтике в сфере генетических технологий прошло под сопредседательством главы Минобрнауки России Валерия Фалькова, члена президиума Российской ассоциации содействия науке Марии Воронцовой и заместителя начальника Управления Президента Российской Федерации по научно-образовательной политике Елены Нечаевой. Валерий Фальков отметил, что сегодня область генетических технологий регулируется набором разной степени долженствования правил и постановлений, которые действуют и в международной, и в национальной правовых системах.
Выявляет триплоидии, микроделеции и хромосомные перестройки. Детальное исследование генома человека с наибольшей разрешающей способностью от 50 000 п. Используется для диагностики болезней, наследуемых по аутосомно-рецессивному типу, выявления участков хромосомы с потерей гетерозиготности и множества других аномалий. Когда будет готов результат В связи с трудоемкостью и клиническими особенностями проведения процедуры, ХМА занимает 30-60 дней с момента набора 8 пациентов на микрочип.
Срок готовности в прямой зависимости от количества пациентов на один чип. Предварительно записавшись на консультацию к генетику в МЖЦ, вместе с результатами анализа можно получить также их расшифровку, узнать о возможных последствиях хромосомных аномалий и методах их коррекции. Как пройти исследование Молекулярная диагностика генетических дефектов методом ХМА доступна в Экспериментальной лаборатории Медицинского женского центра на Земляном валу.
Услуга Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) - при каких болезнях и какие врачи назначают
Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек, не видимых в обычный микроскоп», — приводит. Анализ метилирования ДНК и анализ последовательности гена UBE3A позволяют обосновать диагноз приблизительно у 90 % пациентов. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) -молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК по сравнению с набором проб или маркеров. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) – метод исследования кариотипа человека, позволяющий выявить хромосомные нарушения, которые связаны с изменением структуры.
Хромосомный микроматричный анализ: характеристика, использование и эффективность метода
Например, автоматизация анализа цитогенетических препаратов значительно улучшила эффективность работы многих лабораторий, а технология ХМА объединяя тысячи. Покупайте и продавайте, следите за аналитикой и новостями в любой точке мира. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА), также известный как arrayCGH, представляет собой диагностический тест, который может обнаруживать клинически значимые крупные. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) – метод исследования кариотипа человека, позволяющий выявить хромосомные нарушения, которые связаны с изменением структуры.
Подробное описание исследования
- Вся структура генома в одном исследовании. Хромосомный микроматричный анализ
- ХМА при неразвивающейся беременности - Клиника «Центр ЭКО» Великий Новгород
- Зачем сдают хромосомный анализ
- Вы точно человек?
Вы точно человек?
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) пренатальный на ДНК-микроматрицах низкой плотности (350 000 маркеров) (пуповинная кровь) в Мерке. Хромосомный микроматричный анализ пренатальный Для кого: взрослые. Многочисленные отзывы о хромосомном микроматричном анализе подтверждают его важную диагностическую ценность. Хромосомный микроматричный анализ позволяет выявлять анеуплоидии (количественные изменения хромосом), а также вариации числа копий ДНК, такие как делеции.