HCV, РНК [реал-тайм ПЦР]: описание, синонимы, методы исследования, какой биоматериал можно использовать, как правильно подготовиться, для чего используется, когда назначается, что означают результаты. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) является мощнейшим инстументом современной молекулярной биологии. Статья автора «РИА Новости» в Дзене: ПЦР-тест — основной метод обнаружения коронавирусной инфекции.
Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК
Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR) — это точный метод лабораторной диагностики, который используют для выявления возбудителей инфекционных заболеваний. Можно ли употреблять алкоголь перед сдачей теста ПЦР и как это повлияет на результат? Маркеры гепатита С. Анализы методом ПЦР и ИФА для выявления в крови вируса гепатита С. Метод ПЦР позволяет идентифицировать в биологическом материале искомый участок генетического материала и обнаружить единичные молекулы ДНК микроорганизмов, не выявляемые другими методами. Разобравшись, чем отличается тест ПЦР от антител на КОВИД, удастся облегчить диагностику коронавирусной инфекции, избежать лишних финансовых трат на несвоевременные или недостоверные обследования. Как расшифровать ПЦР Как работает ПЦР тест Ответы на эти и другие вопросы читайте в статье на нашем сайте.
Маркеры гепатита С и расшифровка результатов количественного анализа HCV RNA
Если ПЦР, экспресс-тест и IgM-антитела отрицательные, это скорее всего значит, что в последние 2-3 недели коронавируса у вас не было. ПЦР или полимеразная цепная реакция является золотым стандартом в диагностике многих инфекций. Самостоятельно менять ПЦР-тест на, скажем, ИФА-тест не стоит: точность разных лабораторных методик может сильно различаться. ПЦР-тест (Мазок) на Коронавирус. Предназначение у него одно: определить есть ли вирус COVID-19 в организме в данный момент (Real-Time PCR).
Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен
По факту, чтобы «засечь» вирус в организме, с помощью специального фермента, собирающего из нуклеотидов по образцу вирусной ДНК ее копию, ученые дублируют фрагменты генетического материала вируса, пока их число не станет настолько большим, что будет возможно зафиксировать его присутствие с помощью флуоресцентных меток. Как это работает? Затем добавляют так называемые праймеры — начальные звенья цепочки, которые необходимы для старта синтеза новой копии, и так называемую полимеразу — тот самый фермент, который и будет заниматься репликацией ДНК. РНК-праймер изображен белым прямоугольником в начале каждой из двух цепей Как правило, для лабораторной ПЦР используются ДНК-полимеразы из термофильных бактерий, поскольку в течение реакции смесь многократно охлаждают и нагревают. На последующей стадии элонгации полимераза начинает синтез на каждой из двух цепочек разделенной ДНК недостающей пары. Происходит это по принципу комплементарности: фермент присоединяет напротив каждого нуклеотида, из которых состоят ДНК, противоположный. По завершении реакции цикл неоднократно повторяется см.
Общая схема полимераной цепной реакции. Цифрами обозначены ее этапы. В случае с вирусами, содержащими не «двойную» ДНК молекулу, а «одинарную» РНК а это коронавирусы, или, например, ВИЧ , ученым приходится сначала провести обратную транскрипцию РНК с помощью фермента обратной транскриптазы, а уже потом производить амплификацию по той схеме, что была указана выше. Именно так, собственно, поступает и сам вирус, попадая в клетку, перед тем как встроить свою ДНК в человеческую и приступить к синтезу собственных белков, из которых состоит его «тело» то есть не генетического материала, а самих вирусных частиц, при ПЦР же, наоборот, копируется генетический материал, а не новые частицы вируса. Ингибиторы обратной транскриптазы — одни из самых распространенных видов лекарств от ВИЧ-инфекции. К ним относятся, например, зидовудин и ламивудин — самые первые препараты АРВТ, разработанные еще в 80-х.
Производится ПЦР на специальных приборах, амплификаторах, или так называемых термоциклерах Thermal cycler. Наглядно, как работает метод ПЦР, можно посмотреть на приведенном ниже видео. У теста на антитела свои преимущества. Но я бы сказала так: они с ПЦР-тестом дополняют друг друга.
До процедуры не курить. Также следует предупредить доктора о принимаемых лекарственных препаратах, возможных проблемах со здоровьем, хронических заболеваниях. Забор крови выполняется из вены. После окончания процедуры место прокола медсестра заклеивает стерильным пластырем, предупреждает о необходимости согнуть руку и держать ее в таком положении 10—15 минут. В противном случае высока вероятность появления болезненной гематомы. Сколько по времени делается исследование? Сколько делается анализ, зависит от лаборатории. Средний срок выполнения колеблется в пределах 1—3 дней. Некоторые клиники предоставляют платную услугу быстрой постановки ПЦР, однако время проведения ограничивается возможностями медицинской аппаратуры. В поликлинике результаты могут передаваться врачу в течение 7—10 дней. Это связывают с большим наплывом пациентов. При этом биологический материал хранится в соответствии со всеми требованиями. Расшифровка результатов Как правило, расшифровка качественной ПЦР не представляет сложности. Но во избежание ошибочной трактовки, с полученным из лаборатории бланком следует обратиться к врачу. Варианты, что означает та или иная разновидность ПЦР, приведены в таблице. Вид исследования Возможный результат и предполагаемая расшифровка Качественная ПЦР Отрицательный: человек здоров либо концентрация вирусной РНК в крови слишком мала для детекции. Положительный: человек инфицирован Проводится, если обнаружено РНК вируса качественным методом исследования. В зависимости от того, какие результаты анализов получены, определяется уровень вирусной нагрузки Генотипирование Проводится при гепатите С, подтвержденном другими методами исследования. Анализ позволяет установить точный генотип возбудителя патологии Но нередко возникает ситуация, когда ИФА на гепатит С положительный, а ПЦР отрицательный. Расшифровать такие результаты анализов может только врач. Однако подобные данные возможны в следующих случаях: беременность; перенесенный в острой форме гепатит С; пройденный курс лечения от HCV; наличие инфекций, повышающих вероятность ложноположительного результата ИФА. Только полимеразная цепная реакция показывает точное наличие вирусной инфекции в организме. Но врачу следует точно установить причину ложноположительного результата. Качественный анализ Анализ ПЦР качественный на гепатит С подтверждает присутствие возбудителя заболевания в крови. Если РНК вируса не обнаружена, человек здоров. Но при подозрении на инфицирование рекомендуют повторно пройти исследование. Положительный результат свидетельствует об инфицировании. Но этот анализ не позволяет дифференцировать хронический гепатит С от острого, и не может показать, насколько активен патологический процесс. Количественный тест Количественный анализ методом ПЦР проводится после подтверждения диагноза и его расшифровка важна для определения тактики лечения. В зависимости от концентрации частиц возбудителя гепатита С выделяют несколько степеней вирусной нагрузки: средняя, высокая и низкая. Чем больше показатель, тем тяжелее протекает инфекция и сложнее терапия. В норме вирусная РНК отсутствует в крови.
ПЦР-диагностика метод полимеразной цепной реакции показывает намного более достоверные и ранние результаты: при помощи методики ПЦР возможно выявление генетического материала вируса всего через 10-12 дней после инфицирования, задолго до того момента, когда в крови появятся специфические иммуноглобулины или будет возможным выявление биохимических маркеров нарушения работы печени. Выделяют шесть генотипов и несколько субтипов HCV, которые определяют как особенности болезни и прогнозы для пациента, так и подбор лекарственных средств. Анализ высоко чувствителен и специфичен и считается «золотым стандартом» диагностики заражения и финального контроля эффективности терапии. Так, результат лечения альфа-интерфероном оценивают через 24 недели по окончании курса по наличию или отсутствию РНК HCV в крови. В результатах исследования указывается, есть ли вирус в организме или нет при отсутствии инфицирования или при выздоровлении.
Нет смысла выдерживать паузу в течение предполагаемого инкубационного периода венерической инфекции. Анализ можно сдавать сразу после того, как возникли подозрения о возможном заражении или развитии инфекционного агента. ПЦР: результат отрицательный Отсутствие возможности даже ускоренного ферментами удвоения фрагментов генетического материала говорит об отрицательном результате исследования. Чаще всего при отрицательном результате речь идет о том, что специфические для искомого возбудителя ДНК или РНК не обнаружены. Или концентрация генетического материала ниже пороговой чувствительности теста. Как выглядит бланк результатов ПЦР анализов? Первый вариант говорит о наличии инфекционного процесса, вызванного искомым возбудителем. Второй — об отсутствии генетического материала инфекционного агента или его количестве ниже порога чувствительности. Расшифровка результатов ПЦР исследований проводится в тот же день, когда получены результаты или в момент обращения к врачу. Время получения данных анализа составляет от нескольких часов до трех суток в зависимости от лаборатории.
ПЦР: сверхчувствительная диагностика инфекций
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — высокоточный метод диагностики заболеваний, основанный на копировании ДНК или РНК патогена в пробе. Расшифровка результатов ПЦР-анализа на папилломавирус, Digene-теста и их разновидностей не отличаются, поскольку количество микроорганизмов и их тип не зависит от метода обнаружения. За звучной аббревиатурой ПЦР скрывается сложная и не слишком понятная для рядового пациента расшифровка — полимеразная цепная реакция.
ПЦР диагностика: что это такое
Если количественный анализ на ПЦР выявляет сильное воспаление и фиброз, больному прописывают курс лечения противовирусными препаратами. В ситуациях, когда большое количество вирусных частиц сочетается с высоким показателем АЛТ, пациенту незамедлительно должно быть назначено лечение без проведения дополнительных диагностическим мероприятий. Качественно расшифровать показатели при количественном анализе крови на гепатит могут только квалифицированные и опытные специалисты, а современные технологии помогают сделать это при низкой концентрации вируса в крови. Читайте также: Анализы на гепатит C Качественный анализ ПЦР направлен на определение и подтверждение фактического присутствия вируса в организме.
Его проводят при обнаружении в крови антител к гепатиту. Страдает не только печень, но и соседние органы Преимущества ПЦР При исследовании методом ПЦР и расшифровке анализа крови на гепатит можно также определить генотип возбудителя заболевания. Всего существует 6 генотипов вируса и большое количество субтипов, однако в нашем регионе распространение получили 1, 2 и 3 генотипы.
Другими преимуществами данного вида диагностики являются: высокая точность полученных показателей и низкая вероятность ошибки в них; высокий уровень чувствительности к вирусным частицам в крови; возможность выявления сразу нескольких возбудителей; диагностика болезнетворных внутриклеточных микроорганизмов, обладающих высокой антигенной изменчивостью; работа с расшифровкой анализа на гепатит позволяет обнаружить скрытые текущие инфекции. Кому назначают Анализ ПЦР на гепатит обязательно сдают следующие категории людей: беременные женщины; потенциальные доноры крови и органов; те, кто имеют характерные признаки заболевания; ВИЧ-инфицированные лица; лица, ведущие беспорядочную половую жизнь. Планируя ребенка, необходимо сделать анализ на гепатит Как проводится анализ и требуется ли к нему подготовка Забор крови для ПЦР-исследования производится из вены.
Как правило, это происходит утром до того, как человек поел, поскольку после приема пищи должно пройти минимум 8 часов. В крайних случаях кровь могут взять на исследование днем или вечером, но временной зазор между анализом и приемом пищи должен составлять не менее 5 часов.
Опасными в плане развития рака сегодня считаются штаммы под номерами HPV 70, 68, 64, 59, 50, 39, 33, 31, 18, 16. Их называют вирусами высокого онкогенного риска ВКР. Данные штаммы провоцируют опухоли шейки матки, вульвы, влагалища у женщин и полового члена у мужчин. В последние годы публикуется информация например, в журнале Journal of Clinical Oncology и других медицинских изданиях о связи ВПЧ с раком полости рта, горла, ануса, прямой кишки, что связывают с распространением орального и анального секса, в том числе среди однополых партнеров. Пик заражения ВПЧ всегда приходится на начало активной половой жизни, а вот риск развития рака повышается с возрастом и накопленными болезнями.
Чем старше человек, и чем дольше он инфицирован онкогенным штаммом, тем выше опасность. Читайте также: Молочница и цистит. Связаны ли они? Виды анализов на папилломавирус Карцинома шейки матки — самое распространенное заболевание, связанное с инфицированием папилломавирусом, от него до сих пор ежегодно умирает несколько сотен человек. Поэтому все женщины должны ежегодно проходить гинекологический осмотр с цитологическим мазком, а после 30 лет — сдавать анализ на ВПЧ. Бесплатно по полису ОМС такой анализ не делают. В поликлинике по месту жительства можно выполнить только цитологический мазок.
Мужчины сталкиваются с анализами, если инфицирована их партнерша партнер , поскольку лечение надо проходить одновременно, или у них самих обнаружены поражения, связанные с ВПЧ — кондиломы, болезнь Боуэна, бовеноидный папулез. Сегодня для выявления ВПЧ в организме применяется два метода молекулярной биологии: полимеразно-цепная реакция; метод гибридного захвата digene-test. Существуют и другие методы, но они используются редко и не стандартизированы. И ПЦР, и дайджин-тест достаточно информативны и точны. Между ними есть сходства — оба основаны на выявлении ДНК вируса в клетках эпителия человека, биоматериал для анализа берется одинаково. Различия состоят в способах обработки материала и получения результата. Что такое полимеразно-цепная реакция Прогрессивная методика, разработка которой продвинула вперед многие области науки, в том числе медицины.
Метод основан на многократном умножении отдельных фрагментов ДНК в полученном клеточном материале. Для выполнения анализа на папилломавирус используется специальный прибор-аплификатор. К ней добавляют вещества-праймеры, и полученная смесь охлаждается. После этого в смесь добавляется фермент ДНК-полимераза и нуклеотиды. Смесь снова нагревается до температуры 37 градусов, при которой будет происходить нужная реакция. Если искомая последовательность присутствует в материале совпадает с добавленным праймером , то нуклеотиды присоединяются к концам праймеров, и участок ДНК удваивается путем естественной репликации. Затем процесс повторяется многократно, до накопления требуемого количества фрагментов, которые удается распознать.
Таким образом можно выявить даже единичный вирус или бактерию в организме, поэтому метод очень точный. Однако стоимость его высока, поскольку полученный материал нужно много раз нагреть и охладить за короткий промежуток времени. Температура в аппарате при этом контролируется до 0,1 градуса. Читайте также: «Ламизил» от грибка ногтей. Обычно тот или иной тип анализа рекомендует лечащий врач, потому что именно он оценивает полученные результаты, одновременно учитывая клинические проявления и индивидуальный анамнез пациента. Общий анализ ПЦР Анализ может быть упрощенным. Он называется ВПЧ скрининг.
В этом случае исследуется ДНК одного или сразу определенной группы штаммов, имеющих высокую онкогенность. Отдельные штаммы при этом не выделяются.
Какой биоматериал можно использовать для исследования? Венозную кровь. Как правильно подготовиться к исследованию? Не курить в течение 30 минут до исследования. Он способен размножаться в клетках крови нейтрофилах, моноцитах и макрофагах, В-лимфоцитах и вызывать криоглобулинемию, болезнь Шегрена и В-клеточные лимфопролиферативные заболевания. HCV благодаря высокой мутационной активности может избегать воздействия защитных механизмов иммунной системы.
Существует 6 генотипов и множество субтипов вируса, которые имеют разные значения для прогноза развития заболевания и эффективности противовирусной терапии. Основной путь передачи инфекции — через кровь препараты для переливания элементов крови и плазмы, донорские органы, нестерильные шприцы, иглы, инструменты для татуирования, пирсинга. Вероятно заражение при половом контакте и ребенка от матери во время родов, но это случается нечасто.
Если и в этом случае значение остается сомнительным, то тогда прибегают к применению альтернативных, дополнительных методов исследования. Таким образом, «сомнительный» итог как и любой другой является следствием объективных причин: биологических процессов, происходящих в организме пациента. В отличии от антител IgG этот анализ не покажет, болели ли Вы ранее.
Он покажет только наличие вируса к моменту исследования. Как правило, именно он требуется для получения справок об отсутствии коронавирусной инфекции. Сам забор — очень прост.
«Вероятность обнаружить вирус снижается». Когда нужно сдавать ПЦР-тест
| Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК | Что представляет собой анализ методом ПЦР? |
| Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК | Метод ПЦР позволяет идентифицировать в биологическом материале искомый участок генетического материала и обнаружить единичные молекулы ДНК микроорганизмов, не выявляемые другими методами. |
| Что такое анализ ПЦР и как его проводят | Отрицательный ПЦР ("не обнаружено ") тест мазка на короновирус говорит, чтобы вы не выделяйте вирус в окружающую среду и не заразны для окружающих. |
| Что такое ПЦР, и с чем её едят | Пикабу | Иностранные граждане обязаны предъявить отрицательный результат ПЦР-тестирования, проведённого не ранее чем за два дня до прибытия на территорию Российской Федерации. |
| Что такое анализ ПЦР и как его проводят | Чтобы это сделать, мы разрабатываем ПЦР-тест, который будет «смотреть» конкретно этот вариант из всего генома, есть он у человека или нет. |
Анализы на коронавирус. Какие сдавать и что означают результаты?
| Анализ ПЦР на гепатит В (Б): качественный и количественный. Расшифровка: норма и отклонение | Результаты ПЦР – когда готовы, расшифровка. Опытный венеролог: как быстро получить результаты анализов ПЦР. |
| Чувствительность определения 60 МЕ/мл — что это значит? - Gepatit ABC | ПЦР, или полимеразная цепная реакция, представляет собой метод обнаружения инфекций. |
ПЦР-диагностика: что это такое?
- Результаты ПЦР: расшифровка и интерпретация.
- ПЦР: сверхчувствительная диагностика инфекций
- Анализ ПЦР на гепатит С: качественный, количественный, показания и подготовка | MedAboutMe
- Сколько стоит сдать ПЦР-анализ
О рекомендациях, как подготовиться к сдаче ПЦР-теста на COVID-19
| Что такое анализ ПЦР и как его проводят | эксперт Читайте онлайн публикации на актуальные темы на интернет-портале |
| Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен | Полимеразную цепную реакцию (ПЦР, PCR) изобрёл в 1983 году Кэри Мюллис (американский учёный). |
| Одним мазком: тест на COVID-19 правдивее на восьмой день после заражения | Статьи | Известия | ПЦР-тест (Мазок) на Коронавирус. Предназначение у него одно: определить есть ли вирус COVID-19 в организме в данный момент (Real-Time PCR). |
| Маркеры гепатита С и расшифровка результатов количественного анализа HCV RNA | Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью. |
| Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК | Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью. |