Полимеразная цепная реакция: описание метода диагностики, показания, преимущества, подготовка, сроки, стоимость. Пройдите ПЦР в клинике ПрофМедЛаб.
Как определить коронавирус или что такое анализ ПЦР?
Результат первичного тестирования может быть как подтвержден, так и не подтвержден референсным центром. При получении первично-положительного результата пациенту необходимо соблюдать режим самоизоляции до получения результата подтверждающего теста. Формулировка «обнаружено» в результате подтверждающего теста означает, что исследование пробы пациента выполнено дважды, первично положительный результат подтвержден дополнительным исследованием в референсном центре. При получении окончательного результата «обнаружено» заболевшему предписывается соблюдать режим самоизоляции и обратиться к врачу. К сожалению, ПЦР-диагностика иногда может давать ошибочные результаты. Причины ложноотрицательных результатов человек болен COVID-19, а результат теста отрицательный : количество вируса в образце меньше порога чувствительности тест-системы из-за некорректной подготовки пациента к исследованию или из-за небольшого количества вируса в организме низкая вирусная нагрузка , например, при бессимптомном течении или в период выздоровления; некорректное взятие мазка — например, только из зева или только из носа, погрешности в технике забора материала; нарушение рекомендованного срока хранения взятого образца; ненадежная система идентификации образцов, что ведет к получению чужого результата. Исследование на антитела к коронавирусу Антитела, или иммуноглобулины — специальные белки, которые вырабатывает иммунная система человека в ответ на попадание в организм любого инфекционного агента, в том числе SARS-CoV-2.
Они могут сохраняться в организме человека до 2-3 месяцев. Поэтому их обнаружение говорит о текущей или недавно перенесенной инфекции. Длительность их сохранения в организме на сегодняшний день точно неизвестна.
Что это за метод, как его проводят и в чём его достоинства?
На эти и другие вопросы отвечает Владислав Александрович Чередниченко, врач-инфекционист, заместитель директора по развитию «Клиника Эксперт» Воронеж. Севиля Ибраимова 13 ноября 2019 Перечень анализов, проводимых при помощи ПЦР-диагностики расширяется с каждым днём. ПЦР или, иначе, полимеразная цепная реакция — это современный высокоинформативный метод молекулярно-генетической диагностики, активно применяемый для выявления у человека различных инфекционных и наследственных заболеваний. Официальной датой изобретения этого метода диагностики считают 1983 год, а «родителем» - американского биохимика Кэри Муллиса.
Результат оценивается либо положительно, когда бактерия или вирус выявляются в исследуемом образце, либо отрицательно, что означает отсутствие инфекции в организме. Кроме того, ПЦР дает информацию о количестве возбудителя, что важно при выборе схемы лечения. Количественные результаты оцениваются непосредственно врачом, поскольку этот показатель индивидуален. Ещё одно достоинство метода — он обнаруживает даже мизерное количество вирусов и бактерий и, соответственно, распознаёт болезнь, когда видимых клинических проявлений ещё нет.
Это свидетельствует о том, что при обнаружении вирусной РНК на этой стадии люди перестают быть заразными. Поэтому Корейский центр по управлению и контролю за болезнями больше не требует изоляции в таких случаях. В общей популяции пациенты у которых была коронавирусная инфекция в течение 10-14 дней, вероятно, больше не представляют опасность для окружающих. Однако это правило может не распространяться на все категории пациентов, в частности, иммунокомпрометированных пациентов или тяжело больных пациентов, находящихся в больнице. Ann Intern Med. Troy Brown, RN.
Статьи по теме
- ПЦР диагностика: что это такое
- Ученый раскрыл правду о тестах на коронавирус: почему бывают ошибки
- Положительный ПЦР-тест на коронавирус после выздоровления, как правило, не опасен
- Специалист лаборатории объяснила, почему ПЦР-тесты на коронавирус могут выдавать ошибку
Анализ ПЦР на гепатит C
Другие виды исследования могут оказаться ложноотрицательными из-за того, что в образце недостаточно много вирусов или бактерий или организм не успел выработать достаточное количество антител. ПЦР-анализ проводится на образце одного из следующих видов биоматериала: кровь, слюна, слизь, ткань, гной, мокрота, моча. Этот процесс называется ПЦР с обратной транскрипцией. Обнаружение вирусной РНК с помощью ПЦР позволяет обеспечить диагностику COVID-19 на ранней стадии - до того, как организм выработает ответ в виде антител или даже до того, как у человека появятся симптомы заболевания. Тесты ПЦР играют решающую роль в предотвращении распространения заболеваний, так как часто позволяют выявить инфекции на ранней стадии, еще до появления симптомов. Количественный ПЦР-анализ позволяет оценить инфекционную нагрузку на организм, а также используется для анализа изменений экспрессии генов в опухолях. Важна также и высокая скорость проведения исследования. В отличие от традиционного посева при выявлении бактериальных инфекций, который занимает несколько дней, ПЦР тест обычно выполняется в течение суток. Это значительно увеличивает вероятность назначения своевременного лечения. Кроме того, с помощью ПЦР можно определить латентных носителей инфекции.
Необходимо строго соблюдать правила сбора биоматериала и его хранения. Важно выбрать правильное время взятия биоматериала и выполнить правила подготовки к тесту.
Метод, с помощью которого был проведен лабораторный анализ.
На сегодняшний день золотым стандартом в диагностике коронавирусной инфекции является ПЦР-тест. Дополнительным методом диагностики является иммуноферментный анализ, позволяющий определить наличие в крови антител, вырабатываемых иммунитетом к конкретному возбудителю. Если результаты ПЦР-диагностики положительные, это говорит о том, что человек на данный момент болен и является носителем инфекции, распространяя ее на окружающих.
Самочувствие пациента. Если анализ теста на коронавирус положительный, но самочувствие пациента нормальное, он все равно является носителем COVID-19. Поэтому чтобы инфекция не распространялась, человек должен строго соблюдать правила двухнедельной самоизоляции.
В этом случае прекращаются все контакты с посторонними людьми. В случае сочетания положительного теста с выраженными симптомами коронавируса мучительный кашель, высокая температура, потеря вкуса и обоняния , пациент может нуждаться в госпитализации. В некоторых случаях инфекция, попавшая в организм, вызывает тяжелые осложнения: вирусную пневмонию, сердечную и легочную недостаточность, расстройства в работе печени, почек, головного мозга.
В таких ситуациях больной нуждается в постоянном медицинском наблюдении и специальном лечении, которое возможно осуществить только в условиях стационара. В любом случае, если человек получил положительный тест на COVID-19, что предпринимать дальше самостоятельно он не решает. Скрыть результаты тестирования тоже не представляется возможным, так как оно проводится в лабораторных учреждениях, контролируемых Министерством Здравоохранения и Роспотребнадзором.
В эти организации сразу же отправляются сведения о новых выявленных больных коронавирусом.
Их можно обнаружить в крови человека в период от пяти до семи дней после заражения. В острый период болезни их концентрация будет максимальной.
Обычно ко второй неделе заражения организм вырабатывает антитела класса IgG, чтобы «запомнить врага». Такие антитела сохраняются долгое время после выздоровления. Биоматериалом для исследования антител является кровь из вены.
До сдачи анализа нельзя есть в течение восьми часов, запрещено ужинать накануне жирной пищей, а за 24 часа — пить алкоголь и употреблять лекарства. Кроме того, за два часа до сдачи крови нельзя курить, физически и эмоционально перенапрягаться, пить можно только негазированную воду.
Если результат положительный — его повторяют, и только в случае двойного положительного результата пациенту сообщают о болезни. Анна Солдатова.
Ученый раскрыл правду о тестах на коронавирус: почему бывают ошибки
Критериями выздоровления были отсутствие повышенной температуры в течение 3 дней подряд, снижение симптоматики и 2 отрицательных ОТ-ПЦР теста на РНК коронавируса с интервалом 24 часа. При этом только у одного из пациентов имелась и репликативная субгеномная РНК. Она присутствует внутри клетки, но не упаковывается в вирионы, следовательно, ее наличие говорит о том, что вирус поражает клетки больного, то есть о рецидиве или повторном заражении. Авторы отмечают, что этот пациент был пожилым, имел хронические заболевания и симптомы инфекции на момент тестирования на 16-й день после выздоровления.
Также на репликативную РНК были проверены и предыдущие образцы от 32 пациентов с обнаруженной общей РНК , полученные на момент постановки диагноза и хранившиеся в замороженном виде.
Подготовка к анализу зависит от того, какой биологический материал вы сдаете. Если кровь, то особо готовиться не надо. Для других материалов есть несложные правила — если их соблюдать, анализ будет точнее. Если вам назначили качественный ПЦР-анализ, имеет смысл сдавать его или в государственной лаборатории если обследование положено по ОМС , или в частной, где окажутся подходящие цены. Если вам назначили количественный ПЦР-анализ, врач напишет в направлении не только название исследования, но и предпочтительный метод, которым нужно провести ПЦР-анализ.
Но, по ее словам, пока нет в наличии коммерческих тест-систем, которые способны отличить «боеспособный» коронавирус от его фрагментов. Дмитрий Денисов, медицинский директор лабораторной службы «Хеликс», дополняет, что, согласно исследованиям, вирусная РНК может выделяться со слизистых верхних дыхательных путей до 21-го дня с момента появления симптомов или начала активной репликации вируса при бессимптомном течении заболевания, иногда даже более этого срока. А наиболее активно вирус выделяется за 1—3 дня до появления симптомов. Прежде всего необходимо понять, какой именно тест-системой пользовался человек. Доктора рекомендуют перепроверять результаты домашних экспресс-тестов в лабораториях Источник: Александр Ощепков При ситуации, когда положительный результат в течение месяца подтверждается лабораторией, важно понять, есть ли у человека какие-то жалобы и симптомы болезни, добавляет врач. Если симптомы отсутствуют и самочувствие человека не страдает, то, вероятнее всего, этот человек — носитель коронавируса. Ему необходимо минимизировать контакты, носить маску и получить консультацию инфекциониста, — считает Олеся Миропольская. По ее словам, это зависит от иммунной системы организма и «дозы» вируса, полученной человеком: — Положительный ПЦР часто бывает в течение трех недель, но может держаться и месяц. Иногда у пациента уже прошли клинические симптомы, например, вылечили пневмонию, но вирус остается. Этот человек является вирусовыделителем. Иногда мы таких пациентов выписываем, но предупреждаем, что нужно изолироваться. Андрей Поздняков, врач-инфекционист, главный врач клинико-диагностической лаборатории ООО «Инвитро — Сибирь», напротив, замечает, что сейчас превалирующим штаммом является «дельта», кардинальное отличие которого заключается в том, что он активно размножается в организме: — Отсюда его способность «пробивать» иммунную защиту. Более активное размножение в сравнении ведет к тому, что вирусных частиц на оболочках слизистых становится на несколько порядков больше. Соответственно, они более длительное время могут улавливаться методиками обнаружения, в том числе ПЦР.
При этом зондом нельзя собирать слюну и касаться щек, языка, десен или губ. Метод ПЦР позволяет определить наличие возбудителя заболевания, даже если в пробе присутствует всего несколько молекул ДНК возбудителя. В некоторых лабораториях могут озвучить результаты анализа уже на следующий день. За три часа до сдачи анализа нельзя есть, пить, курить, полоскать рот и жевать жвачку. Что показывает тест на антитела IgM и IgG? Это дополнительный метод диагностики, который может уточнить стадию заболевания или показать, что человек уже переболел ковидом. Тест показывает наличие в организме антител к вирусу — белков, которые вырабатываются в организме при инфицировании.
Чем ПЦР отличается от антител и какой анализ россиянам нужно сдавать при подозрении на ковид?
Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR) — это точный метод лабораторной диагностики, который используют для выявления возбудителей инфекционных заболеваний. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – молекулярно-генетический анализ. ПЦР расшифровывается как “полимеразная цепная реакция”. Такой метод диагностики направлен на обнаружение РНК коронавируса COVID-19.
Может ли ПЦР-тест на COVID-19 показать положительный результат при простуде
Он пояснил, почему зачастую ПЦР тест "обманывает". Одна из причин - небрежный забор биоматериала из носоглотки. Это приводит к тому, что тест становится неинформативным. А вот есть он или нет у человека - зависит от того, насколько технически правильно был взят мазок. Иными словами, если есть клиника вирусной пневмонии, но тест отрицательный, то всё равно лечим как COVID.
Или повторяем тест после забора материала во время бронхоскопии. Тест требует специальной довольно сложной аппаратуры. Его сверхчувствительность приводит и к нежелательным последствиям. Тест может определять "обрывки", фрагменты вируса и приводить к ложноположительным результатам.
Исходя из этого, лечащий врач должен сам принять решение о целесообразности терапии, взяв во внимание и другие аргументы «за» и «против». Например, при диагностике хламидийной инфекции, где ПЦР относится к основным методам, наряду с хламидией, можно обнаружить и нейссерию гонококк — возбудитель гонореи. Причем, на достоверности результатов это негативно не отражается; Тестирование методом ПЦР выявляет опасные микроорганизмы в инкубационном периоде, когда они еще не успели нанести ощутимый вред организму, то есть, ранняя диагностика предупреждает о грядущем развитии патологического процесса, что дает возможность подготовиться к нему и принять во всеоружии. Кроме этого, во избежание недоразумений, иной раз возникающих при диагностике, ПЦР защищает себя еще и тем, что ее результаты могут зафиксироваться фотография, компьютер с целью использования их в экспертных целях, если будет на то необходимость. Нормой в ответах ПЦР считают отрицательный результат, указывающий на отсутствие фрагментов чужеродных нуклеиновых кислот, положительный ответ будет свидетельствовать о наличии инфекции в организме, цифровые значения означают состояние вируса и его концентрацию на момент тестирования. Однако полную расшифровку анализа осуществляет врач, прошедший специальную учебу по теме «ПЦР».
Пытаться же интерпретировать результаты самостоятельно не имеет никакого смысла, поскольку можно, что скорее всего и произойдет, неправильно понять и начать заранее волноваться. Чего «боится» ПЦР, что она умеет и как к ней подготовиться? Как в любых других исследованиях, иной раз результаты теста оказываются ложноположительными или ложноотрицательными, где ПЦР исключением не является. Подобное может происходить в случаях: Нарушения технологического процесса на одном из этапов реакции; Несоблюдения правил забора материала, его хранения или транспортировки; Присутствие посторонних примесей в материале. Это говорит о том, что к ПЦР — диагностике инфекций нужно подходить внимательно, осторожно и аккуратно, иначе образцы материала могут поменять свое структурное строение или вовсе разрушиться. Этапы ПЦР-диагностики.
В первую стадию денатурация происходит так называемое раскручивание ДНК — то есть разделение связанных между собой двух цепей ДНК. Во вторую отжиг - происходит присоединение праймера к участку нити ДНК. И, наконец, в заключительной третьей стадии, "фермент-строитель" достраивает нити, восстанавливая ДНК. В настоящее время весь этот сложный процесс протекает в одной пробирке и состоит из повторяющихся циклов размножения амплификаций определяемой ДНК с целью получения большого количества копий, которые могут быть, затем выявлены обычными методами. То есть из одной нити ДНК мы получаем сотни тысяч или миллионы копий.
Поначалу для каждой стадии использовали отдельную водяную баню, что сильно увеличивало время получения результата. Поставить "на поток" метод помогли специальные автоматические термостаты - амплификаторы, в которых изменение температуры происходит по заданной программе. Современный амплификатор — сложный электронный прибор, не только управляющий циклами амплификации и поддерживающий необходимые температуры, но и делающий количественные замеры после каждого цикла. В её основе лежит принцип флуоресцентной детекции продуктов ПЦР непосредственно в ходе амплификации. Детекция продуктов амплификации проводится прямо в реакционной среде через стенки или крышку закрытой пробирки.
Для этого в состав реакционной смеси, наряду с праймерами и другими компонентами реакции, добавлены специальные флуоресцентные метки зонды. Флуоресцентный зонд выполнен по той же технологии, что и праймер и отличается он него тем, что на одном его конце прикреплена флуоресцентная молекула флуорофор , а на другом конце расположена специальная молекула-гаситель флуоресценции. За счёт близости гасителя, энергия поглощаемая флуорофором не вызывает флуоресцентного свечения, а целиком передаётся гасителю. При этом, при облучении смеси ультрафиолетом, флуоресцентный отклик полностью отсутствует. Дальше всё происходит, так же, как было описано выше: В ходе ПЦР при повышении температуры происходит денатурация ДНК с распадом на две половинки.
Зонд вместе с праймерами присоединяется к комплементарному участку ДНК. При этом флуорофор и гаситель освобождаются, расстояние между ними увеличивается и эффект гашения перестаёт работать. Теперь при облучении смеси ультрафиолетом, мы получим устойчивый флуоресцентный сигнал-отклик от флуорофора. Изготавливая молекулы флуорофора с разным цветом свечения можно проводить одновременный поиск разных возбудителей в одной пробирке. Большинство используемых сегодня, для ПЦР диагностики, амплификаторов , относится к классу автоматических, высокоскоростных многофункциональных Real Time аппаратов.
Они позволяют проводить множественный ПЦР анализ до 5 мишеней цветных флуоресцентных красителей в 96 пробирках одновременно. Это полностью автоматические термоциклеры со встроенным оптическим блоком и возможностью детекции накопления продуктов амплификации непосредственно в пробирке во время протекания реакции. Весь процесс амплификации протекает в закрытых одноразовых пробирках, считывание происходит через прозрачные стенки пробирок, без их открытия. Но они напрямую связаны с его достоинствами и с тем, что называется "человеческим фактором".
Можно провериться на большее или меньшее количество ЗППП, даже на одно. ПЦР анализ на хламидии является наиболее информативным среди всех остальных. Биологический материал для мужчин и женщин — кровь или мазок. Для выявления микоплазмы целесообразнее брать мочу или соскоб. Но нужно учитывать, что точность уретрального или влагалищного мазка превосходит исследование мочи.
Востребованным является ПЦР 6, в который входит хламидиоз , уреаплазмоз , микоплазмоз ДНК mycoplasma genitalium и mycoplasma hominis , гарднереллез , трихомониаз. Показания Анализ ПЦР на ЗППП назначают для дифференциальной диагностики при появлении следующих симптомов: боль внизу живота, в том числе во время полового акта; специфические выделения из влагалища: желтые, серые, зеленые, гнойные, пенистые, водянистые, с неприятным запахом и т. ИППП могут протекать бессимптомно, особенно у мужчин. Но даже при бессимптомном течении их нужно лечить, поскольку они провоцируют возникновение тяжелых осложнений. Показанием к молекулярной диагностике методом ПЦР в урологии и гинекологии является: воспаление шейки матки, простаты, уретры, органов малого таза; бесплодие у мужчин и женщин; эректильные нарушения. Анализ на скрытые инфекции требуется после незащищенного полового акта с постоянным при наличии симптомов ЗППП или незнакомым партнером, на этапе подготовки к беременности , а также по окончанию лечения половых инфекций.
Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен
Результат ПЦР-диагностики может быть либо положительным, либо отрицательным. Положительный результат говорит о том, что в организме человека обнаружены следы инфекции, причем именно в данный момент времени. это крайне чувствительная вещь, то он не отличает живой вирус от мертвого. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – это современный инструмент диагностики разнообразных инфекций, отличающийся высокой точностью. ПЦР, бактериологические посевы.
Сколько можно! Почему долгое время держится положительный ПЦР-тест на коронавирус
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – наиболее информативный, точный и современный метод диагностики инфекционных заболеваний, позволяющий обнаружить возбудителя в организме пациента, даже если количество вредоносных клеток исчисляется единицами. ПЦР расшифровывается как полимеразная цепная реакция. Данная реакция обеспечивает многократное воспроизводство определённых участков ДНК. Сделать ПЦР-диагностику в Москве Вы можете в лаборатории АО «Семейный доктор». Что такое ПЦР-исследование? Полимеразная цепная реакция — основной метод, который Минздрав рекомендует для выявления ковида. У человека берут биологический материал из ротоглотки. ПЦР (полимеразная цепная реакция) – достижение молекулярной биологии, одна из главных методик клинической лабораторной диагностики конца 20-го и начала 21-го веков, приносящая огромную пользу в различных областях медицинской науки.
Лабораторная диагностика коронавирусной инфекции
- ПЦР - что это такое простыми словами, преимущества ПЦР анализов
- ПЦР тест на коронавирус: что это и как проводится диагностика
- Что это такое
- Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
О видах исследований на новую коронавирусную инфекцию COVID-19
Полимеразная цепная реакция: описание метода диагностики, показания, преимущества, подготовка, сроки, стоимость. Пройдите ПЦР в клинике ПрофМедЛаб. На ранних стадиях болезни получить положительный результат значительно выше. «После четвертого-пятого дня болезни вероятность обнаружить вирус в носоглотке снижается, а респираторные симптомы могут быть в это время в самом разгаре. ПЦР расшифровывается как полимеразная цепная реакция.