Хромосомный микроматричный анализ. Моногенные наследственные заболевания. Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек организма, не видимых в обычный микроскоп.
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА)
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) — метод исследования кариотипа человека, который может выявить хромосомные нарушения, связанные с изменением структуры или. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) представляет собой сложную молекулярную технологию, позволяющую провести полногеномную амплификацию с последующим анализом. Многочисленные отзывы о хромосомном микроматричном анализе подтверждают его важную диагностическую ценность. В уфимском Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА). Хромосомный микроматричный анализ (ХМА), также известный как arrayCGH, представляет собой диагностический тест, который может обнаруживать клинически значимые крупные.
Хромосомный микроматричный анализ
Это единственные клеточные органеллы, у которых есть собственная ДНК. И в ней тоже могут возникать нарушения. Весь набор хромосом в клетке называется кариотипом. В норме у человека он представлен 23 парами хромосом, всего их 46. Выделяют два вида хромосом: 22 пары аутосом одинаковы у мужчин и женщин. В каждой паре хромосомы имеют одинаковую длину и содержат одинаковые наборы генов. Одна пара половых хромосом. У женщин это две X-хромосомы. Одна из них неактивна и плотно свернута — ее называют тельцем Барра. У мужчин одна половая хромосома представлена X-хромосомой, а вторая — Y-хромосомой, она меньше по размерам.
Методы исследования хромосом Для исследования кариотипа применяют специальный метод — световую микроскопию дифференциально окрашенных метафазных хромосом культивированных лимфоцитов периферической крови. Этот анализ применяется для диагностики различных хромосомных заболеваний. Он позволяет выявлять такие нарушения, как: Грубые изменения в кариотипе — изменение количества хромосом. Присутствие в организме клеток с разными кариотипами. Это явление называется мозаицизмом. Хромосомные аберрации — нарушение структуры хромосом, внутрихромосомные и межхромосомные перестройки. Сюда относятся делеции утрата участка хромосомы , дупликации удвоение участка хромосомы , инверсии поворот участка хромосомы на 180 градусов , транслокации перенос участка одной хромосомы в другую. Однако с помощью исследования кариотипа можно выявить не все генетические нарушения. Оно не способно обнаружить такие изменения, как: микроделеции и микродупликации, когда утрачивается или дублируется очень маленький участок хромосомы; болезни обмена, вызванные нарушением последовательности «букв» генетического кода в отдельных генах; митохондриальные заболевания, связанные с нарушениями в генетическом материале митохондрий; низкопроцентный мозаицизм, когда клеток с неправильным кариотипом очень мало; мутации в отдельных генах, которые не приводят к изменению внешнего вида хромосом; эпигенетические расстройства, при которых структура хромосом и генов не меняется, но изменяется их функция.
Для получения дополнительной информации, не видимой в световой микроскоп, используют хромосомный микроматричный анализ ХМА. С его помощью можно изучить все клинически значимые участки генома и выявить изменения в количестве и структуре хромосом, а именно микрополомки микроделеции и микродупликации. Во время хромосомного микроматричного анализа применяют технологию полногеномной амплификации и гибридизации фрагментов опытной ДНК с олигонуклеотидами, нанесенными на микроматрицу. Если объяснять простыми словами, то сначала ДНК, которую необходимо изучить, копируют, чтобы увеличить ее количество, а затем смешивают ее со специальными ДНК-микрочипами, которые помогают выявлять различные нарушения. Эта методика позволяет в одном исследовании выявлять делеции и дупликации участков ДНК по всему геному. Разрешающая способность стандартного ХМА от 100 000 пар нуклеотидов — «букв» генетического кода в отдельных регионах от 10 000 п.
Иногда ХМА, наоборот, помогает исключить наличие хромосомных нарушений у детей с проблемами в развитии. Подобные результаты считаются благоприятными, поскольку приобретенные дефекты поддаются корректировке, тогда как генетические нарушения исправить невозможно. Технология метода ХМА позволяет одновременно проанализировать большое количество различных фрагментов ДНК, каждому из которых соответствует конкретный генетический маркер, нанесенный на матрицу.
Последняя представляет собой предметный стек, покрытый тысячами таких зондов. Для теста используют 2 вида ДНК: пациента; стандартная соответствует нормальному человеческому геному. Генетический материал наносится на матрицу, где происходит реакция гибридизации между зондами и соответствующими им фрагментами образцов. То есть последовательности из идентичных участков хромосом объединяются друг с другом. Специальный прибор отдельно оценивает степень гибридизации каждого зонда с контролем и с опытным образцом. В нормальном случае она должна быть одинакова. Если же какой-то фрагмент пациента содержит избыток генетического материала, прибор дает зеленый сигнал, а если недостаток — красный.
Эти проекты разрабатывают в рамках деятельности Евразийского научно-образовательного центра с участием IQ парка РБ и Сколково. На прием к специалистам РМГЦ будущих родителей может записать акушер-гинеколог по месту прикрепления либо вы можете обратиться сами.
Слепота Диабет может повредить кровеносные сосуды сетчатки, что может привести к слепоте. Диабет также увеличивает риск других серьезных заболеваний зрения, таких как катаракта и глаукома. Повреждение стоп Повреждение нервов в стопах или плохой приток крови к стопам увеличивают риск различных инфекций. Они могут в конечном итоге потребовать ампутации пальца ноги, стопы или голени.
Хромосомный микроматричний анализ
Метод исследования: Хромосомный микроматричный анализ; Анализ экзонного уровня отличается повышенной плотностью покрытия, что позволяет с высокой точностью выявлять изменения числа копий. В каких случаях рекомендовано исследование: В качестве исследования первой линии пациентам с предполагаемым наследственным заболеванием, обусловленным хромосомным дисбалансом; В качестве метода диагностики недифференцированных синдромов у пациента с аутизмом, умственной отсталостью, задержкой психомоторного развития, судорожным синдромом, малыми аномалиями развития, множественными врожденными пороками развития; В целях валидации вариаций числа копий, выявленных при проведении секвинирования нового поколения; При выявлении единственной гетерозиготной мутации в гене, ассоциированном с аутосмно-рецессивным заболеванием, для поиска делеции или дупликации на втором аллеле.
Определить видовую принадлежность ДНК. Провести анализ экспрессии генов. В определенном порядке к нему прикреплены короткие олигонуклеотиды 8-80 н. Матрицы, используемые для ХМА, содержат до 6,85 млн.
Это инвазивный метод, для исследования подойдет любой материал, содержащий ДНК, — ворсина плаценты или жидкость внутри плодных оболочек. Анализируются отдельные фрагменты генома с использованием специально подготовленной микроматрицы. Одновременно исследуются более тысячи генов, и появляется возможность исключить более 250 тяжелых генетических заболеваний. С помощью этого метода выявляются нарушения, которые стандартным цитогенетическим исследованием кариотипа выявить невозможно.
Для теста используют 2 вида ДНК: пациента; стандартная соответствует нормальному человеческому геному.
Генетический материал наносится на матрицу, где происходит реакция гибридизации между зондами и соответствующими им фрагментами образцов. То есть последовательности из идентичных участков хромосом объединяются друг с другом. Специальный прибор отдельно оценивает степень гибридизации каждого зонда с контролем и с опытным образцом. В нормальном случае она должна быть одинакова. Если же какой-то фрагмент пациента содержит избыток генетического материала, прибор дает зеленый сигнал, а если недостаток — красный. Таким образом оцениваются все участки генома, к которым матрица содержит маркеры. Сигналы прибора улавливаются сканером и обрабатываются компьютером. Типы ХМА Существует 3 разновидности хромосомного микроматричного анализа: таргетный; стандартный; расширенный. Их основное отличие заключается в разрешающей способности, которая регулируется количеством используемых ДНК-маркеров.
ХМА пренатальный
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА): генетический анализ, изучающий количество, структуру и целостность на уровне хромосом. Замечу, что хромосомный микроматричный анализ может быть выполнен и в рамках постнатальной диагностики у детей с задержкой развития и/или врожденными дефектами. В Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА) для диагностики беременных. Кстати, этот Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) даже дешевле НИПТа.
Генетические нарушения у человека и методы их выявления
Хромосомный микроматричный анализ при беременностях с распространенным видом врожденного порока сердца может быть бесполезным. Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек, не видимых в обычный микроскоп. Хромосомный микроматричный анализ при беременностях с распространенным видом врожденного порока сердца может быть бесполезным.
Генетические анализы, проведение которых финансирует фонд для благополучателей
Это наблюдение справедливо для населения, проходящего стандартные скрининговые тесты на трисомию и УЗИ, а также для широко доступного неинвазивного пренатального скрининга. Напротив, анализ ХМА дает высокую частоту выявления беременностей с неизолированным дефектом межжелудочковой перегородки, - пишут авторы статьи. Таким образом, новое исследование ставит под сомнение рекомендацию проводить инвазивное пренатальное тестирование ХМА при беременностях с изолированным ДМЖП.
Особенности метода Метод не определяет сбалансированные хромосомные перестройки. Возможно получение результатов неясной клинической значимости. В связи с этим необходимо иметь максимально полную информацию об обследуемых и иногда бывает необходимо проведение дополнительного исследования родственников.
Замораживанию не подлежит. Ткани 100 - 200 мг в физрастворе.
На Конгрессе молодых ученых обсудили вопросы этической экспертизы в сфере генетических исследований Заседание рабочей группы по нормативному правовому регулированию и биоэтике в сфере генетических технологий прошло под сопредседательством главы Минобрнауки России Валерия Фалькова, члена президиума Российской ассоциации содействия науке Марии Воронцовой и заместителя начальника Управления Президента Российской Федерации по научно-образовательной политике Елены Нечаевой. Валерий Фальков отметил, что сегодня область генетических технологий регулируется набором разной степени долженствования правил и постановлений, которые действуют и в международной, и в национальной правовых системах.
В определенном порядке к нему прикреплены короткие олигонуклеотиды 8-80 н. Матрицы, используемые для ХМА, содержат до 6,85 млн. Благодаря этому получают информацию о наличии генетического материала в аналогичном количестве точек генома. Задавая нужную последовательность ДНК-зондов, можно конструировать чипы для выявления практически любых последовательностей ДНК, определения точечных полиморфизмов SNP , анализа копийности любых участков генома CNV , определения видовой принадлежности ДНК, а также анализа экспрессии генов.