Хромосомный микроматричный анализ — специальный метод исследования, который позволяет выявлять хромосомные аномалии, включая субмикроскопические, которые. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) — это молекулярно-генетическое исследование кариотипа, молекулярный кариотип.
Хромосомный микроматричный анализ
Это лучший метод для идентификации коротких тандемных повторов и секвенирования отдельных генов. Метод может обрабатывать только относительно короткие последовательности ДНК до 300—1000 пар оснований одновременно. Однако самым большим недостатком этого метода является большое количество времени, которое требуется для его проведения. Если неизвестно, какую нужно выявить мутацию, то используют специальные панели. Панель исследования — тестирование на наличие определенных мутаций, входящих в перечень конкретной панели исследования. Анализ позволяет выявить одномоментно разные мутации, которые могут приводить к генетическим заболеваниям. Анализ позволяет компоновать мутации в панели по частоте встречаемости скрининговые панели, направленные на выявление носительства патологической мутации, часто встречаемой в данном регионе или в определенной замкнутой популяции и по поражаемому органу или системе органов панель «Патология соединительной ткани». Но и у этого анализа есть ограничения. Анализ не позволяет выявить хромосомные аберрации, мозаицизм и мутации, не включенные в панель, митохондриальные заболевания, а также эпигенетические нарушения. Не в каждой семье можно отследить все возможные рецессивные заболевания. Тогда на помощь приходит секвенирование экзома — тест для определения генетических повреждений мутаций в ДНК путем исследования в одном тесте практически всех областей генома, кодирующих белки, изменения которых являются причиной наследственных болезней.
Секвенирование следующего поколения-NGS — определение последовательности нуклеотидов в геномной ДНК или в совокупности информационных РНК транскриптоме путем амплификации копирования множества коротких участков генов. Это разнообразие генных фрагментов в итоге покрывает всю совокупность целевых генов или, при необходимости, весь геном. Анализ позволяет выявить точечные мутации, вставки, делеции, инверсии и перестановки в экзоме. Анализ не позволяет выявить большие перестройки; мутации с изменением числа копий CNV ; мутации, вовлеченные в трехаллельное наследование; мутации митохондриального генома; эпигенетические эффекты; большие тринуклеотидные повторы; рецессивные мутации, связанные с Х-хромосомой, у женщин при заболеваниях, связанных с неравномерной Х-деактивацией, фенокопии и однородительские дисомии, и гены, имеющие близкие по структуре псевдогены, могут не распознаваться. Что делать, если в семье есть наследственное заболевание? Существуют два способа выявить наследственные генетические мутации у эмбриона: Предимплантационное генетическое тестирование ПГТ в цикле ЭКО. Это диагностика генетических заболеваний у эмбриона человека перед имплантацией в слизистую оболочку матки, то есть до начала беременности. Обычно для анализа проводится биопсия одного бластомера клетки зародыша у эмбриона на стадии дробления 4—10 бластомеров. Существует несколько видов ПГТ: на хромосомные отклонения, на моногенные заболевания и на структурные хромосомные перестройки. Но при исследовании эмбриона есть ряд ограничений.
Так, из-за ограниченного числа клеток можно не определить мозаицизм. Если нет возможности провести ЭКО с ПГТ, то используют второй вариант — исследование плодного материала во время беременности. Для забора плодного материала используют инвазивные методы: биопсия хориона — когда берут клетки из плаценты; амниоцентез — когда берут клетки амниотической жидкости. Далее эти клетки исследуют при помощи одного или нескольких генетических тестов которые имеют свои ограничения.
Анализ может быть проведен даже в том случае, если беременность замерла давно и живых клеток в материале не осталось. Показания: Невынашивание беременности наблюдалось более, чем один раз; Невынашивание беременности произошло впервые, но у семейной пары есть желание выяснить возможную генетические причину; Во время прошлых беременностей у плода были выявлены множественные пороки развития; В семье есть ребенок с хромосомной патологией.
Нормальный мужской кариотип — 46,XY; нормальный женский — 46,XX. В норме в каждой клетке содержится полный хромосомный набор, исключение составляют половые клетки сперматозоиды и яйцеклетки , которые содержат лишь половину набора, то есть 23 хромосомы. Во время оплодотворения при слиянии мужской и женской половых клеток формируется новый хромосомный набор, который и передаётся будущему ребёнку. Иногда процесс образования половых клеток нарушается, из-за чего изменяется число хромосом или их структура, развиваются хромосомные аномалии. Хромосомные аномалии могут спонтанно возникнуть в процессе развития эмбриона или передаться от родителей — носителей таких дефектов. При этом на здоровье родителей это, как правило, никак не отражается.
Какой биоматериал нужен для исследования? Материал для исследования: амниотическая жидкость, ворсины хориона, пуповинная кровь. Дополнительных правил подготовки к тесту нет. Возьмите с собой направление или заключение от врача. Полезно: сдавать кровь в течение дня, не ранее, чем через 3 часа после приема пищи или утром натощак можно пить чистую воду в обычном режиме Похожие анализы.
Генетические нарушения у человека и методы их выявления
В уфимском Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА). Хромосомный микроматричный анализ не выявляет сбалансированные хромосомные транслокации, инверсии, низкоуровневый мозаицизм, точковые мутации. Хромосомный микроматричный анализ позволяет определять число копий генов SMN1 и SMN2 имеющих гомологи и трудно определяемые другими методами. Слайд 74ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ В ПРЕНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ ПОКАЗАНИЯ Высокий риск ХП по результатам НИПТ. Хромосомный микроматричный анализ — специальный метод исследования, который позволяет выявлять хромосомные аномалии, включая субмикроскопические, которые. Хромосомный микроматричный анализ поможет выяснить причину судорог, задержки физического и умственного развития, аутизма у ребенка.
Хромосомный микроматричный анализ при неразвивающейся (замершей) беременности
Хромосомный микроматричный анализ – технология диагностики причин врожденных пороков развития и умственной отсталости у детей. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) представляет собой сложную молекулярную технологию, позволяющую провести полногеномную амплификацию с последующим анализом. Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек организма, не видимых в обычный микроскоп. Хромосомный микроматричный анализ (молекулярно-генетический анализ aCGH) при неразвивающейся беременности (абортивный материал) Оptima.
Хромосомный микроматричный анализ при выкидыше или замершей беременности
Так, может быть поврежден крохотный участок в каком-то плече хромосомы, и с помощью ХМА мы его «поймаем», а простой цитогенетикой — нет. Повреждение насколько мало, что человеческий глаз его просто не заметит. Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек, не видимых в обычный микроскоп. Существуют врожденные пороки развития, которые требуют серии операций, причем провести их необходимо в первые часы жизни ребенка. С внедрением данного метода у врачей появилась возможность заранее получить полную картину происходящего.
При этом нарушение хромосомного набора может быть представлено изменением количества хромосом например, отсутствие одной из хромосом или, наоборот, появление в кариотипе дополнительной хромосомы или нарушением их структуры например, за счет вставки дупликации или потери делеции определённого участка хромосомы. Для подтверждения или исключения подобной причины выкидыша или неразвивающейся беременности необходимо провести хромосомный анализ абортивного материала. Данное молекулярно-цитогенетическое исследование позволяет с высокой точностью детектировать как анеуплоидии то есть видеть количественное изменение хромосомного набора эмбриона, в частности, подтвердить синдром Дауна трисомия 21 , Эдвардса трисомия 18 , Патау трисомия 13 и др.
Особенности метода Метод не определяет сбалансированные хромосомные перестройки. Возможно получение результатов неясной клинической значимости. В связи с этим необходимо иметь максимально полную информацию об обследуемых и иногда бывает необходимо проведение дополнительного исследования родственников.
Замораживанию не подлежит. Ткани 100 - 200 мг в физрастворе.
По данным на сентябрь 2018 года в лабораторию обратились семьи с 98 детьми, среди которых было 17 девочек и 81 мальчик. Программа предусматривает анализ несколькими методами, и одна из целей исследования состоит как раз в том, чтобы оценить эффективность различных лабораторных методов для выявления генетических причин аутизма. В частности, кариотипирование, когда анализируют структурные и количественные хромосомные аномалии, не выявило ни одной причины РАС.
С одной стороны, это может говорить о том, что метод в данном случае мало информативен, с другой стороны, возможно, что всё дело в особенностях выборки. На обследование не попадали дети с наиболее тяжёлыми синдромальными формами аутизма — например, когда он сопутствует синдрому Дауна, что вообще-то не редкость. Напомним, что синдром Дауна — как раз разультат масштабной хромосомной аномалии, когда у 21 хромосомы оказывается лишняя третья копия.
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА)
Хромосомный микроматричный анализ не выявляет сбалансированные хромосомные транслокации, инверсии, низкоуровневый мозаицизм, точковые мутации. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА), также известный как arrayCGH, представляет собой диагностический тест, который может обнаруживать клинически значимые крупные. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) – технология молекулярно-генетического исследования.