ПЦР или полимеразная цепная реакция — на сегодняшний день самый точный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет узнать, присутствует ли в вашем организме вирус COVID-19.
Расшифровать анализ ПЦР онлайн
| О рекомендациях, как подготовиться к сдаче ПЦР-теста на COVID-19 | Анализ ПЦР на HCV, виды: отрицательный, положительный и расшифровка. |
| Чувствительность определения 60 МЕ/мл — что это значит? | Расшифровка результатов ПЦР требует учета данных прочих исследований, хотя формально находки, полученные в процессе полимеразной цепной реакции исчерпывающе и однозначно описаны в бланке исследования, клиническом заключении лаборантов. |
| Расшифровка анализа пцр | ПЦР анализ на инфекции Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – высокоточный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет выявить у человека различные инфекционные и наследственные заболевания, как в острой и хронической стадии. |
ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео)
ПЦР-тест — основной метод обнаружения коронавирусной инфекции. Полимеразная цепная реакция — что это такое, какие еще заболевания выявляет, в чем преимущества и РИА Новости, 22.01.2024. Иностранные граждане обязаны предъявить отрицательный результат ПЦР-тестирования, проведённого не ранее чем за два дня до прибытия на территорию Российской Федерации. Как расшифровать ПЦР Как работает ПЦР тест Ответы на эти и другие вопросы читайте в статье на нашем сайте.
Тест на антитела к COVID-19
- ПЦР-15: описание, интерпретация результата, референсные значение
- Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен
- 7 вопросов про ПЦР-тест
- Что показывает анализ ПЦР
- Специфическая
HCV, РНК количественно [реал-тайм ПЦР]
Мы будем очень благодарны, если Вы порекомендуете нас своим друзьям в социальных сетях. Медпортал 03online. Здесь Вы получаете ответы от реальных практикующих специалистов в своей области.
Но для полного исключения заражения рекомендуют повторить исследование через 7—10 дней. Если же РНК вируса обнаружена, проводят дальнейшие тесты количественный и генотипирование. Показания к проведению лабораторного теста Основным показанием к сдаче крови на гепатит С методом полимеразной цепной реакции является положительный результат иммуноферментного анализа вне зависимости от разновидности: Total, дифференцированный тест на IgG и IgM. Кроме того, провериться нужно: в период беременности тест делают дважды — в первом триместре и за 7—10 недель до родов ; при работе, связанной с повышенным риском инфицирования медсестры, лаборанты, работники донорских центров, косметологи и т.
Рост заболеваемости растет с каждым годом. Поэтому для раннего выявления инфекции лабораторные тесты на HCV рекомендуют сдавать один раз в год. Где сдать анализ При обращении в поликлинику, пациент имеет право на бесплатные анализы. Но сначала сдают тест ИФА. И только при положительном либо сомнительном результате показано исследование методом ПЦР. Поэтому провести срочную диагностику можно обратившись в платную лабораторию, где сдать кровь на ПЦР можно в удобное для пациента время.
Одновременно рекомендуют сразу проверить показатели печеночных ферментов, стандартные клинические параметры крови. Как правило, изучение крови методом ПЦР доступно практически в любой лаборатории. Если пункт забора крови не оснащен должным оборудованием, биологический материал транспортируют для проведения исследования с соблюдением температурного режима и других условий. Проведение ПЦР в поликлинике возможно только после других обследований, результаты которых косвенно укажут на наличие гепатита С. Как правильно сдавать кровь Перед тем, как сдавать кровь на обнаружения возможного вируса, следует соблюсти ряд правил подготовки к анализу. Основные аспекты указаны в памятке: За 5—7 дней отказаться от потребления жирной, жареной пищи, алкоголя.
За 12—14 часов до проведения исследования не есть. Пить можно только воду. Сдать кровь лучше в первой половине дня. До процедуры не курить. Также следует предупредить доктора о принимаемых лекарственных препаратах, возможных проблемах со здоровьем, хронических заболеваниях. Забор крови выполняется из вены.
После окончания процедуры место прокола медсестра заклеивает стерильным пластырем, предупреждает о необходимости согнуть руку и держать ее в таком положении 10—15 минут. В противном случае высока вероятность появления болезненной гематомы. Сколько по времени делается исследование? Сколько делается анализ, зависит от лаборатории. Средний срок выполнения колеблется в пределах 1—3 дней. Некоторые клиники предоставляют платную услугу быстрой постановки ПЦР, однако время проведения ограничивается возможностями медицинской аппаратуры.
В поликлинике результаты могут передаваться врачу в течение 7—10 дней. Это связывают с большим наплывом пациентов. При этом биологический материал хранится в соответствии со всеми требованиями. Расшифровка результатов Как правило, расшифровка качественной ПЦР не представляет сложности.
Отдельные штаммы при этом не выделяются. Что это значит?
При таком анализе будет только положительный или отрицательный результат. В бланке указывается, какие штаммы исследуются. Например, популярен анализ на выявление 14 штаммов ВПЧ с номерами 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 68, а также скрининг только на два самых опасных — 16 и 18. Результат «обнаружено» в этом анализе расшифровывается как инфицирование одним из вирусов данной группы или несколькими из них, но какими именно, исследование не покажет. Таким образом, скрининг только фиксирует заражение или его отсутствие на данный момент. Он не может показать количество вируса в организме и не может быть основанием для назначения лечения.
Присутствие ДНК ВПЧ не означает, что человек болен — это лишь повод для более тщательного наблюдения в дальнейшем и повторной сдачи анализов через год — два. Возможно, через этот срок вирус покинет организм. Кроме единой строчки с перечислением номеров ВПЧ, в таблице на бланке такого анализа будет лишь еще одна строка — КВМ. Эта аббревиатура расшифровывается как «контроль взятия материала». Данный показатель нужен для того, чтобы видеть, правильно ли проведена процедура забора биоматериала, достаточно ли в нем клеток эпителия, чтобы выполнить корректную амплификацию. Если этот показатель меньше, значит, материал был взят неправильно.
В полученном образце слишком мало клеток, и среди них может не оказаться пораженных вирусом. Тогда будет получен ложноотрицательный результат. Дифференцированный анализ ПЦР В данном анализе используется генотипирование — определение специфической последовательности ДНК каждого из исследуемых штаммов в отдельности. Так можно определить, какой конкретно штамм присутствует в организме. Также выполняется оценка КВМ. Читайте также: Это тоже скрининговый метод, только расширенный, более подробный.
Он фиксирует лишь факт заражения, но не определяет, стал ли конкретный вид ВПЧ провокатором заболевания. Однако вместе с цитологическим мазком, такой ПЦР-анализ повышает эффективность выявления ассоциированных с ВПЧ заболеваний половых органов. Количественный анализ ПЦР Количественный анализ диагностически более значим, чем качественный, ведь он определяет вирусную нагрузку на организм. Обычно назначается при положительных результатах качественного теста. Концентрация вируса в тканях отражает тяжесть течения инфекции, позволяет врачу составить прогноз ее течения с учетом клинических симптомов или отследить результативность проведенного лечения. В количественном анализе подсчитывается число копий вируса, приходящихся на число клеток эпителия.
Это значит, что вирус для организма неопасен и, скорее всего, иммунная система успешно подавит его. Такой результат у женщины дает основания для беспокойства. Скорее всего, врач назначит кольпоскопию с биопсией, чтобы выяснить, в каком состоянии находится эпителий шейки матки. При лечении заболеваний, ассоциированных с ВПЧ, имеет значение отслеживание вирусной нагрузки в динамике. Если же вирусная нагрузка в контрольных анализах через 3, 6 9, 12 месяцев после лечения на порядок увеличилась — это признак рецидива инфекции. Крем и таблетки: цена, отзывы, аналоги Результаты количественного или качественного анализа обычно готовы уже на следующий день после сдачи.
Он позволяет выявить конкретные штаммы, присутствующие в клинически значимой концентрации. Этот анализ и самый дорогой. Его цена примерно в два раза выше, чем у качественного анализа на такое же количество штаммов в среднем 2200 против 1200 не считая стоимости забора материала.
Это значительно увеличивает вероятность назначения своевременного лечения. Кроме того, с помощью ПЦР можно определить латентных носителей инфекции. Необходимо строго соблюдать правила сбора биоматериала и его хранения. Важно выбрать правильное время взятия биоматериала и выполнить правила подготовки к тесту.
В частности, это касается и нового коронавируса, который присутствует в выделениях носоглотки и ротоглотки только в течение определенного времени, по истечении которого анализ окажется отрицательным. Кроме того, высокая чувствительность ПЦР может иногда превращаться из преимущества в недостаток. Показания к проведению ПЦР-анализа ПЦР-тесты используются для: диагностики инфекционных заболеваний, вызванных вирусами, бактериями и грибами, в том числе для определения возбудителей ряда урогенитальных инфекций; определения патологических генетических нарушений; определения роста и развития раковых клеток. ПЦР тест также можно использовать для прямой диагностики наличия заболевания и мутаций в развивающемся эмбрионе. Например, впервые ПЦР была использована таким образом для диагностики серповидно-клеточной анемии путем обнаружения мутации одного гена. Как проводится ПЦР-анализ Метод полимеразно-цепной реакции постоянно развивается. Самым распространенным на сегодня является тест в реальном времени, с помощью которого можно определить исходное количество копий ДНК РНК.
ПЦР с вложенной парой праймеров гнездовая проводится в две стадии для снижения вероятности амплификации неспецифичных участков ДНК.
В Минздраве объяснили, от чего зависит результат ПЦР-теста
Когда проводится анализ? ПЦР получила широкое распространение в различных областях практической медицины. Исследование является одним из основных методов диагностики различных инфекционных заболеваний с половым путем передачи. К ним относятся патологические процессы, вызванные: вирусами герпетическая, папилломавирусная инфекция , ВИЧ СПИД, вирусные гепатиты с парентеральным путем передачи специфическими бактериями сифилис, гонорея, микоплазмоз, уреаплазмоз, хламидиоз простейшими трихомониаз Полимеразная цепная реакция также может использоваться для диагностики инфекций, вызванных условно-патогенными грибами кандидоз. Какой материал исследуется?
Доктора акцентируют особое внимание на том, что отрицательный результат не всегда означает отсутствие патологии. Кто из докторов выполняет расшифровку результатов ПЦР Часто среди пациентов звучит вопрос о том, какой врач будет проводить расшифровку ПЦР исследования. В первую очередь необходимо запомнить, что доверять результаты стоит тому же медицинскому работнику, что первоначально давал направление на исследование. Связана эта рекомендация с тем, что в этом случае доктор будет представлять себе, что он ожидает увидеть в анализах. Сможет грамотно интерпретировать итоги, соотнося их с клинической картиной. Получить направление наиболее часто можно от уролога, гинеколога или венеролога. Соответственно, после получения итогов относить бланк с результатами стоит кому-то из них. Важно помнить, что ПЦР — довольно дорогой метод диагностики. Его не принято использовать просто так, без специальных показаний к обследованию. Среди них: появление специфических для ЗППП симптомов обследование перед планированием беременности или процедурой искусственного оплодотворения поиск причин бесплодия и другие показания Когда показатели ПЦР становятся положительными после заражения Часто пациенты задают на приеме у медицинского работника вопрос о том, когда результаты ПЦР крови и мазков становятся положительными после заражения. Все зависит от того, насколько быстро конкретная инфекция сможет, размножаясь, пройти пороговую для теста концентрацию в материале. Преимуществом ПЦР является то, что порог чувствительности у теста довольно низкий. Это значит, что выявить признаки заражения можно даже в том случае, если количество возбудителя в биологическом материале будет минимальным. Подобная особенность дает возможность постановки диагноза даже в период инкубации, когда симптомы еще полностью отсутствуют. Однако осечка возможна и при применении ПЦР методики. Это происходит, например, если пороговая концентрация все же не успела достичь определяемых тестом значений. В этом случае велика вероятность получения далеких от правды результатов. Как отмечают доктора, ничего сложного во внешнем виде бумаги нет. Зачастую на документе можно обнаружить название искомого возбудителя. А напротив него пометку «обнаружен» или «не обнаружен». В первом случае пациенту рекомендуется озаботиться собственным здоровьем. Так как анализ расценивается как положительный, а человек, как зараженный. Следовательно, ему требуется терапия. Во втором случае чаще всего состояние пациента оценивают, как здоровое, хотя могут быть и исключения. Важно помнить, что количество возбудителей, указанных на бланке, зависит во многом от того, какое конкретно вид анализа применялся. Если проводился поиск только одного патогенного микроорганизма, в результате будет фигурировать только его название с соответствующей пометкой.
По-другому дело обстоит в случае с ПЦР количественной. Её результатом является число, демонстрирующее вирусную нагрузку. Чтобы понять, о какой цифре идёт речь, достаточно произвести умножение. Сколько стоит сдать ПЦР? Цены сильно разнятся в зависимости от региона и типа клиники. Дешевле обследоваться в государственном медучреждении, комфортнее и быстрее — в частном диагностическом центре, все логично. Стоимость качественного ПЦР-анализа на наличие основных ЗППП хламидиоза, гонореи, микоплазмоза, уреаплазмоза, трихомониаза , герпеса, гепатита и папилломовируса разных типов, ВИЧ, цитомегаловируса, хеликобактерии и т. Количественный анализ почти всегда стоит дороже, чем качественный, а в случае с ВИЧ и гепатитом — значительно дороже. Например, больные гепатитом москвичи могут узнать свою вирусную нагрузку за 3500-6000 рублей, ВИЧ-инфицированные — за 11000-13000 рублей. Чтобы сэкономить на ПЦР-диагностике, заказывайте комплексные пакеты анализов, например, сразу на все самые распространённые ЗППП, системные или респираторные инфекции — так получится значительно дешевле, да и уверенности в своём здоровье будет больше. Средняя цена пакета или «скрининга» - 1500-2500 рублей. Пользуйтесь услугами муниципальных лабораторий или частных медицинских центров с проверенной репутацией — мы не будем их здесь называть во избежание рекламы, но вы легко их найдете, как только вобьете в поисковую строку запрос вида «сдать ПЦР анализ». В заключение хотелось бы напомнить о ценности своевременной диагностики инфекций: если вы подозреваете, что заразились чем-то, или, тем более, уже плохо себя чувствуете, не надейтесь на «авось» и не прибегайте к самолечению — лучше как можно скорее отправляйтесь к врачу. Берегите себя, и будьте здоровы! Информация носит ознакомительный характер и не может использоваться для самодиагностики и назначения лечения. Всегда консультируйтесь с профильным врачом! Другие статьи по данной теме:.
При анализе выделяют фрагмент ДНК, присущий конкретному возбудителю. Уникальность участка позволяет в одном и том же материале находить одновременно нескольких возбудителей без ущерба качеству. Для исследования достаточно несколько молекул ДНК активного или даже уже разрушенного патогена, но который оставил специфические участки. Метод выявляет одну болезнетворную бактерию среди миллиардов других, при этом он эффективен там, где бессильны другие виды исследований — микроскопический, бактериологический, иммуноферментный. Не требуется искусственно выращивать возбудитель. На постановку реакции нужно всего лишь несколько часов, то есть результат можно получить в течение дня. Диагностику заболевания в инкубационном периоде. Анализ определяет возбудителя, а не реакцию организма на него. Выходит, что можно поставить точный диагноз, когда болезнь еще никак себя не проявила. Для анализа подходит большинство разновидностей биоматериала — слизь, моча, кровь, сыворотка, мокрота, эякулят, соскоб эпителиальных клеток, гной, жидкости из абсцессов. Особенности применения ПЦР-теста Метод используют везде, где нужен быстрый, точный и надежный результат. Возбудители многих инфекций имеют несколько штаммов, поэтому точная диагностика гарантирует и эффективность лечения.
Анализы на коронавирус. Какие сдавать и что означают результаты?
| Цепная реакция. Как работают тесты на коронавирус? | Молекулярное тестирование, включая тестирование с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР), выявляет генетический материал вируса и, таким образом, может определить, инфицирован ли человек SARS-CoV-2 в настоящее время. |
| Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК | ПЦР-тест даст более точный результат, если врач возьмет у пациента мазок с первого по пятый день заболевания. |
| Результаты ПЦР диагностики - интерпретация. | Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — это лабораторно–диагностическое исследование, позволяющее определить возбудителя той или иной инфекции. |
| Сколько стоит сдать ПЦР-анализ | HCV, РНК [реал-тайм ПЦР]: описание, синонимы, методы исследования, какой биоматериал можно использовать, как правильно подготовиться, для чего используется, когда назначается, что означают результаты. |
Цепная реакция. Как работают тесты на коронавирус?
В больницу пациентов с COVID-19 госпитализируют, как правило, после того, как им сделали ПЦР-тест. Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR) — это точный метод лабораторной диагностики, который используют для выявления возбудителей инфекционных заболеваний. Метод ПЦР позволяет идентифицировать в биологическом материале искомый участок генетического материала и обнаружить единичные молекулы ДНК микроорганизмов, не выявляемые другими методами.
Контроль взятия материала (КВМ) - что это такое?
Можно ли употреблять алкоголь перед сдачей теста ПЦР и как это повлияет на результат? Расшифровка ПЦР на ВПЧ Помогите расшифровать результаты ПЦР ВПЧ 16, 31, 33, 35, 52. по Менеджменту антикоагулянтной терапии, утвержденное Министерством Здравоохранения РМ, рекомендует для оценки рисков венозных тромбоэмболий использовать тесты на Д-Димеры со специфичностью не менее 75.
Суть анализа ПЦР на гепатит В и его результаты
Такое возможно, если заболевание было перенесено в острой форме и иммунитет смог без помощи лекарств самостоятельно избавиться от вируса. Также положительный анализ на anti-HCV антитела обычно длительно сохраняется у людей, излечившихся от гепатита после получения курса противовирусных препаратов. Выявление в крови РНК вируса гепатита С будет говорить о наличии активно протекающего заболевания, которое требует начала специфической терапии. Кровь на РНК можно исследовать качественным методом и количественным. В соответствии с названием, качественный метод отвечает только лишь на вопрос, присутствует ли вирус в организме; при исследовании же количественным методом мы получаем информацию, сколько именно единиц вируса содержится в 1 мл крови, то есть можем судить о том, насколько активно размножается вирус.
Вирус гепатита С имеет 6 генотипов и большое число подтипов. В нашей стране наиболее распространены первые генотипы 1, 2 и 3. Основная информация, которую дает врачу результат данного анализа, - к каким препаратам вирус чувствителен, то есть определяет выбор правильной схемы лечения. Конечно, в наше время существуют уже и так называемые «пангенотипические» схемы, которые эффективны против всех генотипов вируса.
Прочитали до сюда? Вот теперь можем переходить непосредственно к ПЦР. Ученые уже десятилетия изучают свойства ДНК. Выделяют из живых организмов, синтезируют искусственно...
Потому что когда его мало, то труднее ставить эксперименты - проще запороть, загрязнить чем-то чужеродным и т. И тогда в далеком 1983м один любящий галлюциногены ученый Кэри Муллис решил использовать для этого то, что давно уже придумала природа - репликацию, только искусственную, в пробирке. Нобелевку по химии за это получил, кстати... За основу взяли все основное, что есть в "натуральной" репликации - собственно ДНК, полимеразу, свободные буквы-нуклеотиды, чтобы ей было что вставлять в новую цепь, и праймеры - затравку, которая покажет полимеразе, откуда ей начать свое грязное дело.
Путем долгих манипуляций и экспериментов выяснилось, что оптимальнее всего смешать все это и поставить на определенный температурный режим, где каждый этап реакции будет происходить на своей заданной температуре. Этапа всего три: 1 Денатурация. При 95 градусах двойная спираль ДНК распадается на две нити разрушаются те самые слабые водородные связи между комплементарными нуклеотидами. При 40-60 градусах в зависимости от ряда факторов маленькие затравки находят комплементарный участок на одиночной цепи и садятся на него.
При 72 градусах полимераза садится на затравку и начинает достраивать новую цепь, пользуясь старой как шаблоном. Откуда именно 72 градуса - очень интересная история о пользе фундаментальной науки, как-нибудь в другой раз. В результате такого цикла из одной двойной спирали получаются две! Как несложно догадаться, теперь надо все это повторить еще раз, чтобы из 2 сделать 4, потом 8...
Ну, вы поняли - это цепная реакция! Тем не менее, этого хватает, чтобы получить рабочие концентрации ДНК, с которыми можно уже делать серьезное дело. Аппаратная база. Бедняга Муллис и его последователи сначала использовали тупо три водяных бани с разной температурой, вручную перемещая из одной в другую ценные пробирки с реакцией.
Как это работает? Затем добавляют так называемые праймеры — начальные звенья цепочки, которые необходимы для старта синтеза новой копии, и так называемую полимеразу — тот самый фермент, который и будет заниматься репликацией ДНК. РНК-праймер изображен белым прямоугольником в начале каждой из двух цепей Как правило, для лабораторной ПЦР используются ДНК-полимеразы из термофильных бактерий, поскольку в течение реакции смесь многократно охлаждают и нагревают. На последующей стадии элонгации полимераза начинает синтез на каждой из двух цепочек разделенной ДНК недостающей пары. Происходит это по принципу комплементарности: фермент присоединяет напротив каждого нуклеотида, из которых состоят ДНК, противоположный. По завершении реакции цикл неоднократно повторяется см. Общая схема полимераной цепной реакции. Цифрами обозначены ее этапы.
В случае с вирусами, содержащими не «двойную» ДНК молекулу, а «одинарную» РНК а это коронавирусы, или, например, ВИЧ , ученым приходится сначала провести обратную транскрипцию РНК с помощью фермента обратной транскриптазы, а уже потом производить амплификацию по той схеме, что была указана выше. Именно так, собственно, поступает и сам вирус, попадая в клетку, перед тем как встроить свою ДНК в человеческую и приступить к синтезу собственных белков, из которых состоит его «тело» то есть не генетического материала, а самих вирусных частиц, при ПЦР же, наоборот, копируется генетический материал, а не новые частицы вируса. Ингибиторы обратной транскриптазы — одни из самых распространенных видов лекарств от ВИЧ-инфекции. К ним относятся, например, зидовудин и ламивудин — самые первые препараты АРВТ, разработанные еще в 80-х. Производится ПЦР на специальных приборах, амплификаторах, или так называемых термоциклерах Thermal cycler. Наглядно, как работает метод ПЦР, можно посмотреть на приведенном ниже видео. У теста на антитела свои преимущества. Но я бы сказала так: они с ПЦР-тестом дополняют друг друга.
Тест на антитела лучше работает на поздних стадиях.
Чтобы полимераза могла сесть на одиночную цепь ДНК и начать свое дело, ей нужна затравка - это уже готовый маленький кусочек второй цепи, сидящий на первой. Его еще называют праймер.
В клетках его делает специальный фермент праймаза, да и вообще там на самом деле жесть все как сложно, но об этом в другой раз. Адская схема репликации. Все, что надо понять - была одна двойная спираль, а стали две, и помогли им в этом, помимо все прочего, праймеры и полимераза.
Так или иначе, в итоге вся ДНК в клетке удваивается, и вот теперь клетка может спокойно делиться. Прочитали до сюда? Вот теперь можем переходить непосредственно к ПЦР.
Ученые уже десятилетия изучают свойства ДНК. Выделяют из живых организмов, синтезируют искусственно... Потому что когда его мало, то труднее ставить эксперименты - проще запороть, загрязнить чем-то чужеродным и т.
И тогда в далеком 1983м один любящий галлюциногены ученый Кэри Муллис решил использовать для этого то, что давно уже придумала природа - репликацию, только искусственную, в пробирке. Нобелевку по химии за это получил, кстати... За основу взяли все основное, что есть в "натуральной" репликации - собственно ДНК, полимеразу, свободные буквы-нуклеотиды, чтобы ей было что вставлять в новую цепь, и праймеры - затравку, которая покажет полимеразе, откуда ей начать свое грязное дело.
Путем долгих манипуляций и экспериментов выяснилось, что оптимальнее всего смешать все это и поставить на определенный температурный режим, где каждый этап реакции будет происходить на своей заданной температуре. Этапа всего три: 1 Денатурация. При 95 градусах двойная спираль ДНК распадается на две нити разрушаются те самые слабые водородные связи между комплементарными нуклеотидами.
При 40-60 градусах в зависимости от ряда факторов маленькие затравки находят комплементарный участок на одиночной цепи и садятся на него. При 72 градусах полимераза садится на затравку и начинает достраивать новую цепь, пользуясь старой как шаблоном. Откуда именно 72 градуса - очень интересная история о пользе фундаментальной науки, как-нибудь в другой раз.
Маркеры гепатита С и расшифровка результатов количественного анализа HCV RNA
Гепатит Воспаление печени. Полимеразная цепная реакция назначается не только для определения самого факта расстройства. Суть в другом. ПЦР диагностика инфекций дает возможность дифференцировать септические и токсические, прочие формы гепатита, определить конкретный штамм вируса, который спровоцировал патологический процесс. Кандидоз Молочница. Вызывается грибком с идентичным названием. Поражает слизистые оболочки. В том числе полость рта, половые органы женщины реже — мужчины. Вызывает массу осложнений и дискомфортных ощущений. ПЦР тест назначается в качестве верифицируемого, подтверждающего догадки метода, исследуется параллельно с данными анамнеза, визуальной оценки, симптоматики. Хламидиоз, уреаплазмоз, микоплазмоз и прочие венерические инфекции.
На ранних стадиях патологического процесса есть риск не заметить симптомы. Но именно этот момент — лучший для терапии. Поскольку дальше начинаются необратимые изменения в органах и системах. Болезнь не удается взять под контроль, обеспечить продолжительную жизнь пациенту также невозможно. ПЦР назначается для раннего выявления патологического процесса. Генетические аномалии Любого типа. Потому методика представляет такую ценность для диагностики наследственных аномалий. Способ не до конца освоен, потому считается перспективным. Как уже было сказано, с помощью методики можно установить отцовство. Используется отдельная модификация анализа.
Подготовка к исследованию Меры зависят от того, какой биоматериал будут брать. Вот некоторые варианты: Моча Изучение урины требуется, когда проводят диагностику мочеполовых инфекций, поражений венерического плана у мужчин и женщин. У первых методика применяется не всегда. Часто ее заменяют забором соскоба из уретры. Перед проведением обследования, накануне запрещена гигиена репродуктивных органов. Анализ сдают в течение суток с момента подозрительного полового акта. Но это не строгое требование, а скорее рекомендация по раннему выявлению патологического процесса. Кровь Также ее отдельные компоненты: сыворотка и пр. Забирают для определения гепатитов разных форм, дифференциальной диагностики патологий печени, выявления герпеса, СПИДа, также при обследовании на предмет генетических аномалий. Особых правил подготовки в этом случае нет.
Кровь сдают натощак, это единственное требование к пациенту. Мокрота Отделяемое слизистой оболочки дыхательных путей. Исследуется для диагностики респираторных патологий, пневмонии, бронхита, определения источника процесса. Также в рамках выявления других поражений: будь то легочные формы микоплазмоза или прочие.
В частности, это касается и нового коронавируса, который присутствует в выделениях носоглотки и ротоглотки только в течение определенного времени, по истечении которого анализ окажется отрицательным. Кроме того, высокая чувствительность ПЦР может иногда превращаться из преимущества в недостаток. Показания к проведению ПЦР-анализа ПЦР-тесты используются для: диагностики инфекционных заболеваний, вызванных вирусами, бактериями и грибами, в том числе для определения возбудителей ряда урогенитальных инфекций; определения патологических генетических нарушений; определения роста и развития раковых клеток. ПЦР тест также можно использовать для прямой диагностики наличия заболевания и мутаций в развивающемся эмбрионе. Например, впервые ПЦР была использована таким образом для диагностики серповидно-клеточной анемии путем обнаружения мутации одного гена. Как проводится ПЦР-анализ Метод полимеразно-цепной реакции постоянно развивается.
Самым распространенным на сегодня является тест в реальном времени, с помощью которого можно определить исходное количество копий ДНК РНК. ПЦР с вложенной парой праймеров гнездовая проводится в две стадии для снижения вероятности амплификации неспецифичных участков ДНК. Инвертированная ПЦР используется в случае, когда нужно выяснить природу неизвестных участков ДНК, окружающих известный. Это только часть методов ПЦР, количество которых постоянно пополняется новыми технологичными вариантами. Для проведения анализа биоматериала с помощью ПЦР необходимо обеспечить его правильное взятие. При взятии мазка из носоглотки или ротоглотки образец биоматериала собирают путем введения длинного зонда-тампона в ноздрю или в заднюю часть горла.
Они заболевают еще быстрее, а порой просто увольняются. В результате две недели назад коммерческие лаборатории просто остановились, поскольку все стало совсем плохо", - считает Раманкулов. Директор Национального центра биотехнологии отмечает, что "летняя" пневмония в 98 процентах случаев - вирусная. Если у вас все симптомы коронавируса, а результаты теста оказались отрицательными, то это ничего не означает.
Значит, плохо выделили РНК. Нужно сдавать еще раз", - говорит он. И добавляет: "Я бы посоветовал людям, которые чувствуют у себя легкую форму коронавируса, не сдавать тест. Ведь человек без хронических заболеваний перенесет все легко. Даже если вы с помощью ПЦР узнаете, что это коронавирус, что это изменит? В больницу все равно вас не примут, а если и примут, то положат в лучшем случае в коридоре. И за вами будут ухаживать загнанные медсестры, которые на вас даже внимание обращать не будут". Поэтому, говорит он, сдавать тест стоит только при симптомах. Не бойтесь ехать в лабораторию сдавать тест. Для вас уже никто не представляет опасности, так как вы уже заболели коронавирусом", - добавляет специалист.
Что такое экспресс-тест? Осталось лишь разграничить понятия "ПЦР" и "экспресс-тест". Если первый показывает, есть в организме вирус или нет прямо сейчас, то второй указывает на наличие антител.
И 16 декабря 1983 года Мюллис впервые увидел вожделенные, хоть и слабые, полосы в геле для детекции. Однако другие сотрудники и руководство Cetus не разделили радости Мюллиса: их всё это попросту не интересовало [10]. К удивлению автора, и на этот раз его работу обошли вниманием [10]. Чуть позже Мюллису удалось кое-как убедить корпоративных боссов в важности его экспериментов: Cetus, как и многие начинающие компании, вкладывала ресурсы только в те проекты, что сулили прибыль в краткосрочной перспективе. Его освободили от обязанностей главы лаборатории и дали год на исследования ПЦР. И эти эксперименты завершились успешно [10]. Мюллис и его группа разработчиков подали заявку на патент, который утвердили 28 июля 1987 года.
В том же 1985-м в Cetus начали использовать для ПЦР термостабильную Taq-полимеразу, что значительно упростило работу: раньше перед каждым новым синтетическим циклом в смесь надо было добавлять новую порцию фермента, потому что он быстро выходил из строя от высоких температур. Cycle рис. Рисунок 4. Cycle — первый прототип ПЦР-амплификатора. Остальные члены его группы получили по символическому доллару. Это обострило и так напряженные отношения в коллективе. Осенью Мюллис покинул компанию [13]. После ухода из Cetus он два года возглавлял молекулярно-биологический отдел в Xytronyx, а в 1992-м открыл компанию по продаже ювелирных изделий с амплифицированной ДНК знаменитостей — Элвиса Пресли, Мэрилин Монро и т. Его награждение — до сих пор больной вопрос для норвежского научного сообщества, где первооткрывателем метода считают Хьелля Клеппе. Сейчас Мюллису 72 года, он работает научным сотрудником Научно-исследовательского института детской больницы Окленда и с 2011 года возглавляет предприятие Altermune LLC, занимающееся изучением иммунитета [14].
Кэри Мюллис нередко выступает на конференциях, рассказывает о своей жизни, работе и, конечно, своем открытии см. Он — прекрасный рассказчик, его всегда интересно слушать. Видео 1. Однажды он рассказал о ночной встрече со светящимся зеленым енотом в лесу рядом со своим загородным домом. В 1998 году вышла книга Кэри Мюллиса «Танец обнаженного разума» Dancing naked in the mind field , где в обрамлении автобиографических историй ученый высказывает своё мнение о глобальном потеплении, СПИДе и других волнующих общество вопросах. Мюллис верит в астрологию и считает, что значительного изменения климата не происходит, между ВИЧ и СПИДом нет никакой связи, а все исследования, говорящие об обратном, — плоды заговора ученых-карьеристов с правительствами их стран. Компания Cetus подала патентную заявку на метод ПЦР с Taq-полимеразой, и ее одобрили в октябре 1990 года. Журнал Science объявил Taq-полимеразу молекулой года, а статья сотрудников Cetus о ПЦР с ее использованием [15] несколько лет поддерживала статус самой цитируемой биологической публикации [16]. В августе химический гигант DuPont подал против Cetus иск, в котором утверждал, что патенты на ПЦР получены неправомерно, поскольку этот процесс еще в 1970-х описал Хьелль Клеппе. Но через год объявило, что они останутся действительными: комиссия нашла метод, описанный в работе Клеппе, слишком «неопределенным и сомнительным».
К тому же там не упоминалась возможность экспоненциальной репликации — отличительной черты ПЦР. В суде представители DuPont так и не смогли доказать вторичность изобретения Мюллиса. С этой сделки Cetus выплатила Кэри Мюллису неоправданно малую сумму, фактически ограбив его. Принцип метода Все мы знаем, что ДНК — это двухцепочечная молекула, где каждая цепочка состоит из звеньев-нуклеотидов. Нуклеотиды составлены из трех молекул: остатка фосфорной кислоты, сахара и азотистого основания. Если сахар и фосфат одинаковы у всех нуклеотидов в ДНК в РНК сахар другой , то азотистых оснований четыре если не считать редкие модификации : аденин, тимин, цитозин и гуанин, обозначаемые А, Т, Ц и Г соответственно. В молекулах РНК тимин заменен урацилом.
18 ответов
- Контроль взятия материала (КВМ) - что это такое?
- Чем отличается ПЦР от антител на КОВИД тест
- Почему "ошибаются" ПЦР-тесты - эксперт
- Содержание
- 12 методов в картинках: полимеразная цепная реакция
ПЦР-диагностика: что это такое?
- Что такое анализ ПЦР?
- Маркеры гепатита С и расшифровка результатов количественного анализа HCV RNA
- Чем отличается ПЦР от антител на КОВИД тест?
- Тест на Антитела к COVID-19
- Чувствительность определения 60 МЕ/мл — что это значит? - Gepatit ABC
Что такое ПЦР тест на коронавирус и как правильно сдавать мазок
Этот анализ и самый дорогой. Его цена примерно в два раза выше, чем у качественного анализа на такое же количество штаммов в среднем 2200 против 1200 не считая стоимости забора материала. Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью. Поэтому многие развитые страны включают в скрининговое исследование именно его. Тест может быть комплексным — для группы низкого и повышенного риска, или проводиться отдельно для каждой группы. Оценивается только присутствие вирусов в клинически значимой концентрации, то есть одновременно оценивается и вирусная нагрузка. В группе высокоонкогенных вирусов проверяется наличие 13 типов: 16, 18, 31, 33, 39, 35, 45, 51, 52, 56, 59, 58, 68 штаммов.
В группе вирусов с низким риском — 6, 11, 42, 44, 43. Полученные результаты не дифференцируются по штаммам. Ошибки при нахождении штамма практически исключены. Концентрация обозначается в других единицах, нежели в анализе ПЦР — не в геном-эквивалентах, а в относительных единицах они отражают отношение количества копий вируса к значению, которое считается пороговым. Положительным считается результат, превышающий 1 относительную единицу. В отличие от ПЦР-анализа, ответы Digene-теста клиники готовят в течение 10 дней.
Если получен результат ниже количественно значимого порога, будет выдан ответ «не обнаружено». Поэтому результаты дайджен-теста и качественного ПЦР-анализа, в котором даже минимальное количество вируса считается положительным результатом, могут быть противоположными. Врачи рекомендуют проходить digene-тест, поскольку при прочих равных он выгоднее в финансовом плане — после получения результатов не придется отдельно проводить количественный анализ. Подготовка к анализам Как уже говорилось, и в ПЦР-анализе, и в дайджин-тесте используется генетический материал. Для его получения необходимо выполнить забор клеток эпителия из урогенитального тракта. Обычно у женщин берут соскоб из цервикального канала, у мужчин — из уретры.
Иногда используется материал из прямой кишки, полости рта — при наличии там новообразований. В отличие от многих других ПЦР-анализов, при исследовании ВПЧ не используют кровь, поскольку вирус в ней практически не обнаруживается. Рекомендации для женщин: Чтобы получить достоверные результаты, женщине рекомендуют сдавать анализ не раньше чем через 5 дней после начала менструального цикла и не позже чем за пять дней до его окончания. Первым днем цикла считается первый день менструации. Оптимальное время сдачи анализа — первая половина цикла; За сутки до проведения исследования и в тот же день исключаются интимные контакты, спринцевания, использование интравагинальных лекарственных и контрацептивных средств; УЗИ органов малого таза с использованием интравагинального датчика, кольпоскопию и соскоб разносят во времени на 3-4 дня. Рекомендации для мужчин: не мочиться за 2-3 часа до соскоба из уретры; отказаться от интимных контактов за 2 суток; общие рекомендации: закончить прием антибиотиков перорально или в виде инъекций за месяц до обследования; прекратить лечение с помощью местных антибактериальных или антисептических средств за 2 недели до обследования; в день обследования не мыть половые органы с использованием антибактериального мыла или геля.
Все это относится к плановой сдаче анализов, но если при обращении к врачу обнаружены патологические изменения, соскоб берут сразу же, без подготовки. Процедура забора материала У женщин клетки эпителия берут на гинекологическом кресле с помощью одноразовой цитологической щеточки, которую вводят в цервикальный канал на 1-1,5 см, несколько раз прокручивают вокруг оси, затем аккуратно вынимают так, чтобы не загрязнить материал вагинальными выделениями. Это безболезненная и быстрая процедура. Мужчине в уретру вводят специальный зонд, всего на 3-4 см, так что болевых ощущений тоже не будет. Затем зонд или щеточку опускают в пробирку с жидкостью, прополаскивают, отжимают о стенки, вынимают. Пробирку закупоривают и отправляют в лабораторию.
Стоимость забора материала в клиниках в среднем составляет 400 руб. Эту сумму прибавляют к сумме за само исследование. Сроки проведения анализов Первично анализ на ВПЧ рекомендуется сдать в следующих ситуациях: при плановом гинекологическом осмотре женщины старше 30 лет если результата будет отрицательным, анализ рекомендуется сдавать каждые три года ; при получении сомнительного цитологического мазка ПАП-теста ; после обнаружения на осмотре остроконечных кондилом, диспластических изменений шейки матки. Если у женщины старше 30 лет анализ на онкогенный штамм ВПЧ положительный, это может означать, что инфекция персистирует, и иммунитет не может уничтожить возбудителя.
Общий анализ ПЦР Анализ может быть упрощенным. Он называется ВПЧ скрининг. В этом случае исследуется ДНК одного или сразу определенной группы штаммов, имеющих высокую онкогенность. Отдельные штаммы при этом не выделяются. Что это значит? При таком анализе будет только положительный или отрицательный результат.
В бланке указывается, какие штаммы исследуются. Например, популярен анализ на выявление 14 штаммов ВПЧ с номерами 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 68, а также скрининг только на два самых опасных — 16 и 18. Результат «обнаружено» в этом анализе расшифровывается как инфицирование одним из вирусов данной группы или несколькими из них, но какими именно, исследование не покажет. Таким образом, скрининг только фиксирует заражение или его отсутствие на данный момент. Он не может показать количество вируса в организме и не может быть основанием для назначения лечения. Присутствие ДНК ВПЧ не означает, что человек болен — это лишь повод для более тщательного наблюдения в дальнейшем и повторной сдачи анализов через год — два. Возможно, через этот срок вирус покинет организм. Кроме единой строчки с перечислением номеров ВПЧ, в таблице на бланке такого анализа будет лишь еще одна строка — КВМ. Эта аббревиатура расшифровывается как «контроль взятия материала». Данный показатель нужен для того, чтобы видеть, правильно ли проведена процедура забора биоматериала, достаточно ли в нем клеток эпителия, чтобы выполнить корректную амплификацию.
Если этот показатель меньше, значит, материал был взят неправильно. В полученном образце слишком мало клеток, и среди них может не оказаться пораженных вирусом. Тогда будет получен ложноотрицательный результат. Дифференцированный анализ ПЦР В данном анализе используется генотипирование — определение специфической последовательности ДНК каждого из исследуемых штаммов в отдельности. Так можно определить, какой конкретно штамм присутствует в организме. Также выполняется оценка КВМ. Читайте также: Это тоже скрининговый метод, только расширенный, более подробный. Он фиксирует лишь факт заражения, но не определяет, стал ли конкретный вид ВПЧ провокатором заболевания. Однако вместе с цитологическим мазком, такой ПЦР-анализ повышает эффективность выявления ассоциированных с ВПЧ заболеваний половых органов. Количественный анализ ПЦР Количественный анализ диагностически более значим, чем качественный, ведь он определяет вирусную нагрузку на организм.
Обычно назначается при положительных результатах качественного теста. Концентрация вируса в тканях отражает тяжесть течения инфекции, позволяет врачу составить прогноз ее течения с учетом клинических симптомов или отследить результативность проведенного лечения. В количественном анализе подсчитывается число копий вируса, приходящихся на число клеток эпителия. Это значит, что вирус для организма неопасен и, скорее всего, иммунная система успешно подавит его. Такой результат у женщины дает основания для беспокойства. Скорее всего, врач назначит кольпоскопию с биопсией, чтобы выяснить, в каком состоянии находится эпителий шейки матки. При лечении заболеваний, ассоциированных с ВПЧ, имеет значение отслеживание вирусной нагрузки в динамике. Если же вирусная нагрузка в контрольных анализах через 3, 6 9, 12 месяцев после лечения на порядок увеличилась — это признак рецидива инфекции. Крем и таблетки: цена, отзывы, аналоги Результаты количественного или качественного анализа обычно готовы уже на следующий день после сдачи.
Чем выше итоговый показатель, тем серьезнее болен человек. Сдать анализ можно в профильном медицинском учреждении Москвы и других городов России. Кому рекомендуется сдавать ПЦР? Полимеразная цепная реакция одно из наиболее точных исследований, позволяющих выявить вирусный гепатит С. Сдавать его стоит следующим группам лиц: людям, у которых наблюдаются характерные для ВГС симптомы; беременным женщинам на любом триместре; больным, регулярно проходящим процедуру диализа; пациентам, недавно пережившим операционное вмешательство; инъекционным наркоманам; посетителям татуажных или маникюрных салонов; медицинским работникам и лаборантам, регулярно контактирующим с инфицированными выделениями; членам семей, в которых проживает зараженный пациент. Следует часто сдавать анализы тем, кто уже проходит терапевтический курс и борется с вирусным гепатитом. Это необходимо для отслеживания эффективности лечения. Как проводится тестирование и как к нему подготовиться? Каждое тестирование требует определенной подготовки, иначе точность результатов будет снижена. Для анализа берут кровь из вены, сдавать следует в утренние часы натощак.
Причем результат будет сохраняться даже в течение нескольких месяцев после того, как возбудитель будет полностью побежден и удален из организма. Что значит отрицательный результат ПЦР Если ПЦР результат отрицательный, значительное число пациентов автоматически считают, что они здоровы. Это практически правильное решение. Ведь если итоги оказались отрицательными, значит фрагменты патогенного микроорганизма не были определены тест-системой. Из этого следует логичный вывод, что микроорганизма в теле нет. Однако стоит учитывать, что несмотря на всю свою высокую чувствительность и специфичность, методика имеет определенный порог чувствительности. Если концентрация возбудителя на момент обследования не переходит границу этого порога, результат будет расцениваться, как отрицательные. Хотя на самом деле окажется ложным до поры до времени. Доктора акцентируют особое внимание на том, что отрицательный результат не всегда означает отсутствие патологии. Кто из докторов выполняет расшифровку результатов ПЦР Часто среди пациентов звучит вопрос о том, какой врач будет проводить расшифровку ПЦР исследования. В первую очередь необходимо запомнить, что доверять результаты стоит тому же медицинскому работнику, что первоначально давал направление на исследование. Связана эта рекомендация с тем, что в этом случае доктор будет представлять себе, что он ожидает увидеть в анализах. Сможет грамотно интерпретировать итоги, соотнося их с клинической картиной. Получить направление наиболее часто можно от уролога, гинеколога или венеролога. Соответственно, после получения итогов относить бланк с результатами стоит кому-то из них. Важно помнить, что ПЦР — довольно дорогой метод диагностики. Его не принято использовать просто так, без специальных показаний к обследованию. Среди них: появление специфических для ЗППП симптомов обследование перед планированием беременности или процедурой искусственного оплодотворения поиск причин бесплодия и другие показания Когда показатели ПЦР становятся положительными после заражения Часто пациенты задают на приеме у медицинского работника вопрос о том, когда результаты ПЦР крови и мазков становятся положительными после заражения. Все зависит от того, насколько быстро конкретная инфекция сможет, размножаясь, пройти пороговую для теста концентрацию в материале. Преимуществом ПЦР является то, что порог чувствительности у теста довольно низкий. Это значит, что выявить признаки заражения можно даже в том случае, если количество возбудителя в биологическом материале будет минимальным. Подобная особенность дает возможность постановки диагноза даже в период инкубации, когда симптомы еще полностью отсутствуют. Однако осечка возможна и при применении ПЦР методики. Это происходит, например, если пороговая концентрация все же не успела достичь определяемых тестом значений. В этом случае велика вероятность получения далеких от правды результатов. Как отмечают доктора, ничего сложного во внешнем виде бумаги нет.