Полимеразная цепная реакция бывает двух типов. Статья автора «РИА Новости» в Дзене: ПЦР-тест — основной метод обнаружения коронавирусной инфекции. Однако в случае с полимеразной цепной реакцией расшифровка результатов ПЦР исследований мало зависит от биологического материала, который брался у пациента.
Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен
Можно ли употреблять алкоголь перед сдачей теста ПЦР и как это повлияет на результат? Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — высокоточный метод диагностики заболеваний, основанный на копировании ДНК или РНК патогена в пробе. ПЦР-тест направлен на определение возбудителя заболевания, а не на реакцию на его проникновение со стороны организма. ПЦР-тест направлен на определение возбудителя заболевания, а не на реакцию на его проникновение со стороны организма.
Антитела к вирусу гепатита С
Если вируса нет, а в ПАП-тесте указано «NILM», тестирования раз в 3 года будет совершенно достаточно. Минимальная вероятность получить ложноотрицательный результат теста на COVID-19 наступает на восьмой день после заражения, или на третий после появления первых симптомов. Как расшифровать ПЦР Как работает ПЦР тест Ответы на эти и другие вопросы читайте в статье на нашем сайте.
Диагностика COVID-19: обзор основных методов
Он — прекрасный рассказчик, его всегда интересно слушать. Видео 1. Однажды он рассказал о ночной встрече со светящимся зеленым енотом в лесу рядом со своим загородным домом. В 1998 году вышла книга Кэри Мюллиса «Танец обнаженного разума» Dancing naked in the mind field , где в обрамлении автобиографических историй ученый высказывает своё мнение о глобальном потеплении, СПИДе и других волнующих общество вопросах. Мюллис верит в астрологию и считает, что значительного изменения климата не происходит, между ВИЧ и СПИДом нет никакой связи, а все исследования, говорящие об обратном, — плоды заговора ученых-карьеристов с правительствами их стран. Компания Cetus подала патентную заявку на метод ПЦР с Taq-полимеразой, и ее одобрили в октябре 1990 года. Журнал Science объявил Taq-полимеразу молекулой года, а статья сотрудников Cetus о ПЦР с ее использованием [15] несколько лет поддерживала статус самой цитируемой биологической публикации [16]. В августе химический гигант DuPont подал против Cetus иск, в котором утверждал, что патенты на ПЦР получены неправомерно, поскольку этот процесс еще в 1970-х описал Хьелль Клеппе.
Но через год объявило, что они останутся действительными: комиссия нашла метод, описанный в работе Клеппе, слишком «неопределенным и сомнительным». К тому же там не упоминалась возможность экспоненциальной репликации — отличительной черты ПЦР. В суде представители DuPont так и не смогли доказать вторичность изобретения Мюллиса. С этой сделки Cetus выплатила Кэри Мюллису неоправданно малую сумму, фактически ограбив его. Принцип метода Все мы знаем, что ДНК — это двухцепочечная молекула, где каждая цепочка состоит из звеньев-нуклеотидов. Нуклеотиды составлены из трех молекул: остатка фосфорной кислоты, сахара и азотистого основания. Если сахар и фосфат одинаковы у всех нуклеотидов в ДНК в РНК сахар другой , то азотистых оснований четыре если не считать редкие модификации : аденин, тимин, цитозин и гуанин, обозначаемые А, Т, Ц и Г соответственно.
В молекулах РНК тимин заменен урацилом. Нуклеотиды соединяются в цепочку, образуя связи между фосфатной группой одного нуклеотида и гидроксильной — другого. Чтобы молекула была стабильной, цепочки должны как-то взаимодействовать друг с другом. Это обеспечивают водородные связи , образующиеся между азотистыми основаниями противоположных цепей по принципу комплементарности : А соединяется только с Т или У в РНК , а Г — с Ц рис. И поэтому, имея одну цепь ДНК, в соответствии с этим правилом легко построить ее пару. Собственно, на этом и основана ПЦР. Рисунок 5.
Строение ДНК. Видео 2. Типичная реакционная смесь Анализируемая ДНК. Это может быть как отдельный кусочек молекулы, так и плазмида, хромосома или геном клетки полностью. Для грубой оценки сойдет даже суспензия клеток. ДНК служит матрицей для многократного копирования нужного участка. Праймер — это искусственно синтезированная короткая цепочка нуклеотидов 15—30 штук , комплементарная выбранному участку одной из цепей анализируемой ДНК.
Один из праймеров обычно соответствует началу амплифицируемого отрезка, другой — его концу, но на противоположной цепи. Фермент, строящий комплементарную матричной цепь ДНК. Обычно используют термостабильные полимеразы, изначально выделенные из термофильных бактерий и архей: Thermus aquaticus Taq-полимераза , Pyrococcus furiosus Pfu-полимераза и Pyrococcus woesei Pwo-полимераза. Первая — самая производительная, а две другие — более точные. Раствор, содержащий различные ионы для поддержания нужного рН, соли магния, необходимые для работы полимеразы, и неионный детергент Tween-20 в сочетании с BSA бычьим сывороточным альбумином для предотвращения налипания компонентов реакции на стенки пробирки.
Помещение, где делают анализ, обязательно должно быть оснащено фильтром биологической очистки, так как в воздухе постоянно присутствуют частицы кожи, слюны, содержащие в своем составе молекулы ДНК. Несоблюдение техники работы с биоматериалами может стать причиной неверного результата.
Анализ крови — расшифровка у взрослых ПЦР Трактовка результатов этого исследования не представляет сложностей, потому что отсутствует таблица норм анализа крови на ПЦР. В бланке результатов могут фигурировать лишь две фразы: отрицательный результат — возбудитель, на который проводился анализ, не выявлен; положительный результат — в организме имеется возбудитель указанного заболевания. Следует знать, что ПЦР может быть положительной даже при отсутствии клинических симптомов заболевания! Расшифровка анализа крови на ПЦР у детей не отличается от таковой у взрослых. Кому нужно сдать анализ на ПЦР Любой человек может сдать кровь для исследования. Прямым показанием для исследования является подозрение на инфекции передающиеся половым путем хламидиоз , гарднереллез, ВИЧ-инфекция.
К неспецифической реакции с тест- системой могут привести процессы, связанные с воспалением в организме: острые и хронические воспалительные процессы, аутоиммунные заболевания, проблемы с щитовидной железой, беременность и так далее. Это называется "ложноположительный" результат. При стандартном инфекционном заболевании в том числе и при коронавирусной инфекции обычно антитела IgM через месяц исчезают, заменяясь на более специфичные антитела IgG. Однако учёные выяснили, что при коронавирусе IgM могут сохраняться длительное время до 1,5-3 месяцев от появления симптомов, когда уже сам вирус давно не обнаруживается.
Иммуноглобулины А IgA также вырабатываются в острый период инфекции. Их основная цель — защитить слизистые оболочки от коронавируса. IgA более избирательны специфичны , вырабатываются строго на коронавирус. Их уровень снижается после выздоровления, примерно к 1,5- 2 месяцам после инфицирования. Иммуноглобулины G IgG синтезируются последними, через 5-6 недель с момента попадания вируса в организм, и сохраняют информацию о коронавирусе. Обычно IgG являются архивом памяти перенесеных инфекций, в большинстве случаев пожизненно, либо на несколько лет. Механизмы развития иммунной реакции на коронавирус пока изучаются. Неясно, стойкий иммунитет формируется или нет. Это предстоит узнать. Но в любом случае, выявление IgG свидетельствует о факте попадания коронавируса в организм и иммунном ответе организма.
Кому показаны тесты на определение антител к новой коронавирусной инфекции - Тем, кто хочет узнать, перенес он инфекцию или нет независимо от того, были признаки простуды или не было.
При сдаче анализа по мазку из ротоглотки необходимо выдержать интервал с приемом пищи и воды в 3-4 часа перед тестом. Перед анализом на венерические инфекции необходимо воздержаться от половой активности в течение суток. Перед анализом нельзя использовать никакие противовирусные препараты. Подробную инструкцию по правилам подготовки к каждому анализу вы всегда можете получить у лечащего врача или у консультантов на нашей горячей линии.
Как проводится ПЦР-анализ С 1983 года, когда был изобретен данный метод, прошло много времени, и технологии не стоят на месте. Сегодня существует несколько различных методик для проведения ПЦР-теста: С обратной транскрипцией. Самый распространенный способ идентификации известной последовательности РНК, включающий амплификацию, определение патогена и его идентификации среди образцов, хранящихся в научной картотеке. Вложенная ПЦР или «гнездовая» — используется для снижения количества неспецифичных продуктов реакции и имеет две стадии с использованием двух видов праймеров. Изотермические методы — не требуют повторяющихся температурных циклов, менее энергозатратны.
Инвертированная ПЦР — применяется, если имеется только короткий фрагмент известной последовательности, но необходимо определить соседние последовательности после вставки ДНК в геном. ПЦР в реальном времени — метод, позволяющий определить не только присутствие целевой нуклеотидной последовательности в образце, но и измерять количество ее копий после каждого цикла амплификации, что дает возможность для проведения тестов с количественным результатом Это далеко не все существующие на сегодняшний день разновидности ПЦР-технологий. Ученые активно развивают эту важную и перспективную область лабораторной диагностики, совершенствуют методы ПЦР, оттачивают техники и изобретают новые подходы. Иногда возможно проведение экстренного теста — его часто используют при оказании срочной медицинской помощи при госпитализации. Тогда срок готовности результата сокращается до считанных часов.
Результаты ПЦР-теста дадут точную информацию о том, какая инфекция была обнаружена. При количественном тестировании анализ определит также вирусную или бактериальную нагрузку на организм. В этом случае в результатах будет значиться титр обнаруженного патогена его количество в одном миллилитре пробы.
Диагностика COVID-19: обзор основных методов
ПЦР (полимеразная цепная реакция) — это метод тестирования, который способен находить генетический материал вируса непосредственно в крови пациента, слюне или любой другой жидкости, изобретенный в 1983 году американским биохимиком Кэрри Муллисом. ПЦР анализ на инфекции Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – высокоточный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет выявить у человека различные инфекционные и наследственные заболевания, как в острой и хронической стадии. ПЦР или полимеразная цепная реакция — на сегодняшний день самый точный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет узнать, присутствует ли в вашем организме вирус COVID-19. ПЦР или полимеразная цепная реакция — на сегодняшний день самый точный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет узнать, присутствует ли в вашем организме вирус COVID-19.
Анализ ПЦР на гепатит С
Но существует ещё количественный анализ, или ПЦР в режиме реального времени. Метод основывается на том, что число новых ампликонов копий заданного участка ДНК возбудителя болезни прямо пропорционально их исходному количеству. То есть если в пробе с самого начала было много вредоносных молекул ДНК, то с каждым циклом полимеразной цепной реакции их будет становиться вдвое больше, а к концу процесса накопятся миллионы. Современные приборы амплификаторы следят за тем, как меняется количество копий, и по итогам исследования вычисляют примерную концентрацию возбудителя в организме пациента. Для чего это нужно? В случае с бактериями, простейшими или грибками подобные сведения имеют спорную диагностическую ценность, поскольку численность колоний постоянно меняется под воздействием самых разных факторов, да и уничтожить такие микроорганизмы сравнительно просто.
Другое дело — вирус. Это неклеточная форма жизни, которую невозможно истребить подобно тому, как антибиотики справляются с бактериями. В борьбе с вирусами человек может твёрдо рассчитывать только на свой иммунитет, а возможности противовирусных средств сильно ограничены. Именно когда дело касается вирусов, становится особенно актуальной методика ПЦР в режиме реального времени. Вирусная нагрузка или виремия — это степень тяжести поражения организма вирусом.
Показатель рассчитывается путём определения числа вирионов в биологическом материале, измеряется в МЕ или в количестве копий на 1 мл крови и служит для контроля над ходом терапии и предупреждения распространения вируса. Но и в случае с другими вирусами определение нагрузки может оказаться полезным — например, когда речь идёт о цитомегаловирусе, герпесе или папилломовирусе. Анализ поможет понять, грозит ли человеку очередное обострение болезни, и насколько высока вероятность передачи инфекции. ВИЧ-инфицированным людям назначается антиретровирусная терапия. Её цель — максимально снизить вирусную нагрузку, а в идеале — сделать её неопределяемой.
Но даже в этом случае существует риск заразить своего полового партнёра или партнёршу, поэтому не следует пренебрегать использованием презервативов.
Его недостатком является то, что исследование только дает информацию о присутствии антител , но не уточняет их количество. Биохимический анализ крови При начавшихся изменениях в печени в крови больного будет повышен уровень билирубина, щелочной фосфатазы и снижен уровень печеночных ферментов. Но на начальной стадии показатели будут находиться в пределах нормы. ПЦР полимеразная цепная реакция С ее помощью восстанавливают ДНК вируса, подсчитывают количественные показатели антител, уточняют стадию заболевания. То есть разное количество антител может свидетельствовать об остром этапе или о постпрививочном иммунитете. Муллис получил Нобелевскую премию, и до сих пор применяется его метод диагностики Родоначальником метода ПЦР полимеразной цепной реакции считается ученый из Норвегии Х.
Он первый стал проводить амплификацию восстановление ДНК при помощи короткой цепочки ДНК, то есть синтетического праймера своеобразной копии. Однако, ученому не удалось реализовать свою идею. Похожие исследования сделал американский химик К. Муллис, который в 1993 был удостоен Нобелевской премии за свое изобретение. С тех пор ПЦР используют для установления отцовства, диагностики генетических болезней, обнаружения вирусов. Суть реакции в том, что при помощи ферментов копируется определенный участок ДНК. Скопировать можно только участок, который соответствует заданным параметрам и если он есть в представленном образце.
Для запуска реакции применяют следующие компоненты: Матричная ДНК с участком, подлежащим копированию. Праймеры, схожие по строению участку ДНК. Полимераза, то есть фермент, запускающий реакцию. Она должна быть термостабильной, то есть выдерживать перепады температур. Раствор с определенными параметрами, обеспечивающий прохождение реакции. Реакция проводится в несколько этапов: Денатурация прогревание Сначала раствор нагревают, в результате чего цепочки ДНК расходятся. Стадия отжига Раствор остужают, праймеры связываются с одноцепочечной матрицей.
Нередко встречается и ложноположительные результаты ПЦР сразу после лечения. Когда разрушенные участки генетического материала уже погибшего возбудителя еще сохраняются в крови или биологических средах. Результат становится отрицательным по истечении шести-девяти месяцев после терапии. Какой врач проводит расшифровку ПЦР-исследований Первично назначается анализ либо венерологом, либо урологом, либо гинекологом для женщин. Оценка анализа и выставление результатов в бланке ответа — это функция врача-лаборанта, проводившего исследование. Дальнейшая интерпретация полученных данных — это функционал узкого специалиста, к которому обращается пациент. Врач назначает такие исследования обычно при: признаках острого воспаления урогенитального тракта, для уточнения причины воспаления, перед планируемой беременностью или эко, у беременных с отягощенной акушерской историей, для контроля эффекта от проводимого лечения по поводу вензаболевания не раньше, чем спустя месяц после окончания терапии , в качестве скрининга для исключения бессимптомного течения инфекции при наличии более одного партнера за год. Методы молекулярной биологии имеют важное от культуральных или серологических методик отличие.
Они не требуют определенного накопления возбудителя или антител к нему и чувствительны практически сразу от момента заражения. Нет смысла выдерживать паузу в течение предполагаемого инкубационного периода венерической инфекции.
Если в процессе лечения количество вируса уменьшается, то терапия эффективна. В случае увеличения вирусной нагрузки через несколько месяцев после лечения можно думать о рецидиве. Генотипирование уточняет прогноз, возможность развития онкологии. Самыми высокоонкогенными вирусами являются несущие генетический код 16 и 18. При их обнаружении показана срочная кольпоскопия. Низкий риск формирования злокачественной опухоли у генотипов 6, 11 и 44. По выявленному генотипу определяют, произошло сейчас новое заражение или активировался уже имеющийся вирус.
Следует знать, что наличие вируса высокого онкогенного типа не означает обязательное формирование рака. Что может влиять на результат Результат может быть неправильным и малоинформативным, если не выполнены условия подготовки к сдаче анализа. Также необходим правильный забор биоматериала. Выводы Определение в генитальном мазке вируса папилломы человека ВПЧ имеет важное диагностическое и прогностическое для здоровья женщины значение. Тест проводится методом полимеразной цепной реакции качественно и количественно. Анализ позволяет определить генотип вируса, а значит, рассчитать прогноз заболевания. Перед проведением его делается контроль взятия материала КВМ. При показателях менее 4 возможно получение некорректных данных, поэтому необходим повторный забор материала.
ПЦР-тестирование: как работает метод ПЦР в диагностике
| Цепная реакция. Как работают тесты на коронавирус? | Тест на антитела ИФА (ИХЛА) считается более сложным и более точным, чем ПЦР-тест. |
| HCV, РНК [реал-тайм ПЦР] | Маркеры гепатита С. Анализы методом ПЦР и ИФА для выявления в крови вируса гепатита С. |
| Чем отличается ПЦР от антител на КОВИД тест? | Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR) — это точный метод лабораторной диагностики, который используют для выявления возбудителей инфекционных заболеваний. |
| Расшифровать анализ ПЦР онлайн - Вопрос гинекологу - 03 Онлайн | по Менеджменту антикоагулянтной терапии, утвержденное Министерством Здравоохранения РМ, рекомендует для оценки рисков венозных тромбоэмболий использовать тесты на Д-Димеры со специфичностью не менее 75. |
| ПЦР-диагностика на гепатит С: когда нужны анализы и что они показывают? | Полимеразную цепную реакцию (ПЦР, PCR) изобрёл в 1983 году Кэри Мюллис (американский учёный). |
Анализ ПЦР на гепатит С
Конечно, в наше время существуют уже и так называемые «пангенотипические» схемы, которые эффективны против всех генотипов вируса. Однако в случае, если генотип вируса известен, количество схем, из которых можно выбирать наиболее подходящую каждому конкретному пациенту с учетом сопутствующих заболеваний и других лекарственных препаратов, которые тот принимает , существенно расширяется. Также данный результат дает дополнительную информацию при дальнейшем наблюдении за пациентом. В случае, если после проведенного курса терапии вновь выявляется вирус, можно с большей вероятностью выяснить, является ли это неудачей лечения или повторным заражением. Именно поэтому в современных рекомендациях по лечению гепатита С — как в Европе, так и в Америке рекомендуется проводить генотипирование до начала терапии. Как уже упоминалось, анализ на anti HCV антитела к вирусу гепатита С в этом случае, наиболее вероятно, будет сохраняться положительным, и значит, не несет никакой ценной информации для врача. Критерием же полного излечения является отсутствие вируса в крови через 12 недель после проведенного курса терапии.
Хотелось бы отметить, что, если у вас в крови обнаружены антитела к гепатиту С, даже в случае абсолютно нормального самочувствия, необходимо обратиться к врачу для дообследования. Вялотекущее воспаление в печени рано или поздно приводит к перестройке ее ткани, ухудшению функции и, в конце концов, к развитию цирроза.
Как же все-таки интерпретировать результаты? АльфаМед расскажет Вам, что означают те или иные показатели и поможет разобраться! ПЦР-тест необходимо сдавать для установления факта заболевания коронавирусом. Этот вариант диагностики позволяет обнаружить вирус на его начальной стадии, даже если у пациента еще нет признаков и симптомов болезни. Антитела, в свою очередь, это ответная реакция организма на коронавирус. Результат теста на антитела IgG и IgM позволяет понять, на какой именно фазе заболевания находится пациент, а также помогает определить, была ли перенесена инфекция в прошлом. Если Вы хотите максимально точно определить болеете ли Вы, на какой стадии заболевания находитесь или же понять, было ли заболевание в прошлом, то лучшим вариантом будет сдача не только ПЦР-теста, но и теста на антитела.
Токарев отметил, что иногда люди бывают сверхраспространителями вируса. В таком случае ПЦР-тест всегда даст положительный результат. Ранее Дмитрий Медведев заявил, что в плане регламентирования коронавирусных ограничений и ответственности за их нарушение российское законодательство остается очень либеральным.
Обычно тот или иной тип анализа рекомендует лечащий врач, потому что именно он оценивает полученные результаты, одновременно учитывая клинические проявления и индивидуальный анамнез пациента. Общий анализ ПЦР Анализ может быть упрощенным. Он называется ВПЧ скрининг. В этом случае исследуется ДНК одного или сразу определенной группы штаммов, имеющих высокую онкогенность. Отдельные штаммы при этом не выделяются. Что это значит? При таком анализе будет только положительный или отрицательный результат. В бланке указывается, какие штаммы исследуются. Например, популярен анализ на выявление 14 штаммов ВПЧ с номерами 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 68, а также скрининг только на два самых опасных — 16 и 18. Результат «обнаружено» в этом анализе расшифровывается как инфицирование одним из вирусов данной группы или несколькими из них, но какими именно, исследование не покажет. Таким образом, скрининг только фиксирует заражение или его отсутствие на данный момент. Он не может показать количество вируса в организме и не может быть основанием для назначения лечения. Присутствие ДНК ВПЧ не означает, что человек болен — это лишь повод для более тщательного наблюдения в дальнейшем и повторной сдачи анализов через год — два. Возможно, через этот срок вирус покинет организм. Кроме единой строчки с перечислением номеров ВПЧ, в таблице на бланке такого анализа будет лишь еще одна строка — КВМ. Эта аббревиатура расшифровывается как «контроль взятия материала». Данный показатель нужен для того, чтобы видеть, правильно ли проведена процедура забора биоматериала, достаточно ли в нем клеток эпителия, чтобы выполнить корректную амплификацию. Если этот показатель меньше, значит, материал был взят неправильно. В полученном образце слишком мало клеток, и среди них может не оказаться пораженных вирусом. Тогда будет получен ложноотрицательный результат. Дифференцированный анализ ПЦР В данном анализе используется генотипирование — определение специфической последовательности ДНК каждого из исследуемых штаммов в отдельности. Так можно определить, какой конкретно штамм присутствует в организме. Также выполняется оценка КВМ. Читайте также: Это тоже скрининговый метод, только расширенный, более подробный. Он фиксирует лишь факт заражения, но не определяет, стал ли конкретный вид ВПЧ провокатором заболевания. Однако вместе с цитологическим мазком, такой ПЦР-анализ повышает эффективность выявления ассоциированных с ВПЧ заболеваний половых органов. Количественный анализ ПЦР Количественный анализ диагностически более значим, чем качественный, ведь он определяет вирусную нагрузку на организм. Обычно назначается при положительных результатах качественного теста. Концентрация вируса в тканях отражает тяжесть течения инфекции, позволяет врачу составить прогноз ее течения с учетом клинических симптомов или отследить результативность проведенного лечения. В количественном анализе подсчитывается число копий вируса, приходящихся на число клеток эпителия. Это значит, что вирус для организма неопасен и, скорее всего, иммунная система успешно подавит его. Такой результат у женщины дает основания для беспокойства. Скорее всего, врач назначит кольпоскопию с биопсией, чтобы выяснить, в каком состоянии находится эпителий шейки матки. При лечении заболеваний, ассоциированных с ВПЧ, имеет значение отслеживание вирусной нагрузки в динамике. Если же вирусная нагрузка в контрольных анализах через 3, 6 9, 12 месяцев после лечения на порядок увеличилась — это признак рецидива инфекции.
Статьи по теме
- Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
- Что представляет собой ПЦР
- ПЦР: сверхчувствительная диагностика инфекций
- «Вероятность обнаружить вирус снижается». Когда нужно сдавать ПЦР-тест
- История метода
- Антитела к коронавирусу: как правильно прочитать результаты исследований | Комиинформ
Подготовка к исследованию
- ПЦР: сверхчувствительная диагностика инфекций
- ПЦР-15: описание, интерпретация результата, референсные значение
- Анализы на ВПЧ. Что это такое и как его берут
- О рекомендациях, как подготовиться к сдаче ПЦР-теста на COVID-19 - Все новости - МЧС России